cluster # 7131

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Schistosoma mansoni
cluster # 7131 cluster # 7131 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7131#0 length = 698 sequences # 4

consensusID : consensus_7131#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 698
fasta sequence

                              [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG-CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATT-GTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTTTTTCATACTTCGATGTTTACAATTCTGATGTTAT]

[+] EMBL BF936544             [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATGCCTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATTGGTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTTTTTCATACTTCGATGTTTACAATTCTGATGTTAT]
[+] EMBL AI976251             [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATT GTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTntn                                ]
[+] EMBL AI975012             [TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACTCCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAGCTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGATAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTT                                                                                            ]
[-] EMBL CD123331             [                                                                                                                                                                                                                                         AGAATAAAACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCAAAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGACTAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAACTAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAACTTTGTATG CTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTATGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCATCGATTTACGCTCATT GTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACGACTTTTTCAT                            ]




>consensus_7131#0
TCTTGAAGTATAAGCTCTGATTGAACAATTAATTCAAGTCGACATTTACGAACACGTACT
CCATCGTATAAGAGTAATGTATACAGGCCAGGACGTGAATCACAAGGGCGTAATAAATAG
CTAAATGGACCAGCTGTCAAAAGAAAATGTAATACATAAAGTTGCAATGTTTAGTCTTGA
TAAAATGATACTACATAATCAAGAAACAGAGATGTCACCTTCACAAAAGACTCAGAATAA
AACTCTAGTGATATTCATCTGCCTGTCCAAACAAAATTAAATGGAATAAAGTTTGAACCA
AAGTGAAAAACATTTAGAATTTTCTCCACTAACGAATATACCTATATGATAAATTAAGAC
TAGCAATTCTTATTTTACATTCCCTGTGCAAATAGTTCTTGTTTGAACAGGTCTAATAAC
TAAGCGTCGTTCTTAATTCTATCAACCAAATGTACTCATTCCTGGATGGTTAATTAATAA
CTTTGTATGCTTGTGTATACCGGAATGTACGTATGGAGTACTGATATTGTGTAAAATCTA
TGGACATAAATAAACTGAGATTATTTAGCGATTTCGAGGACATATCAGCTTACTAGTTCA
TCGATTTACGCTCATTGTCGATCTCCATATACCAATATATGAAATACACGTATCTGAACG
ACTTTTTCATACTTCGATGTTTACAATTCTGATGTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case