Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 722 cluster # 722       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_722#0 length = 597 sequences # 2  
consensusID : consensus_722#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 597
fasta sequence 
                              [GNAATTTCGGCACGAGGAACATAAACAATTACACAAACATTCATTAATCCCAAAAATTCACATCAAAGTGACTTTTTGTACCTCACCACTTATCATGTCCCTTCATCTCTTATACCAAAAAAACCTTCATTTGTTTTTCATTTAATACCTTTTTTATGAAAATTGAAATCTACATGACTGTCCGAAGATTTTAAACATACAATAAATACTTATTGCGATGAACGGCAAACTGATAGATGGATAGACAGATAGACAGGTTAATCGAGTGATAGATATGCTTGGATATGTGTGTGTAAAGAGATTGAAATTATAATTAAAGCAGTAAGTATTAACCCTAATTGATATGTTTACTCCTCAATTATTTGAAATCTCGTTTCTTTTCAAATCCTTCTTGTACAGTAAGTATCCCTTCGAAAAAAGATGAAATGAGCCTTTTTTGACAAATTATGTTTTGAAGGAGGATGATTCTTTCCTTCATACTTCTATGTGTATTTTGATATAATCACCTGATTCTTATTAAAATATATTCCCTTTGATGTTATGCACAATATGTGTGTTTAACTTATATGTATCAATATGTAATTAAATATAACGATT]

[+] EMBL CD081405             [GNAATTTCGGCACGAGGAACATAAACAATTACACAAACATTCATTAATCCCAAAAATTCACATCAAAGTGACTTTTTGTACCTCACCACTTATCATGTCCCTTCATCTCTTATACCAAAAAAACCTTCATTTGTTTTTCATTTAATACCTTTTTTATGAAAATTGAAATCTACATGACTGTCCGAAGATTTTAAACATACAATAAATACTTATTGCGATGAACGGCAAACTGATAGATGGATAGACAGATAGACAGGTTAATCGAGTGATAGATATGCTTGGATATGTGTGTGTAAAGAGATTGAAATTATAATTAAAGCAGTAAGTATTAACCCTAATTGATATGTTTACTCCTCAATTATTTGAAATCTCGTTTCTTTTCAAATCCTTCTTGTACAGTAAGTATCCCTTCGAAAAAAGATGAAATGAGCCTTTTTTGACAAATTATGTTTTGAAGGAGGATGATTCTTTCCTTCATACTTCTATGTGTATTTTGATATAATCACCTGATTCTTATTAAAATATATTCCCTTTGATGTTATGCACAATATGTGTGTTTAACTTATATGTATCAATATGTAATTAAATATAACGAT ]
[-] EMBL CD075235             [                                                                AAAGTGACTTTTTGTACCTCACCACTANTCATGTCCCTTCATCTCTTATACCAAAAAAACCTTCATTTGTTTTTCATTTAATACCTTTTTTATGAAAATTGAAATCTACATGACTGTCCGAAGATTTTAAACATACAATAAATACTTATTGCGATGAACGGCAAACTGATAGATGGATAGACAGATAGACAGGTTAATCGAGTGATAGATATGCTTGGATATGTGTGTGTAAAGAGATTGAAATTATAATTAAAGCAGTAAGTATTAACCCTAATTGATATGTTTACTCCTCAATTATTTGAAATCTCGTTTCTTTTCAAATCCTTCTTGTACAGTAAGTATCCCTTCGAAAAAAGATGAAATGAGCCTTTTTTGACAAATTATGTTTTGAAGGAGGATGATTCTTTCCTTCATACTTCTATGTGTATTTTGATATAATCACCTGATTCTTATTAAAATATATTCCCTTTGATGTTATGCACAATATGTGTGTTTAACTTATATGTATCAATATGTAATTAAATATAACGATT]




>consensus_722#0
GNAATTTCGGCACGAGGAACATAAACAATTACACAAACATTCATTAATCCCAAAAATTCA
CATCAAAGTGACTTTTTGTACCTCACCACTTATCATGTCCCTTCATCTCTTATACCAAAA
AAACCTTCATTTGTTTTTCATTTAATACCTTTTTTATGAAAATTGAAATCTACATGACTG
TCCGAAGATTTTAAACATACAATAAATACTTATTGCGATGAACGGCAAACTGATAGATGG
ATAGACAGATAGACAGGTTAATCGAGTGATAGATATGCTTGGATATGTGTGTGTAAAGAG
ATTGAAATTATAATTAAAGCAGTAAGTATTAACCCTAATTGATATGTTTACTCCTCAATT
ATTTGAAATCTCGTTTCTTTTCAAATCCTTCTTGTACAGTAAGTATCCCTTCGAAAAAAG
ATGAAATGAGCCTTTTTTGACAAATTATGTTTTGAAGGAGGATGATTCTTTCCTTCATAC
TTCTATGTGTATTTTGATATAATCACCTGATTCTTATTAAAATATATTCCCTTTGATGTT
ATGCACAATATGTGTGTTTAACTTATATGTATCAATATGTAATTAAATATAACGATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)