Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7093 cluster # 7093       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7093#0 length = 584 sequences # 4  

consensusID : consensus_7093#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 584
fasta sequence
                              [TTTATTTTTACCCGGTTATAAATATTCATTCACGCTTTATCAGAACCAGTTGATTTTCCCGCTCCGCTTTACCACTTCTTACTATGAATAGTTGTTTGGAAAAACCAGCGCTTAAAATAAGTTCATGCAACGCAACCAGTATTTGGCCTCTTGTTACCGCCTTCACACAAACGGGGTTAGTCTGGGTAATATGCGAAGTTAAATTTTAGATTTATGTTCTTGACAGATTTAAACGTTCATCCAAATTATGGTCATTAAAAAGCTAGTCTGGTTACTCGAGTTCTTCTGATTTCTCTAAGGGGTCCATTATTGGAATATTGTGGAGTTCGCTATCAAAGTAGTCAATTTGAGGCACTGTCAAAAGTACACTCTCGTGTTGAATCCGTTTTGTTTAATGAAGCGGATATCGAAATATTGAGGGAGAAATCAAAATGCTGTTGATTTTTCTTGCTTGACTATCACAATTACAGTCAGTAAACACTGGGAGGGCAATTATCACTGATTGACCAATTAATTACAGCGACGTTTTCCAATTCACTATTTTTACTACACTAGATTTTCTAATGAACTGATAATCATGTAGA]

[+] EMBL CD097934             [TTTATTTTTACCCGGTTATAAATATTCATTCACGCTTTATCAGAACCAGTTGATTTTCCCGCTCCGCTTTACCACTTCTTACTATGAATAGTTGTTTGGAAAAACCAGCGCTTAAAATAAGTTCATGCAACGCAACCAGTATTTGGCCTCTTGTTACCGCCTTCACACAAACGGGGTTAGTCTGGGTAATATGCGAAGTTAAATTTTAGATTTATGTTCTTGACAGATTTAAACGTTCATCCAAATTATGGTCATTAAAAAGCTAGTCTGGTTACTCGAGTTCTTCTGATTTCTCTAAGGGGTCCATTATTGGAATATTGTGGAGTTCGCTATCAAAGTAGTCAATTTGAGGCACTGTCAAAAGTACACTCTCGTGTTGAATCCGTTTTGTTTAATGAAGCGGATATCGAAATATTGAGGGAGAAATCAAAATGCTGTTGATTTTTCTTGCTTGACTATCACAATTACAGTCAGTAAACACTGGGAGGGCAATTATCACTGATT                                                                                ]
[+] EMBL CD156446             [ TTATTTTTACCCGGTTATAAATATTCATTCACGCTTTATCAGAACCAGTTGATTTTCCCGCTCCGCTTTACCACTTCTTACTATGAATAGTTGTTTGGAAAAACCAGCGCTTAAAATAAGTTCATGCAACGCAACCAGTATTTGGCCTCTTGTTACCGCCTTCACACAAACGGGGTTAGTCTGGGTAATATGCGAAGTTAAATTTTAGATTTATGTTCTTGACAGATTTAAACGTTCATCCAAATTATGGTCATTAAAAAGCTAGTCTGGTTACTCGAGTTCTTCTGATTTCTCTAAGGGGTCCATTATTGGAATATTGTGGAGTTCGCTATCAAAGTAGTCAATTTGAGGCACTGTCAAAAGTACACTCTCGTGTTGAATCCGTTTTGTTTAATGAAGCGGATATCGAAATATTGAGGGAGAAATCAAAATGCTGTTGATTTTTCTTGCTTGACTATCACAATTACAGTCAGTAAACACTGGGAGGGCAATTATCACTGATTGACCAATTAATTACAGCGACGTTTTCCAATTCACTATTTTTACTACACTAGATTTTCTAATGAACTGATAATCATGTAGA]
[+] EMBL CD156059             [ TTATTTTTACCCGGTTATAAATATTCATTCACGCTTTATCAGAACCAGTTGATTTTCCCGCTCCGCTTTACCACTTCTTACTATGAATAGTTGCTTGGAAAAACCAGCGCTTAAAATAAGTTCATGCAACGCAACCAGTATTTGGCCTCTTGTTACCGCCTTCACACAAACGGGGTTAGTCTGGGTAATATGCGAAGTTAAATTTTAGATTTATGTTCTTGACAGATTTAAACGTTCATCCAAATTATGGTCATTAAAAAGCTAGTCTGGTTACTCGAGTTCTTCTGATTTCTCTAAGGGGTCCATTATTGGAATATTGTGGAGTTCGCTATCAAAGTAGTCAATTTGAGGCACTGTCAAAAGTACACTCTCGTGTTGAATCCGTTTTGTTTAATGAAGCGGATATCGAAATATTGAGGGAGAAATCAAAATGCTGTTGATTTTTCTTGCTTGACTATCACAATTACAGTCAGTAAACACTGGGAGGGCAATTATCACTGATTGACCAATTAATTACAGCGACGTTTTCCAATTCACTATTTTTACTACACTAGATTNTCTAATGAAC               ]
[+] EMBL CD156564             [ TTATTTTTACCCGGTTATAAATATTCATTCACGCTTTATCAGAACCAGTTGATTTTCCCGCTCCGCTTTACCACTTCTTACTATGAATAGTTGTTTGGAAAAACCAGCGCTTAAAATAAGTTCATGCAACGCAACCAGTATTTGGCCTCTTGTTACCGCCTTCACACAAACGGGGTTAGTCTGGGTAATATGCGAAGTTAAATTTTAGATTTATGTTCTTGACAGGTTTAAACGTTCATCCAAATTATGGTCATTAAAAAGCTAGTCTGGTTACTCGAGTTCTTCTGATTTCTCTAAGGGGTCCATTATTGGAATATTGTGGAGTTCGCTATCAAAGTAGTCAATTTGAGGCACTGTCAAAAGTACACTCTCGTGTTGAATCCGTTTTGTTTAATGAAGCGGATATCGAAATATTGAGGGAGAAATCAAAATGCTGTTGATTTTTCTTGCTTGACTATCACAATTACAGTCAGTAAACACTGGGAGGGCAATTATCACTGATTGACCAATTAATTACAGCGACGTTTTCCAATTCACTATTTTTACTACACTAGATTTTCTAATGAAC               ]


>consensus_7093#0 TTTATTTTTACCCGGTTATAAATATTCATTCACGCTTTATCAGAACCAGTTGATTTTCCC GCTCCGCTTTACCACTTCTTACTATGAATAGTTGTTTGGAAAAACCAGCGCTTAAAATAA GTTCATGCAACGCAACCAGTATTTGGCCTCTTGTTACCGCCTTCACACAAACGGGGTTAG TCTGGGTAATATGCGAAGTTAAATTTTAGATTTATGTTCTTGACAGATTTAAACGTTCAT CCAAATTATGGTCATTAAAAAGCTAGTCTGGTTACTCGAGTTCTTCTGATTTCTCTAAGG GGTCCATTATTGGAATATTGTGGAGTTCGCTATCAAAGTAGTCAATTTGAGGCACTGTCA AAAGTACACTCTCGTGTTGAATCCGTTTTGTTTAATGAAGCGGATATCGAAATATTGAGG GAGAAATCAAAATGCTGTTGATTTTTCTTGCTTGACTATCACAATTACAGTCAGTAAACA CTGGGAGGGCAATTATCACTGATTGACCAATTAATTACAGCGACGTTTTCCAATTCACTA TTTTTACTACACTAGATTTTCTAATGAACTGATAATCATGTAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)