Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6958 cluster # 6958       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6958#0 length = 914 sequences # 4  

consensusID : consensus_6958#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 914
fasta sequence
                              [TTGGAAGAGGAGTATTTGGAATGAACTGTGGATGTAAAAAATAATTATTAGGCGATTGCACAAGTCCCACTGGAGGTAAAGATGACATTCCGAATGAGTACGGTACATTAGATTGAATCGGTGACATCATATGTTGAGATTGTGGCAAATAATACGGTAAATGATGATGAGGAGGTGGTGGATGAGCTGACTGTTGTTGTCGTTGTGTTGGTGGCGTTGTAGATTGTAATTGTGGGCTATTGTTATTCAATAAATTATTATTATTTGTCTGTTGTTGCGATAATGACTGAGGTGTTTGTAAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAATTCACAGGGGACAACATGGAGGCACCATACATCAATTGATTTGGTTGTTCTTGATGCTGATGATGCGGTTGTTGATCACCTCGCACTACTGGTGGTGGCAATAAATTAACCGACTGATAATAATACCAAGCATTAACTAAACCATTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTAGCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGTTAAATTAGGATAAACATGAATATTTGAGTCAGATAAAATTGTATTCATAGTATTATTTTTATTAAACGTGGATAAATTCTCGTTATCATTTCGAATTGATAATCGAGCGACTTGATTGGAATTATGTCAAGAAGATTACCAATCGAATTCAGTGGCT]

[+] EMBL CD179471             [TTGGAAGAGGAGTATTTGGAATGAACTGTGGATGTAAAAAATAATTATTAGGCGATTGCACAAGTCCCACTGGAGGTAAAGATGACATTCCGAATGAGTACGGTACATTAGATTGAATCGGTGACATCATATGTTGAGATTGTGGCAAATAATACGGTAAATGATGATGAGGAGGTGGTGGATGAGCTGACTGTTGTTGTCGTTGTGTTGGTGGCGTTGTAGATTGTAATTGTGGGCTATTGTTATTCAATAAATTATTATTATTTGTCTGTTGTTGCGATAATGACTGAGGTGTTTGTAAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD152171             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAATTCACAGGGGACAACATGGAGGCACCATACATCAATTGATTTGGTTGTTCTTGATGCTGATGATGCGGTTGTTGATCACCTCGCACTACTGGTGGTGGCAATAAATTAACCGACTGATAATAATACCAAGCATTAACTAAACCATTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTAGCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGTT                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD152193             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTGGAAAACCACTATAATTAAAATTCACAGGGGACAACATGGAGGCACCATACATCAATTGATTTGGTTGTTCTTGATGCTGATGATGCGGTTGTTGATCACCTCGCACTACTGGTGGTGGCAATAAATTAACCGACTGATAATAATACCAAGCATTAACTAAACCATTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTATCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGT                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD152362             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTACTGGTTAAGTTTATACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTGAAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGGTATTGATAGTAGCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTATTAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGTTAAATTAGGATAAACATGAATATTTGAGTCAGATAAAATTGTATTCATAGTATTATTTTTATTAAACGTGGATAAATTCTCGTTATCATTTCGAATTGATAATCGAGCGACTTGATTGGAATTATGTCAAGAAGATTACCAATCGAATTCAGTGGCT]


>consensus_6958#0 TTGGAAGAGGAGTATTTGGAATGAACTGTGGATGTAAAAAATAATTATTAGGCGATTGCA CAAGTCCCACTGGAGGTAAAGATGACATTCCGAATGAGTACGGTACATTAGATTGAATCG GTGACATCATATGTTGAGATTGTGGCAAATAATACGGTAAATGATGATGAGGAGGTGGTG GATGAGCTGACTGTTGTTGTCGTTGTGTTGGTGGCGTTGTAGATTGTAATTGTGGGCTAT TGTTATTCAATAAATTATTATTATTTGTCTGTTGTTGCGATAATGACTGAGGTGTTTGTA AACTGAGCATATTCATATAATAGGGTAATGATGTGTATTGGTGTTGTTGTTGACCAAGTG GAAAACCACTATAATTAAAATTCACAGGGGACAACATGGAGGCACCATACATCAATTGAT TTGGTTGTTCTTGATGCTGATGATGCGGTTGTTGATCACCTCGCACTACTGGTGGTGGCA ATAAATTAACCGACTGATAATAATACCAAGCATTAACTAAACCATTACTGGTTAAGTTTA TACTATTGATGGGATTATTATTGTTACTTTTATTATCACTGGTTGCATGGTTCGAATCTG AAACTAGTGACATTCCTGTAATAGAATTATTACTATTATTAGTAGTAGTAGTGATAGTGG TATTGATAGTAGCACTATTACCAATATCACAATTATTATTAGTGACACTGCTGTTACTAT TAATATCGTTATTAGTCAATTCCTGAACTGAATTCGTTAAATTAGGATAAACATGAATAT TTGAGTCAGATAAAATTGTATTCATAGTATTATTTTTATTAAACGTGGATAAATTCTCGT TATCATTTCGAATTGATAATCGAGCGACTTGATTGGAATTATGTCAAGAAGATTACCAAT CGAATTCAGTGGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)