These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7179#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 657 fasta sequence [TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAATCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACAACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA] [+] EMBL CD178780 [TAGAAAAATGTTAGATTGCCTTAGTCAGTATTATCAAATGCATATATGCACTTTTGGTAATCGTGTCTATGCACATCAACTTGCTTCAATGATTGATCCAAAACGTAGATATTTTTCACAACGTATTCTATCACGGGATGAATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATGGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACA ] [+] EMBL CD117466 [ AATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCATCCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACCGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTC ] [-] EMBL CD117179 [ ATGCTTTAATCCAGTTACAAAGTCAGCAAATTTAAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGACGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA] [-] EMBL CD117394 [ AAAAGCATTATTTCCTCGTGGTCTCAACCTAGTATGTATTATTGATGATCGTGGTGAAGTATGGGATTGGTCTTCCAATTTAATTCATGTTAAACCATATCGCTTTTTTCCAGATATTGGAGATATTAATGCTTTTCCATGGTCATCTCAATCATCACCATTGTCATCATCTTCAATCCCTACTTCGTCATCTTTTGGTAGTTGTACATCGACCTCAACAAAGGTCACAGAATCCTCCTCCTTCCTGTTATCCAATTGTTCAAATGTTCAGCTGATAGATAAGTCTGATGAAAATGTGAATTCACAGGTTAGTGAAGTTAATGAGAATATTATATCACACGATGTGGAAACAAAGTCAAATAACAATGATAATACTACAACTGCTATCAACAATACTGAAAAACCAGTTCGCTGTACAGTGGATAAGACTAATGATAATCCTTCTGTTACTACTACTGATAATAATGATATCGAATTTTGTCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||