cluster # 7125

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Schistosoma mansoni
cluster # 7125 cluster # 7125 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7125#0 length = 600 sequences # 4

consensusID : consensus_7125#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 600
fasta sequence

                              [ACATTTCAAGTTAATTACTCAAGGAAAGAAAGAGTTTTATCACCCTTGTGGCCTAATAATGTAACTATTAAATGGAATCATGCCGGTAAAGATGGCAAATCAGTCGTATGAATCATTCAATGTCTAAATCTTTATTATCATTTATTAAGACGAAATCAACTTATCATCATCAAGCAGCAATTGAACCGGTCAATAGTAATGCTAATAACAATGATAATGGTTATTCATTGTTGTGTTATGCTTTAGCAGTGAATGTATTACAAAATCCTGTTGAAGGTGATGTAAATGTTATCAGATATCCACCTAACAATAATATTGTTCATCAACCAATTGAAGTGAAAACACGTGAATTTTATGCATTTTCATATTATTTTGATTTAGCTGTTAGCGTNGGTTTAATTCATGAAACTACTGGTGGATTTCTTACAGTGAATGATTTTCAAAATGCTGCTGAATAAATTTGTCGTAACCCAAATCCTCAGAGACCATTTGATTGCATGGATCTTAGTTTTATCACTGCATTATTACATAGTGGTTATGGATTCCCGGCAGATAAAAAAATTGGATTTTTTAGAAAAGGTAATTCTTTTGAAATTAATT]

[+] EMBL CD164351             [ACATTTCAAGTTAATTACTCAAGGAAAGAAAGAGTTTTATCACCCTTGTGGCCTAATAATGTAACTATTAAATGGAATCATGCCGGTAAAGATGGCAAATCAGTCGTATGAATCATTCAATGTCTAAATCTTTATTATCATTTATTAAGACGAAATCAACTTATCATCATCAAGCAGCAATTGAACCGGTCAATAGTAATGCTAATAACAATGATAATGGTTATTCATTGTTGTGTTATGCTTTAGCAGTGAATGTATTACAAAATCCTGTTGAAGGTGATGTAAATGTTATCAGATATCCACCTAACAATAATATTGTTCATCAACCAATTGAAGTGAAAACACGTGAATTTTATGCATTTTCATATTATTTTGATTTAGCTGTTAGCGTNGGTTTAATTCATGAAACTACTGGTGGATTTCTTACAGTGAATGATTTTCAAAATGCTGCTGAATAAATTTGTCGTAACCCAAATCCTCAGAGACCATTTGATNGCNTGGATCTTAGTTTTATCACTGCAT                                                                              ]
[+] EMBL CD062573             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTTATCAGATATCCACCTAACAATAATATTGTTCATCAACCAATTGAAGGGAAAACACGTGAATTTTATGCATTTTCATATTATTTTGATTTAGCT                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD164331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATCCTCAGAGACCATTTGATTGCATGGATCTTAGTTTTATCACTGCATTATTACATAGTGGTTATGGATTCCCGGCAGATAAAAAAATTGGATTTTTTAGAAAAGGTAATTCTTTTGAAATTAATT]
[-] EMBL CD164333             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATCCTCAGAGACCATTTGATTGCATGGATCTTAGTTTTATCACTGCATTATTACATAGTGGTTATGGATTCCCGGCAGATAAAAAAATTGGATTTTTTAGAAAAGGTAATTCTTTTGAAATTAATT]




>consensus_7125#0
ACATTTCAAGTTAATTACTCAAGGAAAGAAAGAGTTTTATCACCCTTGTGGCCTAATAAT
GTAACTATTAAATGGAATCATGCCGGTAAAGATGGCAAATCAGTCGTATGAATCATTCAA
TGTCTAAATCTTTATTATCATTTATTAAGACGAAATCAACTTATCATCATCAAGCAGCAA
TTGAACCGGTCAATAGTAATGCTAATAACAATGATAATGGTTATTCATTGTTGTGTTATG
CTTTAGCAGTGAATGTATTACAAAATCCTGTTGAAGGTGATGTAAATGTTATCAGATATC
CACCTAACAATAATATTGTTCATCAACCAATTGAAGTGAAAACACGTGAATTTTATGCAT
TTTCATATTATTTTGATTTAGCTGTTAGCGTNGGTTTAATTCATGAAACTACTGGTGGAT
TTCTTACAGTGAATGATTTTCAAAATGCTGCTGAATAAATTTGTCGTAACCCAAATCCTC
AGAGACCATTTGATTGCATGGATCTTAGTTTTATCACTGCATTATTACATAGTGGTTATG
GATTCCCGGCAGATAAAAAAATTGGATTTTTTAGAAAAGGTAATTCTTTTGAAATTAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case