Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7183 cluster # 7183       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7183#0 length = 536 sequences # 5  

consensusID : consensus_7183#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 536
fasta sequence
                              [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG-CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGCAATGTGAATCAGTCATTGTTCGGAATCAGTCCATTCCCCAATTAAGACGAAGTTATTTCGA]

[+] EMBL CD152434             [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGCAATGTGAATCAGTCATTGTTCGGAATCAGTCCATTCCCCAATTAAGACGAAGTTATTTCGA]
[+] EMBL CD152406             [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGC                                                             ]
[+] EMBL CD152426             [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGG                                                               ]
[+] EMBL CD152416             [AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTACTACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGATGGGTCGAAATTCATTACATAATACAACTGCTAGCGAACTTGCTCCTGATTGGACGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTGGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAATAACTATGGTTCCACCGGAAATGTCTGCACAC                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD152411             [cGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTCTCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCAGAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAACTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCATTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGG CGTTCTCCTAGAATATTATCACATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCAGTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCCTTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGCAATGTGAATCAGTCATTGTTCGGAATCAGTCCATTCCCCAATTAAGACGA           ]


>consensus_7183#0 AGTCCACCTGTTCCAAATGATCAAAAACGTGCGCAATTAGATAAATTATTGCTAGAATTC TCATGTATTAAATCAACTGGTCTACAGCTTATTGAAAAATTACCTAAAGGCTTATTATCA GAAGATATTATAGTCAACGGACAGATAACTGATGAAGTAATTCGTGTAATACGCCTTAAA CTATACACATTGTGGTTAAAAGTAAGAGAATATGAGTATGCTTTGTTGGGTCGAAATTCA TTAGATAATACAACTGCTAGTGAACTTGCTCCTGATTGGCGTTCTCCTAGAATATTATCA CATTCCTCAAATTCAACAATGAGAAGAGTTGGATCCCTTTTTGATGGTGATTTTAGTCCA GTAACTATGGTTTCACCGCAAATGTCTGCACACGAGCGGAACAATCGACCTTCGAATCCC TTGGCCAATGAATTATGTAATCATAACGGTTCAGAAGAATCAGACGATAGAGGGCAATGT GAATCAGTCATTGTTCGGAATCAGTCCATTCCCCAATTAAGACGAAGTTATTTCGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)