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Schistosoma mansoni
cluster # 7163 cluster # 7163       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7163#0 length = 867 sequences # 4  

consensusID : consensus_7163#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 867
fasta sequence
                              [GTGATGAAAGTTCTACAGCAATATGGGAGAAAAATATCGTACATTCGTGTTTAATCGGGATTATGCAATTGAAAACACAGTACAAATGTACCATCATTTCTAATGCTCAAATATATTCAGTTAGTCAATTTCCAGTGTATTGGAGAACAGCTTCAGCTATTCAAGCCAATAATTTACAACTAGTCGATAATGCTGGAGGCATATATCCATTTACTGGTTTTCCTGGAGGACGTAGTCATGAGATCAGCAAAAAAACTTTCCTATTTAATAATTCACTATTAGTTGGCCATAGTGGCATTCAAACATGTGACGACTGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGATTTTTCCAACGGTGGAGCAGCATACTTGTCAAATTTAACTATAGCAAATTACGGTACTATATGCAATGGAAAAAGAGATTATGTTTGGAGAACAGCTACATCGAATGAAGATGGTGTATTTCCAACTTATTTTATGGGTACAAAAACTATTTCAGTTGATATGGATAGTATTGTTTATTACGATAGACCAAATGTAGCTAACGTTCGATTTGATAAATGCAATGATATGGAATGTGATGGTTTAAAATAAGTTCTTGTTATTGATAAAGATGGTGGATTATTTGGTCAACCTAGTGTTATAATACCACAATCAGAATGGCAATATAATCTTAATCCTATATATGGTGTTGGTGATAATCGTATACCTCCAAGAATGTTAACCAAAGTCGATGGAACATCTATTA]

[+] EMBL CD114785             [GTGATGAAAGTTCTACAGCAATATGGGAGAAAAATATCGTACATTCGTGTTTAATCGGGATTATGCAATTGAAAACACAGTACAAATGTACCATCATTTCTAATGCTCAAATATATTCAGTTAGTCAATTTCCAGTGTATTGGAGAACAGCTTCAGCTATTCAAGCCAATAATTTACAACTAGTCGATAATGCTGGAGGCATATATCCATTTACTGGTTTTCCTGGAGGACGTAGTCATGAGATCAGCAAAAAAACTTTCCTATTTAATAATTCACTATTAGTTGGCCATAGTGGCATTCAAACATGTGACGACCGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGA TTTTCCAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD159923             [                                                                                                                                                                     CCAATAATTTACAACTAGTCGATAATGCTGGAGGCATATATCCATTTACTGGTTTTCCTGGAGGACGTAGTCATGAGATCAGCAAAAAAACTTTCCTATTTAATAATTCACTATTAGTTGGCCATAGTGGCATTCAAACATGTGACGACTGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD112299             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATGTGACGACTGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGACCTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACTGGTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGATTTTTCCAACGGTGGAGCAGCATACTTGTCAAATTTAACTATAGCAAATTACGGTACTATATGCAATGGAAAAAGAGATTATGTTTGGAGAACAGCTACATCGAATGAAGATGGTGTATTTCCAACTTATTTTATGGGTACAAAAACTATTTCAGTTGATATGGATAGTATTGTTTATTACGATAGACCAAATGTAGCTAACGTTCGATTTGATAAATGCAATGATATGGAATGTGATGGTTTAAAATAAGTTCTTGTTATTGATAAAGATGGTGGATTATT                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD112527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACTACTGCACAATTTATGAGTCAAACT GTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGATTTTTCCAACGGTGGAGCAGCATACTTGTCAAATTTAACTATAGCAAATTACGGTACTATATGCAATGGAAAAAGAGATTATGTTTGGAGAACAGCTACATCGAATGAAGATGGTGTATTTCCAACTTATTTTATGGGTACAAAAACTATTTCAGTTGATATGGATAGTATTGTTTATTACGATAGACCAAATGTAGCTAACGTTCGATTTGATAAATGCAATGATATGGAATGTGATGGTTTAAAAAAAGTTCTTGTTATTGATAAAGATGGTGGATTATTTGGTCAACCTAGTGTTATAATACCACAATCAGAATGGCAATATAATCTTAATCCTATATATGGTGTTGGTGATAATCGTATACCTCCAAGAATGTTAACCAAAGTCGATGGAACATCTATTA]


>consensus_7163#0 GTGATGAAAGTTCTACAGCAATATGGGAGAAAAATATCGTACATTCGTGTTTAATCGGGA TTATGCAATTGAAAACACAGTACAAATGTACCATCATTTCTAATGCTCAAATATATTCAG TTAGTCAATTTCCAGTGTATTGGAGAACAGCTTCAGCTATTCAAGCCAATAATTTACAAC TAGTCGATAATGCTGGAGGCATATATCCATTTACTGGTTTTCCTGGAGGACGTAGTCATG AGATCAGCAAAAAAACTTTCCTATTTAATAATTCACTATTAGTTGGCCATAGTGGCATTC AAACATGTGACGACTGTCCAGATGAAAATGCTATCCAACTTGCATCGAAACTTCTAGGAC CTACTGCACCTGACGGTAATGGTTATCTTGGCATGACTACTGCACAATTTATGAGTCAAA CTGGTAAACCAGAGAAAGGTGAATTACTGAATTGGATGGAAGATTTTTCCAACGGTGGAG CAGCATACTTGTCAAATTTAACTATAGCAAATTACGGTACTATATGCAATGGAAAAAGAG ATTATGTTTGGAGAACAGCTACATCGAATGAAGATGGTGTATTTCCAACTTATTTTATGG GTACAAAAACTATTTCAGTTGATATGGATAGTATTGTTTATTACGATAGACCAAATGTAG CTAACGTTCGATTTGATAAATGCAATGATATGGAATGTGATGGTTTAAAATAAGTTCTTG TTATTGATAAAGATGGTGGATTATTTGGTCAACCTAGTGTTATAATACCACAATCAGAAT GGCAATATAATCTTAATCCTATATATGGTGTTGGTGATAATCGTATACCTCCAAGAATGT TAACCAAAGTCGATGGAACATCTATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)