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Schistosoma mansoni
cluster # 69 cluster # 69       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_69#0 length = 7082 sequences # 2  

consensusID : consensus_69#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 7082
fasta sequence
                              [GGGTTGGAAAGCCTGATCTCATTAGGACAGTGCTCAATTTAGGATCAGAAACTTTTTTTTCTTGAAAAAAGGAACAAGATATTCAGTCTAACAGATGGAGCTAAAAATACATATGGAATGTTAATTCTTGGAAGAGTGCACAATTTTATCTGTTATCAAATAATAGGATATTTTAACTCTTGGAATATATATTTCTATCGTTTAAAGATTGTATTCTTTAATACAAGCATCCATGTTTATCAGTTTTGTATATTTTCAAGATGATACTACAATATTTCATATTGAAACCTGAGAAGAAAATGTTATTTTCTTCTAGGAACGTAAAATTAACTGATAGTTCCATTAATTTAATCTTCAACAAATGAACTACATTATATAAACTATTTATTAGAAAATTGTACTGGTGATATATATGTAATTTTAAAACTATTTGATAATGATATCAACCAGTGATTCGATAACTAATCAAGATATTAATAATCATCCTATAAATGTACAAAATAAACGATCAGATATTGATCAAAGATTAAATCGTGATCCTAAATATGAAACAATTAATCAATTAGCTAAAGATACATTGAATATTGAATTACCAGAATCACAAAGTTCAACAAATCGTGCACTTTTTGTTTTTTCAAAAAATAATTTAATACGTAAAGCAGCACGTAACATAATTGAATGGGGACCATTTGAATATATGGTTCTATCAACTATCATAGCTAATTGTGTTGTCCTAGCAATGGAAGTTCATTTGCCAAATAAAGATAAACGTCCATTATCTGAAAAATTGGAAATCACTGAAAACTACTTTTTGGGAATTTTTACCTGTGAAGCTTTCTTGAAAATTATTGCATTAGGATTTATTCTGCACAGTGGATCTTATTTAAGAAATATATGGAATATTTTAGATTTCGTTGTTGTAGTCACTGGATTTCTTACAATGTTCATGACCAGTGGAAGTGGAGTGAATTTACGAACACTTCGAGCTGTACGTGTACTGCGTCCTCTCAAATTAGTATCAGGTGTACCAAGTCTCCAAGTAGTTTTAACATCGATTATCAAAGCAATGGCACCATTATTACAAATTGGAATATTAGTATTATTTGCTATATTAATATTCGCAATTGTTGGATTAGAATTCTACTCTGGTGTCTTTCATGTAACATGCTTTGAACAAAGTAATCCAACAGAATTGCCAAGTTTCATACCAGATGCACCTGGTTTAGTACCATGTCAACCGGTGGATACCCATACACGACCACCGGGAGCATTTATTTGTCCAGCTGGCTATATATGCAAAGGTTATTGGGAGGGACCAAATTATGGCATTACAAGTTTCGATAATATCGGTTATGCAATGTTAACAGTATTCCAGTGTATTACAATGGAAGGATGGACAGATGTACTATATATGACCAATCGAACATATGGATCACGTTTCAACTGGATTTATTTTATACCCTTAATTGTAATTGGAGCATTTCTATTGATCAATTTAGTACTTGGTGTTTTAAGTGGCGAATTCGCTAAAGAACGTGAACGTGTGGAAAAAAGGCGTGCTTTTTTGAAATTACGCAGGCAACAACAATCTGATCGTGAATTAAACGGTTATCTAGATTGGATACAACGAGCCGAGGAAGTTATTTTAGCTGAAGAACAAACTTCATTTGCACAACGATTAAACATTATCAAAGCTAGAAAAAGAGCAGAAAAGGTACGAAGAAGATCAAACGATGCTGAGAAACGTGCCATAGCTGCTGAATTGGAAAATTGTGAGGCTGAATTAAAAGCTAAACGAAACTTTAAAATACCCGGAAGTGAAGCTTTATTTCAATATCATAAACGATTTCGATTTGCAGTTCGTCGTCTTATCAAATCACAGAAATTTTACATTATTGTGATTACACTCGTATTGTTAAATGCATTATGCGTTTCTGTAGAATTCTATGGTCAACCAGGATGGCTTACAGATTTCTTATATTTTTCAGAATTCATTTTTCTTGGTCTTTTTCTATTTGAAATGATTATAAAAATCTATGGATTGGGTTGTTTGATTTATTTTCACTCAACATTCAATATTTTTGACTTTGCTGTTGTTTTCGCTAGTTTATTCGAAATTGTATGGCAAATTTTCTATCCATCTGATTCATTCGGATTTTCCGCTTTACGTAGTATACGTTTATTGAGAATATTTAAAATTACAAGATACTGGGCATCATTACGTAATCTGGTATTATCTTTATTAAATGCTATGAGAAGTATACTCAGTCTTCTATTTCTACTTTTCTTATTTATGTTAATATTTGCTTTACTTGGAATGCAATTATTTGGTGGAGAGTTTAATTTTGACGACGGTAAACCAGGTCAAAATTTTGATACATTTGTAAAAGCCTTATTAACTGTATTTCAAATTTTAACTGGTGAAGATTGGAATATGATTATGTACGATGGAATACGTTCTCAAGGTGGTGTAAATAATGGAGGATTTGTATATTGTATTTATTTTGTATTATTAGCATTGTTTGGCAATTATACTTTGCTAAATGTATTTTTAGCCATTGCTGTAGATAATTTAGCTAATGCACAAGAATTGACAGCAGCTGAAGAAGAGGAACAACGTTTAGCGAATGAGTTAGCGGAACAACAAGAAGATAAGGAAAATCTCAAAACCGATTTGAATCAACCACAAACTATTGAAATAAATCAAATCAATGAAAGAAAATATTCCGGATTCGAAGAATTCGGAAAATCTATTACAGCACAAATGGGAAATAAATACTGTGATAACTATAGTACAATGCAAAAATTCCAAACAGATATAGAACCAGGTCGAGAGCAAGACACACAAGCAAATCAAGAGTCTCAAACACAACATCAATTATGTGGCAAGCCAATGCTTCCCTACAGTTCAATGTTTATATTTTCTTCAACAAATCCTGTTCGTCGATTTTGTCATTTTGTAGTGAATCTACGATATTTTGATTTATTCATAATGATTGTTATTGTATCAAGTAGTCTTGCATTGGCTGCTGAAGATCCAGTCAGTGAAAATAGTATACGAAACTGTTTATTAGAATATTTTGATCACGCTTTTACATGTGTATTCGCTATTGAAATGTTATTGAAGTTAATTGATCTTGGTGTATTTCTACACCCATATTCTTATTGTCGTGATACGTGGAATTTATTAGATGCCGCTGTAGTGATCGGCGCGTTAATATCATTTTTTCGAGCTTATACTTTGAAAGGTAGAGCTGGACATGGAAGTAGTAAAAATTTGAGTACAATAAAGTCGTTACGTGTACTTCGAGTGTTAAGACCACTAAAAACCATTCGAAGAGTACCGAAATTAAAAGCTGTATTCGATTGTGTAGTTAGTTCATTAAAAAATGTTTGTATTATTCTTGTTGTATATATATTATTCCAATTTATATTCTCTATTGTGGCAGTTCAATTATTTCAGGGAAAATTTTTCTATTGTAATGATTTATCAAAACTTACAAAAGAAGATTGTCAAGGTTATTTCTTTTCATATGATGACGGTCTAGTACCTGTTGTGAAAGCTCGAGTATGGAGTTCACGTGATTTTCATTATGACAATGTGATCACAGCTATGCTAACATTATTCACAGTGACAACTGGTGAAGGATGGCCTGGAATTTTAAAGAATTCAATGGATGCTACTGAAGTGAATCATGGCCCAGTTGAAGATCATAGTCAACAAATGGCAATATTCTATATTATATTTTTCATTGTATTCCCATTCTTTTTTGTCAATATTTTTGTAGCCTTGATTATTATAACATTTCAAGAACAAGGTGAAAATGAATTAGTCGATCATGAATTGGATAAAAACCAAAAACAATGTATTGAATTTGCAATTAATTCAAAACCTTTATGTAGATATATGCCTAGTAACATTGCATCAACAAAATATCGAATATGGAGATTAGTTGTTTCTAGTCCATTTGAATATTATATCATGACAATGATTGCATTAAATACTTTAATTTTAATGATGAAATATTATCGACCAGATTATACAGATGCTAATATGGGCATTCCAGACTGGGAAACACAAAAATATCAAAGTCATTGTAGTACACTAGTTTATTTGAATACAGCATTTACTGCTATGTTTACAATGGAATGTTTATTAAAATTAATTGCATTCGGACCAAAAAGTTATTTTCGTGATTCATGGAATACGTTCGATTTTATTACGGTAGTTGGTAGCATAACCGATGTACTTGTTTCTGAGCTACAGGACTCATCGTTTCTTAACTTAGGGTTTTTACGACTATTTCGTGCAGCTCGTTTGATCAAATTAATTAGACACGGTTATACAATCAGAATACTATTATGGACATTTATTCAATCATTTAAAGCACTACCCTATGTTTGCCTACTTATTACTATGTTATTCTTTATATATGCTGTAGTAGGAATGCAAATATTTGGTACAATAGCTACTAATGAAGCTGAAGGACAAATTACAAGTTATAATAATTTTCATAGTTTCCCATATGCAGTTCTGTTATTATTTCGTTGTGCTACGGGTGAATCATGGCAAGAAATAATGCTTGCCTGTACATATGGACAAGAATGTGTTAATCGTGCATCAAACAATTGTGGAAGCAATGCATCCTATACTTATTTTGTATCATTTAATTTCTTTTGCTCATTTCTTATGCTCAATTTATTTGTTGCTGTAATTGTGGATAATTTTGATTATTTAACAAGAGATTCACCTATACTGGGGTCACATCATTTAGATGAATTCATACGTGTATGGGCCGAATATGATCCAGGTGCAAAGGGAAGAATACATTACACAGAAATGTATGAAATGCTTAGAAAATTAGAACCTCCAGTTGGATTTGGTCAGAATTGTCCGTACAGATTAGCGTATAAGAAATTAATTCGTATGAATATGCCATTAGATAGTGCAGGAACTGTACATTTCACAACAACACTGTTTGCTTTAGTTCGAGAATCA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[+] EMBL CD180914             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAGATTTCTTATATTTTTCAGAATTCATTTTTCTTGGTCTTTTTCTATTTGAAATGATTATAAAAATCTATGGATTGGGTTGTTTGATTTATTTTCACTCAACATTCAATATTTTTGACTTTGCTGTTGTTTTCGCTAGTTTATTCGAAATTGTATGGCAAATTTTCTATCCATCTGATTCATTCGGATTTTCCGCTTTACGTAGTATACGTTTATTGAGAATATTTAAAATTACAAGATACTGGGCATCATTACGTAATCTGGTATTATCTTTATTAAATGCTATGAGAAGTATACTCAGTCTTCTATTTCTACTTTTCTTATTTATGTTAATATTTGCTTTACTTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           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>consensus_69#0 GGGTTGGAAAGCCTGATCTCATTAGGACAGTGCTCAATTTAGGATCAGAAACTTTTTTTT CTTGAAAAAAGGAACAAGATATTCAGTCTAACAGATGGAGCTAAAAATACATATGGAATG TTAATTCTTGGAAGAGTGCACAATTTTATCTGTTATCAAATAATAGGATATTTTAACTCT TGGAATATATATTTCTATCGTTTAAAGATTGTATTCTTTAATACAAGCATCCATGTTTAT CAGTTTTGTATATTTTCAAGATGATACTACAATATTTCATATTGAAACCTGAGAAGAAAA TGTTATTTTCTTCTAGGAACGTAAAATTAACTGATAGTTCCATTAATTTAATCTTCAACA AATGAACTACATTATATAAACTATTTATTAGAAAATTGTACTGGTGATATATATGTAATT TTAAAACTATTTGATAATGATATCAACCAGTGATTCGATAACTAATCAAGATATTAATAA TCATCCTATAAATGTACAAAATAAACGATCAGATATTGATCAAAGATTAAATCGTGATCC TAAATATGAAACAATTAATCAATTAGCTAAAGATACATTGAATATTGAATTACCAGAATC ACAAAGTTCAACAAATCGTGCACTTTTTGTTTTTTCAAAAAATAATTTAATACGTAAAGC AGCACGTAACATAATTGAATGGGGACCATTTGAATATATGGTTCTATCAACTATCATAGC TAATTGTGTTGTCCTAGCAATGGAAGTTCATTTGCCAAATAAAGATAAACGTCCATTATC TGAAAAATTGGAAATCACTGAAAACTACTTTTTGGGAATTTTTACCTGTGAAGCTTTCTT GAAAATTATTGCATTAGGATTTATTCTGCACAGTGGATCTTATTTAAGAAATATATGGAA TATTTTAGATTTCGTTGTTGTAGTCACTGGATTTCTTACAATGTTCATGACCAGTGGAAG 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clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)