These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7183#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 536 fasta sequence [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG-CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGCAATGTGAATCAGTCATTGTTCGGAATCAGTCCATTCCCCAATTAAGACGAAGTTATTTCGA] [+] EMBL CD152434 [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGCAATGTGAATCAGTCATTGTTCGGAATCAGTCCATTCCCCAATTAAGACGAAGTTATTTCGA] [+] EMBL CD152406 [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGC ] [+] EMBL CD152426 [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGG ] [+] EMBL CD152416 [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTACTACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGATGGGTCGAAATTCATTACATAATACAACTGCTAGCGAACTTGCTCCTGATTGGACGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTGGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAATAACTATGGTTCCACCGGAAATGTCTGCACAC ] [+] EMBL CD152411 [cGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGCAATGTGAATCAGTCATTGTTCGGAATCAGTCCATTCCCCAATTAAGACGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||