These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7013#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1350 fasta sequence [ACCTCCACGTCTCCCTTTTCTCCTAGAAGTCGACTCATCAGGTTCTGGAGAATCTTGAAGACATGGACCTCTTGTAGATCTACCTCTATTAGATGATTCTGCAGCTTTACGCCTGCGGCTAGAATTCGAACGGGCTGGATAAGTTGTAGTTATACGAACTTTATAATTAGCCTGTAGCCAAAATCGATCAAGAGGTTGAATTTCAACTATACGCCTTACGCTATAAGGCTTATTGTCATCATGTCTACCTGAAGCACCACTAACATCAACATCGTCGTCATCGTCATCAATATTTAAAGTTTTTCTAAAACAAGGTCGCCCATTGGAATCATGAACACATATATCTTTATCTGGTTCAACCATTATATCATCCCATCGAATACAATGCCATAGTGTACGTAAAAGTACGGCGAAATTGGATAAATCTAAACCAAATGAGATATTATTGTTATGATTATCTTTTTGATAACTATTCATTCGTATCTGACTGAGACGAAAACGCCAACATTCTGCAAAATTAGGTCTTGAACTAGGATATAACCAGTTCACCTGTGAAAGTCGTTTCTTTTCAACATCGTATCCAGGGATTTCACGGCGACCAGCAGAAAGTATGGTAAGGCGTAAATTATGAGGATTTAGTCGGAATAAAGATGATTTGGGGAGAACCATATTTTGTTTCTGTTCACTACTAAATTGATTACACGATATGGAATCTGGAAGTGGCCATGCATAATCATTTACATAAGGTAAACTTTGTGGTAACACAGCTTGATGAGCATCAACAGTAGTCCCATATTCTTTACCGGCTTGATTAGCTGTTTTCCTGTTATTGTTACGTAAAAATTTATTCACGAATGCTTTGTTGTTTAAATCAAAATCAGCGTTGTTACGTATTGATAATGAATACGGTGAACTGATGACTGGTGATCCACGATTGACAATCTCTTGATATTTGCTTAATTCTGATTTTAATGAGTTAATTTGTGATTCTAATTCTTGTGCCTCAGAACGAACTGAAACAATCTGAGCATTAATAGAGTCCAGTTTAGCAGTGGATTCGGTCACAGCACGATCTAAAGCCAGAGTTGCTTCATCAACTATTGGAGTTTGTAATCGAGCAGCAGTTGAACCACTGTCGAACTGTCTAACTAGTCCTTTATAATCAGAAATTAAAACTTTCGATTGATTATTCATTATAGAACGAGGATCTTCATCTATTAATGAATTATGACGAATATGTTGAGCTTTAGCTATTGAACGTCTACCTTGATGTAGATCTGACATTCCTTGTGAATCAGATATCATTGGTCGAATAGATGATCCCGATGGTTGCGGTCTCCTCTAGGAAAC] [-] EMBL CD131124 [ACCTCCACGTCTCCCTTTTCTCCTAGAAGTCGACTCATCAGGTTCTGGAGAATCTTGAAGACATGGACCTCTTGTAGATCTACCTCTATTAGATGATTCTGCAGCTTTACGCCTGCGGCTAGAATTCGAACGGGCTGGATAAGTTGTAGTTATACGAACTTTATAATTAGCCTGTAGCCAAAATCGATCAAGAGGTTGAATTTCAACTATACGCCTTACGCTATAAGGCTTATTGTCATCATGTCTACCTGAAGCACCACTAACATCAACATCGTCGTCATCGTCATCAATATTTAAAGTTTTTCTAAAACA ] [-] EMBL CD200651 [ TTATACGAACTTTATAATTAGCCTGTAGCCAAAATCGATCAAGAGGTTGAATTTCAACTATACGCCTTACGCTATAAGGCTTATTGTCATCATGTCTACCTGAAGCACCACTAACATCAACATCGTCGTCATCGTCATCAATATTTAAAGTTTTTCTAAAACAAGGTCGCCCATTGGAATCATGAACACATATATCTTTATCTGGTTCAACCATTATATCATCCCATCGAATACAATGCCATAGTGTACGTAAAAGTACGGCGAAATTGGATAAATCTAAACCAAATGAGATATTATTGTTATGATTATCTTTTTGATAACTATTCATTCGTATCTGACTGAGACGAAAACGCCAACATTCTGCAAAATTAGGTCTTGAACTAGGATATAACCAGTTCACCTGTGAAAGTCGTTTCTTTTCAA ] [+] EMBL CD125438 [ TCTTGAACTAGGATATAACCAGTTCACCTGTGTAAGTCGTTTCTTTTCAACATCGTATCCAGGGATTTCACGGCGACCAGCAGAAAGTATGGTAAGGCGTAAATTATGAGGATTTAGTCGGAATAAAGATGATTTGGGGAGAACCATATTTTGTTTCTGTTCACTACTAAATTGATTACACGATATGGAATCTGGAAGTGGCCATGCATAATCATTTACATAAGGTAAACTTTGTGGTAACACAGCTTGATGAGCATCAACAGTAGTCCCATATTCTTTACCGGCTTGATTAGCTGTTTTCCTGTTATTGTTACGTAAAAATTTATTCACGAATGCTTTGTTGTTTAAATCAAAATCAGCGTTGTTACGTATTGATAATGAATACGGTGAACTGATGACTGGTGATCCACGATTGACAATCTCTTGATATTTGCTTAATTCTGATTTTAATGAGTTAATTTGTGATTCTAATTCTTGTGCCTCAGAACGAACTGAAACAATCTGAGCATTAATAGAGTCCAGTTTAGCAGTGGATTCGGTCACAGCACGATCTAAAGCCAGAGTTGCTTCATCAACTATTGGAGT ] [-] EMBL CD061830 [ TTTAAATCAAAATCAGCGTTGTTACGTATTGATAATGAATACGGTGAACTGATGACTGGTGATCCACGATTGACAATCTCTTGATATTTGCTTAATTCTGATTTTAATGAGTTAATTTGTGATTCTAATTCTTGTGCCTCAGAACGAACTGAAACAATCTGAGCATTAATAGAGTCCAGTTTAGCAGTGGATTCGGTCACAGCACGATCTAAAGCCAGAGTTGCTTCATCAACTATTGGAGTTTGTAATCGAGCAGCAGTTGAACCACTGTCGAACTGTCTAACTAGTCCTTTATAATCAGAAATTAAAACTTTCGATTGATTATTCATTATAGAACGAGGATCTTCATCTATTAATGAATTATGACGAATATGTTGAGCTTTAGCTATTGAACGTCTACCTTGATGTAGATCTGACATTCCTTGTGAATCAGATATCATTGGTCGAATAGATGATCCCGATGGTTGCGGTCTCCTCTAGGAAAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||