cluster # 71

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Schistosoma mansoni
cluster # 71 cluster # 71 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_71#0 length = 816 sequences # 2

consensusID : consensus_71#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 816
fasta sequence

                              [GTATTATGTCTGGCATTTCACGAGTCGGCAAACTATTACTACCACGTACTGCTTTATTGTTATGCGATATCCAAGAAAAATTTCGTCCAACTATTAGTCATTTTGATGCAATTGTCGAAACGTCTAGTCGGATGTTAACAGCTGCTCGTATGCTAGGAATGCGCATTTTAGTCACTGAAATGTACCCTAAAGGCCTAGGTCCTACTGTTAAAGAGTTAGGAGATTTAAATGGTATCCCCATCATTTCAAAGAGATCATTTACTATGCTAACAGATGAAGTGGCCAATATTTTGGAGCTGCGAAAACAAATTGATTCTGTATTATTATGTGGTATTGAAACACATGTTTGTGTTCAGTCAACTGCATTAGATTTAATTGAACGTGGGATACAAGTTCATTGTATTGTAGATGCTGTGTCTTCACGAAATATGGTTGACAGAATGTTTGGATTTCAACGAATGAGTCAATCAGGTGTCTATTTGACTACATGTGAATCAGCTCTATTAACCATACTCTGTGGTTCTGATCATCCTCAATTTCGTGATATTCAAAAGATTATTTTAAAGCCTAGTCCAGATAGTGGTCTATTAACTGGATTCAATACACTAAAAATTAGTTAAATACTTAAACTNTATCTGTTTTTCATACAACTNTATACAGTTTTATTTTAATCACAATACTGNTATAAGAGTATGCTATNTTATTCTATATTTCTTTTCTATGGTCAAGTATGAATTTT-ATGATCTTTGTAANNACTC-GATAC-TACTTC-GCTACTG-ATAAAA-TTTAA-TTTACTAGCTGGT-ATA-TTTTA-CT-AAATAA]

[+] EMBL CD079966             [GTATTATGTCTGGCATTTCACGAGTCGGCAAACTATTACTACCACGTACTGCTTTATTGTTATGCGATATCCAAGAAAAATTTCGTCCAACTATTAGTCATTTTGATGCAATTGTCGAAACGTCTAGTCGGATGTTAACAGCTGCTCGTATGCTAGGAATGCGCATTTTAGTCACTGAAATGTACCCTAAAGGCCTAGGTCCTACTGTTAAAGAGTTAGGAGATTTAAATGGTATCCCCATCATTTCAAAGAGATCATTTACTATGCTAACAGATGAAGTGGCCAATATTTTGGAGCTGCGAAAACAAATTGATTCTGTATTATTATGTGGTATTGAAACACATGTTTGTGTTCAGTCAACTGCATTAGATTTAATTGAACGTGGGATACAAGTTCATTGTATTGTAGATGCTGTGTCTTCACGAAATATGGTTGACAGAATGTTTGGATTTCAACGAATGAGTCAATCAGGTGTCTATTTGACTACATGTGAATCAGCTCTATTAACCATACTCTGTGGTTCTGATCATCCTCAATTTCGTGATATTCAAAAGATTATTTTAAAGCCTAGTCCAGATAGTGGTCTATTAACTGGATTCAATACACTAAAAATTAGTTAAATACTTAAACTNTATCTGTTTTTCATACAACTNTATACAGTTTTATTTTAATCACAATACTGNTATAAGAGTATGCTATNTTATTCTATATTTCTTTTCTATGGTCAAGTATGAATTTT ATGATCTTTGTAANNACTC GATAC TACTTC GCTACTG ATAAAA TTTAA TTTACTAGCTGGT ATA TTTTA CT AAATA ]
[-] EMBL CD074161             [                                                                                                                                                                                    TGTACCNTAAAGGCNTAGGTCCTACTGTTAAAGAGTTAGGAGATTTAAATGGTATCCCCATCATTTCAAAGAGATCATTTACTATGCTAACAGATGAAGTGGCCAATATTTTGGAGCTGCGAAAACAAATTGATTCTGTATTATTATGTGGTATTGAAACACATGTTTGTGTTCAGTCAACTGCATTAGATTTAATTGAACGTGGGATACAAGTTCATTGTATTGTAGATGCTGTGTCTTCACGAAATATGGTTGACAGAATGTTTGGATTTCAACGAATGAGTCAATCAGGTGTCTATTTGACTACATGTGAATCAGCTCTATTAACCATACTCTGTGGTTCTGATCATCCTCAATTTCGTGATATTCAAAAGATTATTTTAAAGCCTAGTCCAGATAGTGGTCTATTAACTGGATTCAATACACTAAAAATTAGTTAAATACTTAAACTTTATCTGTTTTTCATACAACTTTATACAGTTTTATTTTAATCACAATACTGTAATAAGAGTATGCTATTTTATTCTATATTTCTTTTCTATGTTCAAGTATGAATTTTAATGATCTTTGTTAAAACTCGGATACATACTTCAGCTACTGAATAAAATTTTAATTTTACTAGCTGGTAATATTTTTACCTAAAATAA]




>consensus_71#0
GTATTATGTCTGGCATTTCACGAGTCGGCAAACTATTACTACCACGTACTGCTTTATTGT
TATGCGATATCCAAGAAAAATTTCGTCCAACTATTAGTCATTTTGATGCAATTGTCGAAA
CGTCTAGTCGGATGTTAACAGCTGCTCGTATGCTAGGAATGCGCATTTTAGTCACTGAAA
TGTACCCTAAAGGCCTAGGTCCTACTGTTAAAGAGTTAGGAGATTTAAATGGTATCCCCA
TCATTTCAAAGAGATCATTTACTATGCTAACAGATGAAGTGGCCAATATTTTGGAGCTGC
GAAAACAAATTGATTCTGTATTATTATGTGGTATTGAAACACATGTTTGTGTTCAGTCAA
CTGCATTAGATTTAATTGAACGTGGGATACAAGTTCATTGTATTGTAGATGCTGTGTCTT
CACGAAATATGGTTGACAGAATGTTTGGATTTCAACGAATGAGTCAATCAGGTGTCTATT
TGACTACATGTGAATCAGCTCTATTAACCATACTCTGTGGTTCTGATCATCCTCAATTTC
GTGATATTCAAAAGATTATTTTAAAGCCTAGTCCAGATAGTGGTCTATTAACTGGATTCA
ATACACTAAAAATTAGTTAAATACTTAAACTNTATCTGTTTTTCATACAACTNTATACAG
TTTTATTTTAATCACAATACTGNTATAAGAGTATGCTATNTTATTCTATATTTCTTTTCT
ATGGTCAAGTATGAATTTTATGATCTTTGTAANNACTCGATACTACTTCGCTACTGATAA
AATTTAATTTACTAGCTGGTATATTTTACTAAATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case