These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7073#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 927 fasta sequence [TTTTCTTCAAATATACGCGTTTTAACGTCGCCAAAATTTAAACAAACAGTTACTATTCAACGTGTTCAATCTGATCATATATGTAAACCAAATATGGATGTAGTCAGTATTGCAGATAGTATAAATAGTATTAATAATAATGATAAACTTCCTGCTATTCCTTATAATAACCATAGTTCTATCGATTCACAAAATAACGATATCAATGACAATATTCCTACTACTACTACTACTATTACAATTACTAGTAGTGAAGTAACAGCACGTAATGAATCACCGTCTGTGTTATTGTCGTCCACTGAATCATTTCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC-TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCCATT-GGAAGCTTAAACTTGT--GCTATGCGAATTTTCTTTACAC-CAACTGTTATCACTGGATTTATACACATTTTTAATATCACTATTTATATTCCTTATTGCTTAGTATAGATACCATTTTCAGAATAGAACGTATTCTATCCCTTATTATAAGCAATGCACTACAATTATAAACTAGCGTTGATAAATAGGAGGTAGAAATCATTACTGTTTCCGNCATTATATTTTATCTTTTCTCTAAAAAAGAAAATTGATTGTTACATCAGTGTTGTTTTTTGTTGTTTCTTATGGAAAAAAAATGAAATACAATGCAGTA] [+] EMBL CD078930 [TTTTCTTCAAATATACGCGTTTTAACGTCGCCAAAATTTAAACAAACAGTTACTATTCAACGTGTTCAATCTGATCATATATGTAAACCAAATATGGATGTAGTCAGTATTGCAGATAGTATAAATAGTATTAATAATAATGATAAACTTCCTGCTATTCCTTATAATAACCATAGTTCTATCGATTCACAAAATAACGATATCAATGACAATATTCCTACTACTACTACTACTATTACAATTACTAGTAGTGAAGTAACAGCACGTAATGAATCACCGTCTGTGTTATTGTCGTCCACTGAATCATTTCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGGGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTNCATT GNAAGCTTAn ] [+] EMBL CD062225 [ GTGTTATTGTCGTCCACTGAATCATTTCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCCATT GGAAGCTTAAACTTGT GCTATGCGAATTTTCTTTACAC CAACTGTTATCACTGGATTTATACACATTTTTAATATCACTATTTATATTCCTTATTGCTTAGTATAGATACCATTTTCAGAATAGAACGTATTCTATCCCTTATTATAAGCAATGCACTACAATTATAAACTAGCGTTGATAAATAGGAGGTAGAAATCATTACTGTTTCCGNCATTATATTTTATCTTTTCTCTAAAA ] [-] EMBL CD073386 [ TCGTAATTTGGATCACTTACATAAGACCAACTTGGAAATACATTATCATGGTAAATGAAATACCAATCTTTTCAGTTGAAAGGAAGCGGCAAGTGTCTACCTCATATAAATGAATTCAAAAGAC TCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCGATATGTATAAATCCCTCCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCCATT GGAAGCTTAAACTTGT GCTATGCGAATTTTCTTTACAC CAACTGTTATCACTGGATTTATACACATTTTTAATATCACTATTTATATTCCTTATTGCTTAGTATAGATACCATTTTCAGAATAGAACGTATTCTATCCCTTATTATAAGCAATGCACTACAATTATAAACTAGCGTTGATAAATAGGAGGTAGAAATCATTACTGTTTCCGTCATTATATTTTATCTTTTCTCTAAAAAAGAAAATTGATTGTTACATCAGTGTTGTTTTTTGTTGTTTCTTATGGAAAAAAAATGAAATACAATGCAGTA] [+] EMBL AI618788 [ TTCAAAAGACGTCATCAGTATCCATATTATCTCAATAGATAATTATAATAATAATCATAATTCAATCAGTATGCATTGTGTATGTCTTCTACTTTTTTTTATTTATCAGCAGTTCAATATGTATAAATCCCTTCCTCAGTGTCCATAATAATAGTAATAATACTAATAATGATAATTTTAACCCTTCTTTCAATTGGGAAGCTTAAACTTGTGCGCTATACGAATTTTCTTTACACACACGTGTTACCGCGGGTTTTACACACAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||