These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6887#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 930 fasta sequence [ATCATCTTCATCTTTACCGGTACCATCAGGGTCATGCTTGTCTGATAATCAAATACACCAATCATTGGTAGCACCAGTATCACTTCATAAGATGCTTGAACAAACTGAATGCTCTTCTAATTCAGAAATTATATCAAAAAATGATAATGATAGTTTGAGCATAATAAAATCCGCTTTATGTGAGGAAAGTGCTATCAATAAGGGTGGTTGTAGTGATACAAGCCTTGTATCTCATCAAGCGCTCATTTCTACTCATGATAGTATCAATACAACTAATGCCAATGTTAATGATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGAATCACCAACCTCCTGATCCTACTGCATGTTTCTATGAAATTCAAAATTCCTGTGGTCTAGACAATGTTAATGATTAGTAAATATCACTAAAAGCAATTGTTTTATCCATATTTATCAATGCTAATTATTGTCATTAATTCGATTTCTTTACAACAGACCATTTATTCCATATTTATATTTTATTCGTTT-AATATCTTGNTGTCGTTACTTTTCACACATTATGCTTTGCATTTTNCGGATTTGC] [+] EMBL BF936366 [ATCATCTTCATCTTTACCGGTACCATCAGGGTCATGCTTGTCTGATAATCAAATACACCAATCATTGGTAGCACCAGTATCACTTCATAAGATGCTTGAACAAACTGAATGCTCTTCTAATTCAGAAATTATATCAAAAAATGATAATGATAGTTTGAGCATAATAAAATCCGCTTTATGTGAGGAAAGTGCTATCAATAAGGGTGGTTGTAGTGATACAAGCCTTGTATCTCATCAAGCGCTCATTTCTACTCATGATAGTATCAATACAACTAATGCCAATGTTAATGATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGGATCACCAACCTTCTGAT ] [+] EMBL AI976309 [ATCATCTTCATCTTTACCGGTACCATCAGGGTCATGCTTGTCTGATAATCAAATACACCAATCATTGGTAGCACCAGTATCACTTCATAAGATGCTTGAACAAACTGAATGCTCTTCTAATTCAGAAATTATATCAAAAAATGATAATGATAGTTTGAGCATAATAAAATCCGCTTTATGTGAGGAAAGTGCTATCAATAAGGGTGGTTGTAGTGATACAAGCCTTGTATCTCATCAAGCGCTCATTTCTACTCATGATAGTATCAATACAACTAATGCCAATGTTAATGATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTG ] [+] EMBL CD078774 [ ATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGAATCACCAACCTCCTGATCCTACTGCATGTTTCTATGAAATTCAAAATTCCTGTGGTCTAGACAATGTTAATGATTAGTAAATATCACTAAAAGCAATTGTTTTATCCATATTTATCAATGCTAATTATTGTCATTAATTCGATTTCTTTACAACAGACCATTTATTCCATATTTATATTTTATTCGTTT AATATCTTGNTGTCGTTACTTTTCACACATTATGCTTTGCATTTTNCGGAT ] [+] EMBL CD078555 [ AATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGAATCACCAACCTCCTGATCCTACTGCATGTTTCTATGAAATTCAAAATTCCTGTGGTCTAGACAATGTTAATGATTAGTAAATATCACTAAAAGCAATTGTTTTATCCATATTTATCAATGCTAATTATTGTCATTAATTCGATTTCTTTACAACAGACCATTTATTCCATATTTATATTTTATTCGTTTAAATATCTTGTTGTCGTTACTTTTCACACATTATGCTNTGCATTNTCCGGATTTGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||