cluster # 7105

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7105 cluster # 7105 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7105#0 length = 702 sequences # 4

consensusID : consensus_7105#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 702
fasta sequence

                              [AGTTGGCCATCAATAGCTAGTATACGATCATGAGGTCTAAGAACTCCTTGTTGTGATGCTGGGCTGTTTGGACGGATTTCGCTAACGAATACACCAGGTTCATTGTTTGGACTCAAATTAACGATGAAAATACCAAAACCGTCTGAACCTCTCTCCAAGATAATGTCGAATAATTGAAATTTCCAAAAATCTTCATTTAATTCAACCATGATCTCTTTTAGAAATGTATGTGGGATCGACTTTGAGCCAGTTGGTAATTGATTAAGTGCTGATGACGAAAACGCTTTTGAACAGGTACTACTAGTCAAATTATTTACACTTAACGGTGAATCATTGCACT-CCGGT-G-AAAATGACATTAATGACAAATTTTTTGGATTTCGTCTTATGATTAGTGTAATGAAAGATTTGATAACTGATTGACCTGAATCGCCTACTTTTCCATCGTCATCATTATCAATAAAAGAATTATTACTTGGGTTATTGATTGCATAC-TTTTTTGACATTAATTCTTTAATTTTTGAATGGATAATCTGTTGAACGGAAAAATGATCTAATCCACAGACGTTGATGTCTTCAACCTGCACTATTTCATCTCCATACTCAAGACCACCACTAGAATGCCATGATATGGAATCAGTTTGACAGCTTGCAACAAATGTAGCCATACTCTCGAGATCAGAACAACTTACAAGACGCAAACCC]

[-] EMBL CD136834             [AGTTGGCCATCAATAGCTAGTATACGATCATGAGGTCTAAGAACTCCTTGTTGTGATGCTGGGCTGTTTGGACGGATTTCGCTAACGAATACACCAGGTTCATTGTTTGGACTCAAATTAACGATGAAAATACCAAAACCGTCTGAACCTCTCTCCAAGATAATGTCGAATAATTGAAATTTCCAAAAATCTTCATTTAATTCAACCATGATCTCTTTTAGAAATGTATGTGGGATCGACTTTGAGCCAGTTGGTAATTGATTAAGTGCTGATGACGAAAACGCTTTTGAACAGGTACTACTAGTCAAACTATTTACACTTAACGGTGAATCATTGCACT CCGGT G AAAATGACATTAATGACAAATTTTTTGGATTTCGTCTTATGATTAGTGTAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD200737             [                                                                        CGGATTTCGCTAACGAATACACCAGGTTCATTGTTTGGACTCAAATTAACGATGAAAATACCAAAACCGTCTGAACCTCTCTCCAAGATAATGTCGAATAATTGAAATTTCCAAAAATCTTCATTTAATTCAACCATGATCTCTTTTAGAAATGTATGTGGGATTGACTTTGAGCCAGTTGGTAATTGATTAAGTGCTGATGACGAAAACGCTTTTGAACAGGTACTACTAGTCAAATTATTTACACTTAACGGTGAATCATTGCACT CCGGT G AAAATGACATTAATGACAAATTTTTTGGATTTCGTCTTATGATTAGTGTAATGAAAGATTTGATAACTGATTGACCTGAATCGCCTACTTTTCCATCGTCATCATTATCAATAAAAGAATTATTACTTGGGTTATTGATTGCATACTTTTTTTGACATTAATTCTTTAATTTTTGAATGGATAATCTGTTGAACGGAAAAATGATCTAATCCACAGACGTTGAT                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD151794             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTCAAATTATTTACACTTAACGGCGAATCATTGCACTGCCGGTCG AAAATGACATTAATGACAAATTTTTTGGATTTCGTCTTATGATTAGTGTAATGAAAGATTTGATAACTGATTGACCTGAATCGCCTACTTTTCCATCGTCATCATTATCAATAAAAGAATAATTACTTGGGTTATTGATTGCATAC TTTTTTGACATTAATTCTTTAATTTTTGAATGGATAATCAGGGGAACGGAAAAATGATCTAATCCACAGACGTTGATGTCTTCAACCTGCACTATTTCATCTCCATACTCAAGACCACCACTAGAATGCCATGATATGGAATCAGTTTGACAGCTTGCAACAAATGTAGCCATACTCTCGAGATCAGAACAACTTACAAGACGCAAACCC]
[+] EMBL CD151751             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTCAAATTATTTACACTTAACGGGGAATCATTGCACT CCGGT GCAAAATGACATTAATGACAAATTTTTTGGATTTCGTCTTATGATTAGTGTAATGAAAGATTTGATAACTGATTGACCTGAATCGCCTACTTTTCCATCGTCATCATTATCAATAAAAGAATTATTACTTGGGTTATTGATTGCATAC TTTTTTGACATTAATTCTTTAATTTTTGAATGGATAATCTGTTGAACGGAAAAATGATCTAATCCACAGACGTTGATGTCTTCAACCTGCACTATTTCATCTCCATACCCAAGACCACCACTAGAATGCCATGATATGGAATCAGTTTGACAGCTTGCAACAAATGTAGCCATACTCTCGAGATTACAACAACTTACAAGACGCAAACCC]




>consensus_7105#0
AGTTGGCCATCAATAGCTAGTATACGATCATGAGGTCTAAGAACTCCTTGTTGTGATGCT
GGGCTGTTTGGACGGATTTCGCTAACGAATACACCAGGTTCATTGTTTGGACTCAAATTA
ACGATGAAAATACCAAAACCGTCTGAACCTCTCTCCAAGATAATGTCGAATAATTGAAAT
TTCCAAAAATCTTCATTTAATTCAACCATGATCTCTTTTAGAAATGTATGTGGGATCGAC
TTTGAGCCAGTTGGTAATTGATTAAGTGCTGATGACGAAAACGCTTTTGAACAGGTACTA
CTAGTCAAATTATTTACACTTAACGGTGAATCATTGCACTCCGGTGAAAATGACATTAAT
GACAAATTTTTTGGATTTCGTCTTATGATTAGTGTAATGAAAGATTTGATAACTGATTGA
CCTGAATCGCCTACTTTTCCATCGTCATCATTATCAATAAAAGAATTATTACTTGGGTTA
TTGATTGCATACTTTTTTGACATTAATTCTTTAATTTTTGAATGGATAATCTGTTGAACG
GAAAAATGATCTAATCCACAGACGTTGATGTCTTCAACCTGCACTATTTCATCTCCATAC
TCAAGACCACCACTAGAATGCCATGATATGGAATCAGTTTGACAGCTTGCAACAAATGTA
GCCATACTCTCGAGATCAGAACAACTTACAAGACGCAAACCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case