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Schistosoma mansoni
cluster # 7099 cluster # 7099       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7099#0 length = 530 sequences # 4  

consensusID : consensus_7099#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 530
fasta sequence
                              [AGCGAAAGTATCAGTAGTAGTAGAGATGATTAGGTATAAAATGAATGAAAAAAGATATACAATGTTTCCATATAAAGTATGGATAGATTATGGCATAGCACCAGTAAGTTTATATTTATTCTAGAATCGATAAGAGTGATTATGCGGTCAGTATATCCTTGAGCAGTAGTGAAACATACCTAATCCTCTGTATGATAGTATCTTGGAGCTTAAAAAATTAAATTAACAGGATTTACTTCCTTATACTTGTCAAGGGATGTTATCAGTCCTTATTTATAAGCTTAGACTGGTCTGAAGAGACTTTAAGTGTCATTTGACCTGTATATTAGTCTCTCTTATCAATAAATTCAGACTATATATGGGCTTGTCAAACCAGTTTAATGGCTAAGTAATACAGTTCCAAAATCATCTGGAGTCGTCAAACGCTATGGGGGGAGATCTTATCAATTGATGAAGCTCTTACCTCGGAAATAAATGAATTAAATGCTGATCTGTTGATGNGACCGGGTGCTGGCTGCTCACATGACAGG]

[-] EMBL CD123197             [AGCGAAAGTATCAGTAGTAGTAGAGATGATTAGGTATAAAATGAATGATAAAAGATATACAATGTTTCCATATAAAGTATGGATAGATTATGGCATAACACCAGTAAGTTTATATTTATTCTAGAATCGATAAGAGTGATTATGCGGTCAGTATATCCTTGAGCAGTAGTGAAACATACCTAATCCTCTGTATGATAGTATCTTGGAGCTTAAAAAATTAAATTAACAGGATTTACTTCCTTATACTTGTCAAGGGATGTTATCAGTCCTTATTTATAAGCTTAGACTGGTCTGAAGAGACTTTAAGTGTCATTTGACCTGTATATTAGTCTCTCTTATCAATAAATTCAGACTATATATGGGCTTGTCAAACCAGTTTAATGGCTAAGTAATACAGTTCCAAAATCATCTGGAGTCGT                                                                                                               ]
[-] EMBL CD123276             [AGCGAAAGTATCAGTAGTAGTAGAGATGATTAGGTATAAAATGAATGAAAAAAGATATACAATGTTTCCATATAAAGTATGGATAGGTTATGGCATAGCACCAGTAAGTTTATATTTATTCTAGAATCGATAAGAGTGATTATGCGGTCAGTATATCCTTGAGCAGTAGTGAAACATACCTAATCCTCTGTATGATGGTATCTTGGAGCTTAAAAAATTAAATTAACAGGATTTACTTCCTTATACTTGTCAAGGGATGTTATCAGTCCTTATTTATAAGCTTAGACTGGTCTGAAGAGACTTTAAGTGTCATTTGACCTGTATATTAGTCTCTCTTATCAATAAATTCAGACTATATATGGGCTTGTCAAACCAGTTTAATGGCTAAGTAATACAGTTCCAAAATCATCTGGAGTCGT                                                                                                               ]
[-] EMBL CD123192             [AGCGAAAGTATCAGTAGTAGTAGAGATGATTAGGTATAAAATGAATGAAAAAAGATATACAATGTTTCCATATAAAGTATGGATAGATTATGGCATAGCACCAGTGAGTTTATATTTACTCTAGAATCGATAAGAGTGATTATGCGGTCAGTATATCCTTGAGCAGTAGTGAAACATACCTAATCCTCTGTATGATAGTATCTTGGAGCTTAAAAAATTAAATTAACAGGATTTACTTCCTTATACTTGTCAAGGGATGTTATCAGTCCTTATTTATAAGCTTAGACTGGTCTGAAGAGACTTTAAGTGTCATTTGACCTGTATATTAGTCTCTCTTATCAATAAATTCAGACTATATATGGGCTTGTCAAACCAGTTTAATGGCTAAGTGATACAGTTCCAAAATCATCTGGAGTCGT                                                                                                               ]
[+] EMBL CD153475             [                                                                                         ATGGCATAGCACCAGTAAGTTTATATTTATTCTAGAATCGATAAGAGTGATTATGCGGTCAGTATATCCTTGAGCAGTAGTGAAACATACCTAATCCTCTGTATGATAGTATCTTGGAGCTTAAAAAATTAAATTAACAGGATTTACTTCCTTATACTTGTCAAGGGATGTTATCAGTCCTTATTTATAAGCTTAGACTGGTCTGAAGAGACTTTAAGTGTCATTTGACCTGTATATTAGTCTCTCTTATCAATAAATTCAGACTATATATGGGCTCGTCAAACCAGTTTAATGGCTAAGTAATACAGTTCCAAAATCATCTGGAGTCGTCAAACGCTATGGGGGGAGATCTTATCAATTGATGAAGCTCTTACCTCGGAAATAAATGAATTAAATGCTGATCTGTTGATGNGACCGGGTGCTGGCTGCTCACATGACAGG]


>consensus_7099#0 AGCGAAAGTATCAGTAGTAGTAGAGATGATTAGGTATAAAATGAATGAAAAAAGATATAC AATGTTTCCATATAAAGTATGGATAGATTATGGCATAGCACCAGTAAGTTTATATTTATT CTAGAATCGATAAGAGTGATTATGCGGTCAGTATATCCTTGAGCAGTAGTGAAACATACC TAATCCTCTGTATGATAGTATCTTGGAGCTTAAAAAATTAAATTAACAGGATTTACTTCC TTATACTTGTCAAGGGATGTTATCAGTCCTTATTTATAAGCTTAGACTGGTCTGAAGAGA CTTTAAGTGTCATTTGACCTGTATATTAGTCTCTCTTATCAATAAATTCAGACTATATAT GGGCTTGTCAAACCAGTTTAATGGCTAAGTAATACAGTTCCAAAATCATCTGGAGTCGTC AAACGCTATGGGGGGAGATCTTATCAATTGATGAAGCTCTTACCTCGGAAATAAATGAAT TAAATGCTGATCTGTTGATGNGACCGGGTGCTGGCTGCTCACATGACAGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)