cluster # 7018

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Schistosoma mansoni
cluster # 7018 cluster # 7018 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7018#0 length = 549 sequences # 4

consensusID : consensus_7018#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 549
fasta sequence

                              [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA-AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTGNACCACACCATATCGGC-ATCGACTAANATTCAGAATGCGAACA]

[+] EMBL CD153281             [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTGNACCACACCATATCGGC ATCGACTANNATTCAGAATGCGAACA]
[+] EMBL CD153230             [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAACTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTGNACCACACCATATCGGC ATCGACTAANATTCAGAATGCGAACA]
[+] EMBL CD153374             [TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGA AGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCTTGGTTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCATAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAATCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTG ACCACACCATATCGGCAATCGACTAAaa               ]
[+] EMBL CD153278             [TTCACCTTGGTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGGTATCATTTTCTGTTGCGAATATCCCAATGCCCCACTCTACGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCTCGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGATAGATGTCGACGATACTGCAGTGAGAGCTTGGCTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAACAGGTACGTCTTGCTTTTGGTAATTTAATGCTCTGATCTACTAGATGATCTTCTAGTTGTGCGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGATGATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTCTATCTTCGAATTTAACTAGTATACATAAGTCACCTCACCGAATACTAATCCGATACTCATTAGAGAATAACCTCAAGATAAATTTACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTA                                                                                           ]




>consensus_7018#0
TTCACCTTGTTTCTATGTTTAATATTTCACCAATGGTTATCATTTTCTGTTGCGAATATC
CCAATGCCCCACTCTAGGATTGATTCGGAACTTGCATTATTCATTACAAATGAATTATCT
CGACTATTAAGTCCAGACATTCCAACAGTGGAAGATGTCGGTGATACTGTAGTGAGAGCT
TGGTTTAAACATGAAAAAGAATTTTGTCTAAAAGGTACGTCTTGTTTTTGGTAATTTAAT
GCTCTGATCTACAAGATGATCTTCTAGTTGTGTGATTGTCAGAGATTATGTGAAATTGAT
GATGGACTGAAAACAGTAGGAAAATTTTGAAGTTTTATCTTCAAATTTAACTAGTATCCA
TAAGTCACCTCACCGAATAATAATCCGATACTCAATAGTGAATAACCTCAAGATAAATTT
ACCGAATTACTAAAGAGTTTTAATGACAGTTCGAGTTTACCAATGTCAGTCATGAGACAA
TCACCTAGTATCAATATCGGTCTTTGNACCACACCATATCGGCATCGACTAANATTCAGA
ATGCGAACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case