These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6957#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 613 fasta sequence [TTACTTGATGCTGACTGGTTCATCCCTTAAGTATGCTTTTACCGAATAATCTATCATCGTTTAAGTTTGTCCACTAACATTAATCGGTTTAAATCTAATCAATCAGTCTTTTGTGATTTGTGCCTGATCTTTGTATGAAACTTTCAGGGTTCTACCCTGCCATTAAAACCAGTCGACAAAAAATCATGGTCATAGATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCTGAGTTATTGTCGGGAACGAAATGCTTTATTGTGTGGCCTAAAATGTAATCCTTCGTTTCTGGTGTTGGTTTCAGTTCCTGATGTGGTTGTAAATTTACATAAATGTAGACTTCCATCTTAGAATAAGAGAGCTTTACAATGTTTCTGGTTTCTAGTAGGATTCATCAACC] [+] EMBL CD152310 [TTACTTGATGCTGACTGGTTCATCCCTTAAGTATGCTTTTACCGAATAATCTATCATCGTTTAAGTTTGTCCACTAACATTAATCGGTTTAAATCTAATCAATCAGTCTTTTGTGATTTGTGCCTGATCTTTGTATGAAACTTTCAGGGTTCTACCCTGCCATTAAAACCAGTCGACAAAAAATCATGGTCATAGATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCCTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCT ] [+] EMBL CD152290 [TTACTTGATGCTGACTGGTTCATCCCTTAAGTATGCTTTTACCGAATAATCTATCATCGTTTAAGTTTGTCCACTAACATTAATCGGTTTAAATCTAATCAATCAGTCTTTTGTGATTTGTGCCTGATCTTTGTATGAAGCTTTCAGGGTTCTACCCTGCCATTAAAACCAGTCGACAAAAAATCATGGTCATAGATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATGGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCA ] [-] EMBL CD152236 [ CATAAATTTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTAATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCTGAGTTATTGTCGGGAACGAAATGCTTTATTGTGTGGCCTAAAATGTAATCCTTCGTTTCTGGTGTTGGTTTCAGTTCCTGATGTGGTTGTAAATTTACATAAATGTAGACTTCCATCTTAGAATAAGAGAGCTTTACAATGTTTCTGGTTTCTAGTAGGATTCATCAACC] [-] EMBL CD152163 [ TTCGTGTTAGTTCGCATTCATCAACACGGTATATCTACAAGCTTAGATGAATAGCTGATCCCTTCCTTCGTGTTCAAATCTTTCAGTGTCGCAGTCAGAGTTTGTTATCATTGATCTATTCATATCACGACCTGTTATTAGATCGATTTATTTTCATGAAAGTCTTTTAGTATGTTCTATTTGTAATTTCTATGAAAAAAAAGTCATACATACAAACACAATAACATACATCGACATCCCATTTCTGAGTTATTGTCGGGAACGAAATGCTTTATTGTGTGGCCTAAAATGTAATCCTTCGTTTCTGGTGTTGGTTTCAGTTCCTGATGTGGTTGTAAATTTACATAAATGTAGACTTCCATCTTAGAATAAGAGAGCTTTACAATGTTTCTGGTTTCTAGTAGGATTCATCAACC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||