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Schistosoma mansoni
cluster # 7148 cluster # 7148       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7148#0 length = 973 sequences # 4  

consensusID : consensus_7148#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 973
fasta sequence
                              [TTAGCGCTACTTCCAAGGTCACCTTGTAGCTCGAAGTCTTCCAGTCAATAGTGGTTCCGTAGTTGGTATTGGTTGTTACTGTATGCAAAACAATTCAGGGTCTCTTCATATCTATGGACGGTGACATTTTGAATGTTGTGCATTCTATCAAAACTGGGGAAAAAGATAATGCTGCAGTCTGTATTCCCTTTGAGAGACTTGCTCATTATTTATTACTTGATAAAGATAGTCTTCCGATTAACCTTCATTTGTCACTCATTGAATGTATCGCGAACATGGCGTTCAATCCATCAATCATCGGATTGAAAGGTTTCGAGTTATTATTTCCTGGCTTGTGGAATTTGGTATATCTTTCCCCTTCAACAGACAGAACTATACCATCACTTGTATTCCCTGTATTAAATCAGATTATACAGTTTAATACCTTTGTCGATTTCAATGGTAGCCTTCCATCTGTTTTGACTACTTCAGTCGAAAAGACATGTGAATTATATATGTCTGAAACAGATTGTCTTTTATTTTTGAGTGAACTTCTACGGTATGGTGTAAAACACGACATAGATTTTGAAGATTCTTTGGTAAAGAGTTTGACCGTTTGTTGCGAAAAATTTGATCCATCGTGTAAAGATGATTTACTTTGGAATTATTTAATTTTAATGATAAAATTAATAAATTTAATGCCTACAATTGACAGTTCTAAAGGTTTATTAGAACATCTTAAACATCCAATTTTATTTTGTTTGAATTGCTTGAAGACTAAACGATTTTACAGCATCAATAAACAATTCTGTATAGTTCTTCAATTTTTGGTCGCTTTGTCAAATGTTTTTCAATCGTTAAAATGGTTGGGAAATTTTTGTAATCAAACTAATCATGGTGAACCATTTACTCTAGTTGTTACAACCCTTACTATTGAACTACGTTTATATCTGACTCAGAAATCCTCAAAAAACAATAACAGTAAGAATGTTAG]

[+] EMBL CD123480             [TTAGCGCTACTTCCAAGGTCACCTTGTAGCTCGAAGTCTTCCAGTCAATAGTGGTTCCGTAGTTGGTATTGGTTGTTACTGTATGCAAAACAATTCAGGGTCTCTTCATATCTATGGACGGTGACATTTTGAATGTTGTGCATTCTATCAAAACTGGGGAAAAAGATAATGCTGCAGTCTGTATTCCCTTTGAGAGACTTGCTCATTATTTATTACTTGATAAAGATAGTCTTCCGATTAACCTTCATTTGTCACTCATTGAATGTATCGCGAACATGGCGTTCAATCCATCAATCATCGGATTGAAAGGTTTCGAGTTATTATTTCCTGGCTTGTGGAATTTGGTATATCTTTCCCCTTCAACAGACAGAACTATACCATCACTTGTATTCCCTGTATTAAATCAGATTATACAGTTTAATACCTTTGTCGATTTCAATGGTAGCCTTCCATCTGTTTTGACTACTTCAGTCGAAAAGACATGTGAATTATATATGTCTGAAACAGATTGTCTTTTATTTTTGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD179187             [TTAGCGCTACTTCCAAGGTCACCTTGTAGCTCGAAGTCTTCCAGTCAATAGTGGTTCCGTAGTTGGTATTGGTTGTTACTGTATGCGAAACAATTCAGGGTCTCTTCATATCTATGGACGGTGACATTTTGAATGTTGTGCATTCTATCAAAACTGGGGAAAAAGATAATGCTGCAGTCTGTATTCCCTTTGAGAGACTTGCTCATTATTTATTACTTGATAAAGATAGTCTTCCGATTAACCTTCATTTGTCACTCATTGAATGTATCGCGAACATGGCGTTCAATCCATCAATCATCGGATTGAAAGGCTTCGAGTTATTATTTCCTGGCTTGTGGAATTTGGTATATCTTTCCCCTTC ACAGACAGAACTATACCATCACTTGTATTCCCTGTATTAAATCAGATTATACAGCTTACTACCTTTGTCGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD123488             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGATTATACAGTTTAATACCTTTGTCGATTTCAATGGTAGCCTTCCATCTGTTTTGACTATTTCAGTCGAAAAGACATGTGAATTATATATGTCTGAAACAGATTGTCTTTTATTTTTGAGTGAACTTCTACGGTATGGTGTAAAACACGACATAGATTTTGAAGATTCTTTGGTAAAGAGTTTGACCGTTTGTTGCGAAAAATTTGATCCATCGTGTAAAGATGATTTACTTTGGAATTATTTAATTTTAATGATAAAATTAATAAATTTAATGCCTACAATTGACAGTTCTAAAGGTTTATTAGAACATCTTAAACATCCAATTTTATTTTGTTTGAATTGCTTGAAGACTAAACGATTTTACAGCATCAATAAACAATTCTGTATAGTTCTTCAATTTTTGGTCGCTTTGTCAAATGTTTTTCAATCGTTAAAATGGTTGGGAAATTTTTGTAATCAAACTAATCATGGTGAACCATTTACTCTAGTTGTTACAACCCTTACTATTGAACTACGTT                                                 ]
[+] EMBL CD187087             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAATTTTAATGATAAAATTAATAAATTTAATGCCTACAATTGACAGTTCTAAAGGTTTATTAGAACATCTTAAACATCCAATTTTATTTTGTTTGAATTGCTTGAAGACTAAACGATTTTACAGCATCAATAAACAATTCTGTATAGTTCTTCAATTTTTGGTCGCTTTGTCAAATGTTTTTCAATCGTTAAAATGGTTGGGAAATTTTTGTAATCAAACTAATCATGGTGAACCATTTACTCTAGTTGTTACAACCCTTACTATTGAACTACGTTTATATCTGACTCAGAAATCCTCAAAAAACAATAACAGTAAGAATGTTAG]


>consensus_7148#0 TTAGCGCTACTTCCAAGGTCACCTTGTAGCTCGAAGTCTTCCAGTCAATAGTGGTTCCGT AGTTGGTATTGGTTGTTACTGTATGCAAAACAATTCAGGGTCTCTTCATATCTATGGACG GTGACATTTTGAATGTTGTGCATTCTATCAAAACTGGGGAAAAAGATAATGCTGCAGTCT GTATTCCCTTTGAGAGACTTGCTCATTATTTATTACTTGATAAAGATAGTCTTCCGATTA ACCTTCATTTGTCACTCATTGAATGTATCGCGAACATGGCGTTCAATCCATCAATCATCG GATTGAAAGGTTTCGAGTTATTATTTCCTGGCTTGTGGAATTTGGTATATCTTTCCCCTT CAACAGACAGAACTATACCATCACTTGTATTCCCTGTATTAAATCAGATTATACAGTTTA ATACCTTTGTCGATTTCAATGGTAGCCTTCCATCTGTTTTGACTACTTCAGTCGAAAAGA CATGTGAATTATATATGTCTGAAACAGATTGTCTTTTATTTTTGAGTGAACTTCTACGGT ATGGTGTAAAACACGACATAGATTTTGAAGATTCTTTGGTAAAGAGTTTGACCGTTTGTT GCGAAAAATTTGATCCATCGTGTAAAGATGATTTACTTTGGAATTATTTAATTTTAATGA TAAAATTAATAAATTTAATGCCTACAATTGACAGTTCTAAAGGTTTATTAGAACATCTTA AACATCCAATTTTATTTTGTTTGAATTGCTTGAAGACTAAACGATTTTACAGCATCAATA AACAATTCTGTATAGTTCTTCAATTTTTGGTCGCTTTGTCAAATGTTTTTCAATCGTTAA AATGGTTGGGAAATTTTTGTAATCAAACTAATCATGGTGAACCATTTACTCTAGTTGTTA CAACCCTTACTATTGAACTACGTTTATATCTGACTCAGAAATCCTCAAAAAACAATAACA GTAAGAATGTTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)