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Schistosoma mansoni
cluster # 7247 cluster # 7247       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7247#0 length = 948 sequences # 5  

consensusID : consensus_7247#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 948
fasta sequence
                              [CTTTGTGTTAAATTTCTAAGGTCCTATAAGCAACGTAACTTTATGACATTACCGAACGCTTTGATAAAGGTATTGAAGATAAACACTTCCCATCGTGCATGGAGTTTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAAGTTTTCAAAGACCAGCTACGCCACACACAATAATATACTTCCCTGTATTTAGTCAGAATCCCATTTTCGTAAGAGAAAGTTAGTTGACATCATAATTGGGGTCACAGTACATCACAAAATATTTGCTAGCCTGTCGTTTTCAAAGGACTGAGCAGCAATTTATTCAATCCGGTGTCAAGTGCTACCGTTCTCGCAGTTCGAAAAAGGCTATTGTTATTCATTAATAAGGTGACTTCCCCTATATATAAAAAACCACTAGTTGCAGTTTGCTATTACCAATGTCGTACTTGATACTGTACATGTTAGGTCTTCCCAAATCGTCTGTACTACCCAACTTGTTTTATTAGGTAATCGTTAATCCAGAAAGCTTTTAGTTGCGCTTAAAACTCTGGATCACGACTCCCTTGATATTTAGTCAGACAGAATTTCCTTTATGTTATATTTTATCCCTTCGATGATATTCACTTATTTTGGCAGGCTACTAATAAAGTCGACCAGATGGAGACCAGCACTATCCGGCCCCTAAAGCCCCAGAAAAAAAATTAGTGTAGCAACGTATTGTCTATTAGTTTCCAGTTATTGTTATCGCTTTATGAAGTCTTTGCTC]

[-] EMBL CD098174             [CTTTGTGTTAAATTTCTAAGGTCCTATAAGCAACGTAACTTTATGACATTACCGAACGCTTTGATAAAGGTATTGAAGATAAACACTACCCATCGTGCATGGAGTTTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAAGTTTTCAAAGACCAGCTACGCCACACACAATAATATACTTCCCTGTATTTAGTCAGAATCCCATTTTCGTAAGAGAAAGTTAGTTGACATCATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD167257             [                                                    ccAACGCTTTGATAAAGGTATTGAAGATAAACACTTCCCATCGTGCATGGAGTTTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTAGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD167370             [                                                                 AAAGGTATTGAAGATAAACACTTCCCATCGTGCATGGAGTGTGTCTCTTTTTTCTCGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTTGGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAACGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD081321             [                                                                                                                                                                                                                                                gGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTTTTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAAGTTTTCAAAGACCAGCTACGCCACACACAATAATATACTTCCCTGTATTTAGTCAGAATCCCATTTTCGTAAGAGAAAGTTAGTTGACATCATAATTGGGGTCACAGTACATCACAAAATATTTGCTAGCCTGTCGTTTTCAAAGGACTGAGCAGCAATTTATTCAATCCGGTGTCAAGTGCTACCGTTCTCGCAGTTCGAAAAAGGCTATTGTTATTCATTAATAAGGTGACTTCCCCTATATATAAAAAACCACTAGTTGCAGTTTGCTATTACCAATGTCGTACTTGATACTGTACATGTTAGGTCTTCCCAAATCGTCTGTACTACCCAACTTGTTTTATTAGGTAATCGTTAATCCAGAAAGCTTTTAGTTGCGCTTAAAACTCTGGATCACGACTCCCTTGATATTTAGTCAGACAGAATTTCCTTTATGTTATATTTTATCCCTTCGATGATATTCACTTATTTTGGCAGGCTACTAATAAAGTCGACCAGATGGAGACCAGCACTATCCGGCCCCTAAAGCCCCAGAAAAAAAATTAGTGT                                                          ]
[+] EMBL CD068073             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCGATGATATTCACTTATTTT GCA GCTACTANTAAAGTCGACCAGATGGAGACCAGCACTATCCGGCCCCTAAAGCCCAAGAAAAAAAATTAGTGTAGCAACGTATTGTCTATTAGTTTCCAGTTATTGTTATCGCTTTATGAAGTCTTTGCTC]


>consensus_7247#0 CTTTGTGTTAAATTTCTAAGGTCCTATAAGCAACGTAACTTTATGACATTACCGAACGCT TTGATAAAGGTATTGAAGATAAACACTTCCCATCGTGCATGGAGTTTGTCTCTTTTTTCT CGTAACAAGCGATTTTCTACTTATTTTATACCAATTTGAAAGCCCTGTTTAAAAGTTGTT GGTTCCCAACCCTTTTATCATGGGTTTTTCGAAATCTCCACAGTTACTTTTGAGTATAAA CGGTCTGGTAGATCCTGTTTGAAATCTGATTCATTGGTTGGGTTGAGTGCATTATCTTTT TTATTCACCAGTATGGCCGACTGAATGACATTTTAAGTAAAGTTTTCAAAGACCAGCTAC GCCACACACAATAATATACTTCCCTGTATTTAGTCAGAATCCCATTTTCGTAAGAGAAAG TTAGTTGACATCATAATTGGGGTCACAGTACATCACAAAATATTTGCTAGCCTGTCGTTT TCAAAGGACTGAGCAGCAATTTATTCAATCCGGTGTCAAGTGCTACCGTTCTCGCAGTTC GAAAAAGGCTATTGTTATTCATTAATAAGGTGACTTCCCCTATATATAAAAAACCACTAG TTGCAGTTTGCTATTACCAATGTCGTACTTGATACTGTACATGTTAGGTCTTCCCAAATC GTCTGTACTACCCAACTTGTTTTATTAGGTAATCGTTAATCCAGAAAGCTTTTAGTTGCG CTTAAAACTCTGGATCACGACTCCCTTGATATTTAGTCAGACAGAATTTCCTTTATGTTA TATTTTATCCCTTCGATGATATTCACTTATTTTGGCAGGCTACTAATAAAGTCGACCAGA TGGAGACCAGCACTATCCGGCCCCTAAAGCCCCAGAAAAAAAATTAGTGTAGCAACGTAT TGTCTATTAGTTTCCAGTTATTGTTATCGCTTTATGAAGTCTTTGCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)