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Schistosoma mansoni
cluster # 7013 cluster # 7013       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7013#0 length = 1350 sequences # 4  

consensusID : consensus_7013#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1350
fasta sequence
                              [ACCTCCACGTCTCCCTTTTCTCCTAGAAGTCGACTCATCAGGTTCTGGAGAATCTTGAAGACATGGACCTCTTGTAGATCTACCTCTATTAGATGATTCTGCAGCTTTACGCCTGCGGCTAGAATTCGAACGGGCTGGATAAGTTGTAGTTATACGAACTTTATAATTAGCCTGTAGCCAAAATCGATCAAGAGGTTGAATTTCAACTATACGCCTTACGCTATAAGGCTTATTGTCATCATGTCTACCTGAAGCACCACTAACATCAACATCGTCGTCATCGTCATCAATATTTAAAGTTTTTCTAAAACAAGGTCGCCCATTGGAATCATGAACACATATATCTTTATCTGGTTCAACCATTATATCATCCCATCGAATACAATGCCATAGTGTACGTAAAAGTACGGCGAAATTGGATAAATCTAAACCAAATGAGATATTATTGTTATGATTATCTTTTTGATAACTATTCATTCGTATCTGACTGAGACGAAAACGCCAACATTCTGCAAAATTAGGTCTTGAACTAGGATATAACCAGTTCACCTGTGAAAGTCGTTTCTTTTCAACATCGTATCCAGGGATTTCACGGCGACCAGCAGAAAGTATGGTAAGGCGTAAATTATGAGGATTTAGTCGGAATAAAGATGATTTGGGGAGAACCATATTTTGTTTCTGTTCACTACTAAATTGATTACACGATATGGAATCTGGAAGTGGCCATGCATAATCATTTACATAAGGTAAACTTTGTGGTAACACAGCTTGATGAGCATCAACAGTAGTCCCATATTCTTTACCGGCTTGATTAGCTGTTTTCCTGTTATTGTTACGTAAAAATTTATTCACGAATGCTTTGTTGTTTAAATCAAAATCAGCGTTGTTACGTATTGATAATGAATACGGTGAACTGATGACTGGTGATCCACGATTGACAATCTCTTGATATTTGCTTAATTCTGATTTTAATGAGTTAATTTGTGATTCTAATTCTTGTGCCTCAGAACGAACTGAAACAATCTGAGCATTAATAGAGTCCAGTTTAGCAGTGGATTCGGTCACAGCACGATCTAAAGCCAGAGTTGCTTCATCAACTATTGGAGTTTGTAATCGAGCAGCAGTTGAACCACTGTCGAACTGTCTAACTAGTCCTTTATAATCAGAAATTAAAACTTTCGATTGATTATTCATTATAGAACGAGGATCTTCATCTATTAATGAATTATGACGAATATGTTGAGCTTTAGCTATTGAACGTCTACCTTGATGTAGATCTGACATTCCTTGTGAATCAGATATCATTGGTCGAATAGATGATCCCGATGGTTGCGGTCTCCTCTAGGAAAC]

[-] EMBL CD131124             [ACCTCCACGTCTCCCTTTTCTCCTAGAAGTCGACTCATCAGGTTCTGGAGAATCTTGAAGACATGGACCTCTTGTAGATCTACCTCTATTAGATGATTCTGCAGCTTTACGCCTGCGGCTAGAATTCGAACGGGCTGGATAAGTTGTAGTTATACGAACTTTATAATTAGCCTGTAGCCAAAATCGATCAAGAGGTTGAATTTCAACTATACGCCTTACGCTATAAGGCTTATTGTCATCATGTCTACCTGAAGCACCACTAACATCAACATCGTCGTCATCGTCATCAATATTTAAAGTTTTTCTAAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD200651             [                                                                                                                                                     TTATACGAACTTTATAATTAGCCTGTAGCCAAAATCGATCAAGAGGTTGAATTTCAACTATACGCCTTACGCTATAAGGCTTATTGTCATCATGTCTACCTGAAGCACCACTAACATCAACATCGTCGTCATCGTCATCAATATTTAAAGTTTTTCTAAAACAAGGTCGCCCATTGGAATCATGAACACATATATCTTTATCTGGTTCAACCATTATATCATCCCATCGAATACAATGCCATAGTGTACGTAAAAGTACGGCGAAATTGGATAAATCTAAACCAAATGAGATATTATTGTTATGATTATCTTTTTGATAACTATTCATTCGTATCTGACTGAGACGAAAACGCCAACATTCTGCAAAATTAGGTCTTGAACTAGGATATAACCAGTTCACCTGTGAAAGTCGTTTCTTTTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD125438             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCTTGAACTAGGATATAACCAGTTCACCTGTGTAAGTCGTTTCTTTTCAACATCGTATCCAGGGATTTCACGGCGACCAGCAGAAAGTATGGTAAGGCGTAAATTATGAGGATTTAGTCGGAATAAAGATGATTTGGGGAGAACCATATTTTGTTTCTGTTCACTACTAAATTGATTACACGATATGGAATCTGGAAGTGGCCATGCATAATCATTTACATAAGGTAAACTTTGTGGTAACACAGCTTGATGAGCATCAACAGTAGTCCCATATTCTTTACCGGCTTGATTAGCTGTTTTCCTGTTATTGTTACGTAAAAATTTATTCACGAATGCTTTGTTGTTTAAATCAAAATCAGCGTTGTTACGTATTGATAATGAATACGGTGAACTGATGACTGGTGATCCACGATTGACAATCTCTTGATATTTGCTTAATTCTGATTTTAATGAGTTAATTTGTGATTCTAATTCTTGTGCCTCAGAACGAACTGAAACAATCTGAGCATTAATAGAGTCCAGTTTAGCAGTGGATTCGGTCACAGCACGATCTAAAGCCAGAGTTGCTTCATCAACTATTGGAGT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD061830             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAAATCAAAATCAGCGTTGTTACGTATTGATAATGAATACGGTGAACTGATGACTGGTGATCCACGATTGACAATCTCTTGATATTTGCTTAATTCTGATTTTAATGAGTTAATTTGTGATTCTAATTCTTGTGCCTCAGAACGAACTGAAACAATCTGAGCATTAATAGAGTCCAGTTTAGCAGTGGATTCGGTCACAGCACGATCTAAAGCCAGAGTTGCTTCATCAACTATTGGAGTTTGTAATCGAGCAGCAGTTGAACCACTGTCGAACTGTCTAACTAGTCCTTTATAATCAGAAATTAAAACTTTCGATTGATTATTCATTATAGAACGAGGATCTTCATCTATTAATGAATTATGACGAATATGTTGAGCTTTAGCTATTGAACGTCTACCTTGATGTAGATCTGACATTCCTTGTGAATCAGATATCATTGGTCGAATAGATGATCCCGATGGTTGCGGTCTCCTCTAGGAAAC]


>consensus_7013#0 ACCTCCACGTCTCCCTTTTCTCCTAGAAGTCGACTCATCAGGTTCTGGAGAATCTTGAAG ACATGGACCTCTTGTAGATCTACCTCTATTAGATGATTCTGCAGCTTTACGCCTGCGGCT AGAATTCGAACGGGCTGGATAAGTTGTAGTTATACGAACTTTATAATTAGCCTGTAGCCA AAATCGATCAAGAGGTTGAATTTCAACTATACGCCTTACGCTATAAGGCTTATTGTCATC ATGTCTACCTGAAGCACCACTAACATCAACATCGTCGTCATCGTCATCAATATTTAAAGT TTTTCTAAAACAAGGTCGCCCATTGGAATCATGAACACATATATCTTTATCTGGTTCAAC CATTATATCATCCCATCGAATACAATGCCATAGTGTACGTAAAAGTACGGCGAAATTGGA TAAATCTAAACCAAATGAGATATTATTGTTATGATTATCTTTTTGATAACTATTCATTCG TATCTGACTGAGACGAAAACGCCAACATTCTGCAAAATTAGGTCTTGAACTAGGATATAA CCAGTTCACCTGTGAAAGTCGTTTCTTTTCAACATCGTATCCAGGGATTTCACGGCGACC AGCAGAAAGTATGGTAAGGCGTAAATTATGAGGATTTAGTCGGAATAAAGATGATTTGGG GAGAACCATATTTTGTTTCTGTTCACTACTAAATTGATTACACGATATGGAATCTGGAAG TGGCCATGCATAATCATTTACATAAGGTAAACTTTGTGGTAACACAGCTTGATGAGCATC AACAGTAGTCCCATATTCTTTACCGGCTTGATTAGCTGTTTTCCTGTTATTGTTACGTAA AAATTTATTCACGAATGCTTTGTTGTTTAAATCAAAATCAGCGTTGTTACGTATTGATAA TGAATACGGTGAACTGATGACTGGTGATCCACGATTGACAATCTCTTGATATTTGCTTAA TTCTGATTTTAATGAGTTAATTTGTGATTCTAATTCTTGTGCCTCAGAACGAACTGAAAC AATCTGAGCATTAATAGAGTCCAGTTTAGCAGTGGATTCGGTCACAGCACGATCTAAAGC CAGAGTTGCTTCATCAACTATTGGAGTTTGTAATCGAGCAGCAGTTGAACCACTGTCGAA CTGTCTAACTAGTCCTTTATAATCAGAAATTAAAACTTTCGATTGATTATTCATTATAGA ACGAGGATCTTCATCTATTAATGAATTATGACGAATATGTTGAGCTTTAGCTATTGAACG TCTACCTTGATGTAGATCTGACATTCCTTGTGAATCAGATATCATTGGTCGAATAGATGA TCCCGATGGTTGCGGTCTCCTCTAGGAAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)