These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7163#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 867 fasta sequence [GTGATGAAAGTTCTACAGCAATATGGGAGAAAAATATCGTACATTCGTGTTTAATCGGGATTATGCAATTGAAAACACAGTACAAATGTACCATCATTTCTAATGCTCAAATATATTCAGTTAGTCAATTTCCAGTGTATTGGAGAACAGCTTCAGCTATTCAAGCCAATAATTTACAACTAGTCGATAATGCTGGAGGCATATATCCATTTACTGGTTTTCCTGGAGGACGTAGTCATGAGATCAGCAAAAAAACTTTCCTATTTAATAATTCACTATTAGTTGGCCATAGTGGCATTCAAACATGTGACGACTGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGATTTTTCCAACGGTGGAGCAGCATACTTGTCAAATTTAACTATAGCAAATTACGGTACTATATGCAATGGAAAAAGAGATTATGTTTGGAGAACAGCTACATCGAATGAAGATGGTGTATTTCCAACTTATTTTATGGGTACAAAAACTATTTCAGTTGATATGGATAGTATTGTTTATTACGATAGACCAAATGTAGCTAACGTTCGATTTGATAAATGCAATGATATGGAATGTGATGGTTTAAAATAAGTTCTTGTTATTGATAAAGATGGTGGATTATTTGGTCAACCTAGTGTTATAATACCACAATCAGAATGGCAATATAATCTTAATCCTATATATGGTGTTGGTGATAATCGTATACCTCCAAGAATGTTAACCAAAGTCGATGGAACATCTATTA] [+] EMBL CD114785 [GTGATGAAAGTTCTACAGCAATATGGGAGAAAAATATCGTACATTCGTGTTTAATCGGGATTATGCAATTGAAAACACAGTACAAATGTACCATCATTTCTAATGCTCAAATATATTCAGTTAGTCAATTTCCAGTGTATTGGAGAACAGCTTCAGCTATTCAAGCCAATAATTTACAACTAGTCGATAATGCTGGAGGCATATATCCATTTACTGGTTTTCCTGGAGGACGTAGTCATGAGATCAGCAAAAAAACTTTCCTATTTAATAATTCACTATTAGTTGGCCATAGTGGCATTCAAACATGTGACGACCGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGA TTTTCCAAC ] [+] EMBL CD159923 [ CCAATAATTTACAACTAGTCGATAATGCTGGAGGCATATATCCATTTACTGGTTTTCCTGGAGGACGTAGTCATGAGATCAGCAAAAAAACTTTCCTATTTAATAATTCACTATTAGTTGGCCATAGTGGCATTCAAACATGTGACGACTGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAA ] [+] EMBL CD112299 [ CATGTGACGACTGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGATTTTTCCAACGGTGGAGCAGCATACTTGTCAAATTTAACTATAGCAAATTACGGTACTATATGCAATGGAAAAAGAGATTATGTTTGGAGAACAGCTACATCGAATGAAGATGGTGTATTTCCAACTTATTTTATGGGTACAAAAACTATTTCAGTTGATATGGATAGTATTGTTTATTACGATAGACCAAATGTAGCTAACGTTCGATTTGATAAATGCAATGATATGGAATGTGATGGTTTAAAATAAGTTCTTGTTATTGATAAAGATGGTGGATTATT ] [-] EMBL CD112527 [ ACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACT GTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGATTTTTCCAACGGTGGAGCAGCATACTTGTCAAATTTAACTATAGCAAATTACGGTACTATATGCAATGGAAAAAGAGATTATGTTTGGAGAACAGCTACATCGAATGAAGATGGTGTATTTCCAACTTATTTTATGGGTACAAAAACTATTTCAGTTGATATGGATAGTATTGTTTATTACGATAGACCAAATGTAGCTAACGTTCGATTTGATAAATGCAATGATATGGAATGTGATGGTTTAAAAAAAGTTCTTGTTATTGATAAAGATGGTGGATTATTTGGTCAACCTAGTGTTATAATACCACAATCAGAATGGCAATATAATCTTAATCCTATATATGGTGTTGGTGATAATCGTATACCTCCAAGAATGTTAACCAAAGTCGATGGAACATCTATTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||