These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6892#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 631 fasta sequence [CTTGCTCTTGTCTATCAAGTGGTGGGTGAACGTTGTTTTTTTCTTCATGCCACGCCTTATTTTACTCTTCTTATGCTCGCTCCCTTTCTTATTGTTTCAAACCTACGGGTACTATTTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGGTTTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAACACGTATGATCTTTTCATCCTGTCCTATTATCTACTGGTATTGNGCTTATCTTCTTTGTGAAAACG-TGCCTAATTTCGAGCCA] [+] EMBL CD078842 [CTTGCTCTTGTCTATCAAGTGGTGGGTGAACGTTGTTTTTTTCTTCATGCCACGCCTTATTTTACTCTTCTTATGCTCGCTCCCTTTCTTATTGTTTCAAACCTACGGGTACTATTTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGGTTTCTCAATACCAGGTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGATTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCATCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGATACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGATTCTGTGCT ] [+] EMBL CD082749 [ GTGGTGGGTGAACGTTGTTTTTTTCTTCATGCCACGCCTTATTTTACTCTTCTTATGCTCGCTCCCTTTCTTATTGTTTCAAACCTACGGGTACTATTTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGG TTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAACACGTATGATCTTTTCATCCTGTCCTATTATCTACTGGTATTGNGCTTATCTTCTTTGTGAAAACG TGCCTAATTTCGAGCCA] [+] EMBL CD083609 [ gaggATTGTTTCAAACCTACGGGTACTA TTGTATTGTTCTCACGCGCGATCGTTTCACACCATATTTCCATCAAAAATTCCTGTACCACTGCTTAACTATGGTCTGGATCATGGTTTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAACACGTATGATCTTTTCATCCTGTCCTATTATCTACTGGTATTGTGCTTATCTTCTTTGTG AAACGTTGCCTt ] [-] EMBL CD179051 [ ATGGTTTCTCAATACCAGTTCGCCTTACAAACGAATCTAGTTCTCCGCATTTACCAGTTTGGTGTTCGTTTGCACCACCATTCTCATATTCCCACATCCAAAAGAGTCAGTGGGATGTCGGATTGTGGGGATATTACCAGCTACGGCAAATTCCAAATTTTATTTTGTCCTTACCTGTTGTTACTTTATGCTTTATATGTGCGATTACGTTTTACCGAAGAGCCCCAAAAGCATATAGAACATTTGGGCTATATGCAGAATGCGAAATGGACCGTATCATGGTGCCGTATGTATTCCATATGCTGTTTCTGTGCTCTTACGGGGTTCTTCACATAAACGTTCAAGTGTTAAC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||