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Schistosoma mansoni
cluster # 6895 cluster # 6895       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6895#0 length = 813 sequences # 4  

consensusID : consensus_6895#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 813
fasta sequence
                              [GATATTCGTATTTCAGCATGTGTATACAAATGTGATACTATCTCTGCTGAAGTGGGAATGTGCAGAAGTATATGTAATTTCAGTATCACTTCCGTAGGTGTTTAGTTTACTGCTTCACTATTTACATTTTAAAATTTTGTCTTATATATTAAATCACTTCGACTACCTCAAGTCATTATTAACATGTGCGATTTTTCCTAACATCTAAGCCAACTTTTAGCTAATCAAAATCACTAGGAATTCCGTTTATTGTGTAAAAAATTACCAAATATTCTAGCGTTTTTCGCCTTGTTTGATTTTAATCATTTTAGACAGTTTCCCTCCGTCTTTATGTATTAGTTTCTTGGTGATTGAATAAAAAAGATATCTTCTGTTTATGTAATAAAAGTTTTTCCAGCATCCAGATGATACATTTTGTCCTAATAACTTCTTGAAACTTGTTAGTTCTCTCTGGTTTTGTCTTCATTGTATTCAGTTTGCAGAGCACGTAGAACTAAAAAAACTTGACTTGTTCTTTGGCTTGACAGACATGTGCATAATATATATTAAGTAATTGCATATAATTACAGAGTTTCATGTACGCGGGATCAAAATCATCTTGCAGTGATAAATACAACTGTATTTTGTTGTCTTTATGGACACATAAACCAAAGATGAACTTGAATCAGCTTACTTAAAGTTGCGCTATGATAAAAATACTTTGATTTGTGTTTGATATGTGCAGAGAATTCCAATGTGTTTACATTATGAAATATAGTAAAGTAGTCAGAAGCTTTTAGTTTAAGCCTTTTAAAACGCTAATTTCTTTNCATT]

[+] EMBL CD091138             [GATATTCGTATTTCAGCATGTGTATACAAATGTGATACTATCTCTGCTGAAGTGGGAATGTGCAGAAGTATATGTAATTTCAGTATCACTTCCGTAGGTGTTTAGTTTACTGCTTCACTATTTACATTTTAAAATTTTGTCTTATATATTAAATCACTTCGACTACCTCAAGTCATTATTAACATGTGCGATTTTTCCTAACATCTAAGCCAACTTTTAGCTAATCAAAATCACTAGGAATTCCGTTTATTGTGTAAAAAATTACCAAATATTCTAGCGTTTTTCGCCTTGTTTGATTTTAATCATTTTAGACAGTTTCCCTCCGTCTTTATGTATTAGTTTCTTGGTGATTGAATAAAAAAGATATCTTCTGTTTATGTAATAAAAGTTTTTCCAGCATCCAGATGATACATTTTGTCCTAATAACTTCTTGAAACTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD091184             [GATATTCGTATTTCAGCATGTGTATACAAATGTGATACTATCTCTGCTGAAGTGGGAATGTGCAGAAGTATATGTAATTTCAGTATCACTTCCGTAGGTGTTTAGTTTACTGCTTCACTATTTACATTTTAAAATTTTGTCTTATATATTAAATCACTTCGACTACCTCAAGTCATTATTAACATGTGCGATTTTTCCTAACATCTAAGCCAACTTTTAGCTAATCAAAATCACTAGGAATTCCGTTTATTGTGTAAAAAATTACCAAATATTCTAGCGTTTTTCGCCTTGTTTGATTTTAATCATTTTAGACAGTTTCCCTCCGTCTTTATGTATTAGTTTCTTGGTGATTGAATAAAAAAGATATCTTCTGTTTATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD079124             [                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTACCAAATATTCTAGCGTTTTTCGCCTTGTTTGATTTTAATCATTTTAGACAGTTTCCCTCCGTCTTTATGTATTAGTTTCTTGGTGATTGAATAAAAAAGATATCTTCTGTTTATGTAATAAAAGTTTTTCCAGCATCCAGATGATACATTTTGTCCTAATAACTTCTTGAAACTTGTTAGTTCTCTCTGGTTTTGTCTTCATTGTATTCAGTTTGCAGAGCACGTAGAACTAAAAAAACTTGACTTGTTCTTTGGCTTGACAGACATGTGCATAATATATATTAAGTAATTGCATATAATTACAGAGTTTCATGTACGCGGGATCAAAATCATCTTGCAGTGATAAATACAACTGTATTTTGTTGTCTTTATGGACACATAAACCAAAGATGAACTTGAATCAGCTTACTTAAAGTTGCGCTATGATAAAAATACTTTGATTTGTGTTTGATATGTGCAGAGAATTCCAATGTGTTTACATTATGAAATATAGTAAAGTAGTCAGAAGCTTTTAGTTTAAGCCTTTTAAAACGCTAATTTCTTTNCATT]
[-] EMBL CD091197             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCTTCTGTTTATGTAATAAAAGTTTTTCCAGCATCCAGATGATACATTTTGTCCTAATAACTTCTTGAAACTTGTTAGTTCTCTCTGGTTTTGTCTTCATTGTATCCAGTTTGCAGAGCACGTAGAACTAAAAAAACTTGACTTGTTCTTTGGCTTGACAGACATGTGCATAATATATATTAAGTAATTGCATATAATTACAGAGTTTCATGTACGCGGGATCAAAATCATCTTGCAGTGATAAATACAACTGTATTTTGTTGTCTTTATGGACACATAAACCAAAGATGAACTTGAATCAGCTTACTTAAAGTTGCGCTATGATAAAAATACTTTGACTTGTGTTTGATATGTGCAGAGAATTCCAATGTGTTTACATTATGAAATATAGTAAAGTAGTCAGAAGCT                                       ]


>consensus_6895#0 GATATTCGTATTTCAGCATGTGTATACAAATGTGATACTATCTCTGCTGAAGTGGGAATG TGCAGAAGTATATGTAATTTCAGTATCACTTCCGTAGGTGTTTAGTTTACTGCTTCACTA TTTACATTTTAAAATTTTGTCTTATATATTAAATCACTTCGACTACCTCAAGTCATTATT AACATGTGCGATTTTTCCTAACATCTAAGCCAACTTTTAGCTAATCAAAATCACTAGGAA TTCCGTTTATTGTGTAAAAAATTACCAAATATTCTAGCGTTTTTCGCCTTGTTTGATTTT AATCATTTTAGACAGTTTCCCTCCGTCTTTATGTATTAGTTTCTTGGTGATTGAATAAAA AAGATATCTTCTGTTTATGTAATAAAAGTTTTTCCAGCATCCAGATGATACATTTTGTCC TAATAACTTCTTGAAACTTGTTAGTTCTCTCTGGTTTTGTCTTCATTGTATTCAGTTTGC AGAGCACGTAGAACTAAAAAAACTTGACTTGTTCTTTGGCTTGACAGACATGTGCATAAT ATATATTAAGTAATTGCATATAATTACAGAGTTTCATGTACGCGGGATCAAAATCATCTT GCAGTGATAAATACAACTGTATTTTGTTGTCTTTATGGACACATAAACCAAAGATGAACT TGAATCAGCTTACTTAAAGTTGCGCTATGATAAAAATACTTTGATTTGTGTTTGATATGT GCAGAGAATTCCAATGTGTTTACATTATGAAATATAGTAAAGTAGTCAGAAGCTTTTAGT TTAAGCCTTTTAAAACGCTAATTTCTTTNCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)