These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7139#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 486 fasta sequence [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTCC] [+] EMBL CD156243 [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTATCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTATGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAATTTC ] [+] EMBL CD156048 [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTC ] [+] EMBL CD155957 [TAGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCGAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTC ] [-] EMBL CD156202 [ AGGAGTTGTGTTTGATACCGACAGCGTAGGACTAACCCGAGGAGTCATTGCCCGTGTTGGCGCTTTGGCGGTTGTTCATGAAGGCGCCAAACACGCTGGTGCGCTTGGACAGGTCATAGTTGTAGCCCACCAAGAACACGTCATCCTTGTTCGAAGGCTGGCCAGCCACCCTGTGGTTCAGGTTGCAGAACGAAGCCATCACCGAAGCCTTCTCGGTCACCGGCACGCTCACGCCCAGTAGGTAGATCTTGTCCTTCAGGTTGTTGGTGTCGTCCTTGATGTAGGTGTACTGGGCAAATGCCTTGAGCACGCCGAAATCGTAGCTGGCACCAGCATCGGTCACCTTAGCCTTGGCGTAGTAGGTGGTGAGGTTAGGCTTGTCGGTCAGGCCACCCTTCACATAGGTCAGCATGGCGCTGAATGGACCAGCGTTGTACGAACCAGCCAGCGCGTAGCTGTTGGTGGCGCCGGACGTGGTAGTTTCC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||