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Schistosoma mansoni
cluster # 7139 cluster # 7139       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7139#0 length = 486 sequences # 4  

consensusID : consensus_7139#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 486
fasta sequence
                              [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTCC]

[+] EMBL CD156243             [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTATCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTATGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAATTTC ]
[+] EMBL CD156048             [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTC ]
[+] EMBL CD155957             [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTC ]
[-] EMBL CD156202             [ AGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCAAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTCC]


>consensus_7139#0 TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTG GCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAG TTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTC AGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGT AGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAAT GCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAG TAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTG AATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTA GTTTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)