These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6958#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 914 fasta sequence [TTGGAAGAGGAGTATTTGGAATGAACTGTGGATGTAAAAAATAATTATTAGGCGATTGCACAAGTCCCACTGGAGGTAAAGATGACATTCCGAATGAGTACGGTACATTAGATTGAATCGGTGACATCATATGTTGAGATTGTGGCAAATAATACGGTAAATGATGATGAGGAGGTGGTGGATGAGCTGACTGTTGTTGTCGTTGTGTTGGTGGCGTTGTAGATTGTAATTGTGGGCTATTGTTATTCAATAAATTATTATTATTTGTCTGTTGTTGCGATAATGACTGAGGTGTTTGTAAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAATTCACAGGGGACAACATGGAGGCACCATACATCAATTGATTTGGTTGTTCTTGATGCTGATGATGCGGTTGTTGATCACCTCGCACTACTGGTGGTGGCAATAAATTAACCGACTGATAATAATACCAAGCATTAACTAAACCATTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTAGCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGTTAAATTAGGATAAACATGAATATTTGAGTCAGATAAAATTGTATTCATAGTATTATTTTTATTAAACGTGGATAAATTCTCGTTATCATTTCGAATTGATAATCGAGCGACTTGATTGGAATTATGTCAAGAAGATTACCAATCGAATTCAGTGGCT] [+] EMBL CD179471 [TTGGAAGAGGAGTATTTGGAATGAACTGTGGATGTAAAAAATAATTATTAGGCGATTGCACAAGTCCCACTGGAGGTAAAGATGACATTCCGAATGAGTACGGTACATTAGATTGAATCGGTGACATCATATGTTGAGATTGTGGCAAATAATACGGTAAATGATGATGAGGAGGTGGTGGATGAGCTGACTGTTGTTGTCGTTGTGTTGGTGGCGTTGTAGATTGTAATTGTGGGCTATTGTTATTCAATAAATTATTATTATTTGTCTGTTGTTGCGATAATGACTGAGGTGTTTGTAAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAAT ] [+] EMBL CD152171 [ AAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAATTCACAGGGGACAACATGGAGGCACCATACATCAATTGATTTGGTTGTTCTTGATGCTGATGATGCGGTTGTTGATCACCTCGCACTACTGGTGGTGGCAATAAATTAACCGACTGATAATAATACCAAGCATTAACTAAACCATTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTAGCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGTT ] [+] EMBL CD152193 [ AAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAATTCACAGGGGACAACATGGAGGCACCATACATCAATTGATTTGGTTGTTCTTGATGCTGATGATGCGGTTGTTGATCACCTCGCACTACTGGTGGTGGCAATAAATTAACCGACTGATAATAATACCAAGCATTAACTAAACCATTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTATCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGT ] [-] EMBL CD152362 [ TTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTAGCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGTTAAATTAGGATAAACATGAATATTTGAGTCAGATAAAATTGTATTCATAGTATTATTTTTATTAAACGTGGATAAATTCTCGTTATCATTTCGAATTGATAATCGAGCGACTTGATTGGAATTATGTCAAGAAGATTACCAATCGAATTCAGTGGCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||