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Schistosoma mansoni
cluster # 6984 cluster # 6984       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6984#0 length = 528 sequences # 4  

consensusID : consensus_6984#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 528
fasta sequence
                              [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG]

[+] EMBL AI977207             [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGCTCACACTTATTGAATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG]
[+] EMBL AI976854             [TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATGATGATCATACAAATATTTTTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG]
[+] EMBL AI977201             [                                               acGCCTTGTAAAATTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGACGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTTAAATTTCCGTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AA629493             [                                                                                                             TTTGAACGATGAACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAGGGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCGTGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATNNTCCTATGGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTCATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTTATTGTATGTCTTGTTATGCTGACNGCTAATGTTTTACATGNNTGTACAACTNAACGAATGATGAT                                           ]


>consensus_6984#0 TTGTTGCATGGTCTTTTAAATCTACCTTAACAATGATCGCGCATTGGATGCCTTGTAAAA TTGAAGCAAACGGGATGAAAGTAAATTCCGAACTTCAGTGTTCTGAAACTTTGAACGATG AACCTGGTGCATTAAGTAATCATGTACTACTTTCAAATTTCCGTGGTAGACCATTACGAG GGGTTCAACTCAGTTTCCCTAACAATTACTCACCAGTGGTTGTTCACCATAGTAGTGTCG TGTCAGACGTTGGAACAGAACCAATAAAATTTGGGGCTAAGCTCGATAAAATAATCCTAT GGAATTTGTCCACACCACCAAGATTCTCAGATCCTATACCATTATCTCTCACTTGGCTTC ATTTGGCTAGTATTTTGCATTCAAGCTCCTAGTATTCGCTGATACATATTGTTCACACTT ATTGTATGTCTTGTTATGCTGACGGCTAATGTTTTACATATCTGTACAACTAAACGAATG ATGATCATACAAATATTNNTTTGTAACTGATTTTTTGACTTTATAAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)