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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7216#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 672 fasta sequence
[TACACTTGCTCTGAAGCGATTAACGTTGGCTAATAACCATCGTTCCTGAAAAAGCACATTAACCTAAACCAATGAACGAGAGTGTTGGCTTCTACATTCCCCT-TGGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG-TCGGTTTTCTGGGCCCTG-TTTTTGTACCGAAA-GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT-GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG-TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG-AAAACAGGATCTATAA-GAATTATCCAACAGCAGT-GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG-AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT-GTGTTACAATTCAATTG-AATGTTTACTTCTCTCCGTGGATTCTCTTTATTAAGTAGAGGAATGAATTGATTTTTCTTATTTCATTTTTGTTATTTTTCATTCACTTCCATGGAAACAAAAACACTCAGAAAATTGATGTTTTTTATATGCTAATTTTTCAGTTAATATTTTTTTTTATTTTGATTATTGATTACCCCCTTTTTTTGTATGTCAAATCGAATTATAACGTTAACATATCAGTTTTATTGATTGAAT-ATACACTNTCTGATCTATTGATTACTAATAATAGTGATTTGTTGAAATATCTATTG]
[+] EMBL CD201191 [TACACTTGCTCTGAAGCGATTAACGTTGGCTAATAACCATCGTTCCTGAAAAAGCACATTAACCTAAACCAATGAACGAGAGTGTTGGCTTCTACATTCCCCT TGGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG AAAACAGGATCTATAA GAATTATCCAACAGCAGT GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT GTGTTACAATTCAATTG AAT ]
[+] EMBL CD083055 [ TGAAAAAGCACATTAACCTAAACCAATGAACGAGAGTGTTGGCTTCTACTTTCCCCTACTGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG AAAACAGGATCTATAA GAATTATCCAACAGCAGT GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT GTGTTACAATTCAATTG AATGTTTACTTCTCTCCGTGGATTCTCTTTATTAAGTAGAGGAATGAATTGATTTTTCTTATTTCATTTTTGTTATTTTTCATTCACTTCCATGGAAACAAAAACACTCAGAAAATTGATGTTTTTTATATGCTAATTTTTCAGTTAATATTTTTTTTTATTTTGATTATTGATTACCCCCTTTTTTTGTATGTCAAATCGAATTATAACGTTAACATATCAGTTTTATTGATTGAAT ATACACTNTCTGATCTATTGATTACTAATAATAGTGATTTGTTGAAATATCTATT ]
[+] EMBL CD078113 [ AGAGTGTTGGCTTCTACATTCCCCT TGGTGTTGTCTCCGCCTTTTGGTTTCTTG TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGA ]
[+] EMBL AA559754 [ cgcCCTTTTGGTTTCTTGTTCGGTTTTCTGGGCCCTGTTTTTTGTACCGAAAGGGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATTGGTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTGTTTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTGAAAAACAGGATCTATAANAAATTATCCAACAGCAGTGGGACGCGCAAATAGATTTGAGAAGAAATCTTATCTCAAAAGTACAATTTTGGTGTTACAATTCAATTGAAATGTTTACTTCTCTC ]
[-] EMBL CD076630 [ ctgn TCGGTTTTCTGGGCCCTG TTTTTGTACCGAAA GGACCCAACAAAATGCTCTTGTCTGTATCGATT GTACTCACCGCTGTCTGTTGCTATTTG TTTTGGATAGGATTTTACCTTGCACAGTACCATCCTTTTTTCGGACCTTCATTG AAAACAGGATCTATAA GAATTATCCAACAGCAGT GGACGCGCAAATAGATTTGAGAAG AATCTTATCTCAAAAGTACAATTTT GTGTTACAATTCAATTG AATGTTTACTTCTCTCCGTGGATTCTCTTTATTAAGTAGAGGAATGAATTGATTTTTCTTATTTCATTTTTGTTATTTTTCATTCACTTCCATGGAAACAAAAACACTCAGAAAATTGATGTTTTTTATATGCTAATTTTTCAGTTAATATTTTTTTTTATTTTGATTATTGATTACCCCCTTTTTTTGTATGTCAAATCGAATTATAAGGTTAACATATCAGTTTTATTGATTGAATAATACACTTTCTGATCTATTGATGACTAATAATAGTGATTTGTTGAAATATCTATTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||