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Schistosoma mansoni
cluster # 7250 cluster # 7250       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7250#0 length = 1119 sequences # 5  

consensusID : consensus_7250#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1119
fasta sequence
                              [AACAATAGTTATGAAATTATCTAAACGTTCTGCTAATGCTTCACCAGATTCAATTAATTGTTCTAAACATCGATTTGCTTCTAACTGTTTTTTAATATCAGCAATTGACGGACCGATTTGTTGATCCAACTGAAGAGTTTGCTCATTCTCCAATTTATCTAATTGTATACGTATAGCACTTAAAAGCATAGTTTGTCGTCTAAGTAAACTTGCTGTTATACGTTTACCTACAGCAGTATTTAAACGACATAGATTATTCCATCTTGTTGCTAATAATACAGTTTGTCGCTGAATAACAGTAGGATCTAATTCACGAAGTTTTTGTTGTACAATTATTTGTCTTTGCTTTTCCTCCACACTCTCAGAATTCTCTCCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGGTTTAACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTAGACAGCGCCCAACAGCCATTTGACGGCGTGATAAATGAGCTGTTAAATCCTCATGCGTTTCAAACTTATCTCTGGCCTCATCAATGTTTCTTAAAATTGCTGAGTGCATTAATGTTGTTTCATTTGAGTTGGCTCTTTGAAGACGCAGTATGAAATTTTTATCTTCTTCATTATGCACTGACTGTAATTGATCATTTTTATTCATTGTATAACTGTTACTCGTAAAATTTCGCTGATCCTCTTGTAAATCGTTTTGCCCAAATTGTTCTTCCATAGCCAATAACCATGCTAACGTAGTTTCAATTACTGTACCAAAATGATCAGGATCAGGTAGACGATTTATATCACCTGATTCGTCATCTGAATCACCTTCAATTTCATCATCAAGCCAAGAAGTTTCCGACGTACTACATGTTGATGTTGGTGAACATCGACTTTCAACTATGACATTTGGNTCTTCATTTGACTGTCCATGAATCATAGCAGCTGNTTGTATTTCGAGAATACCCTCAGAACGACGCTTCCTATCTCTTTCNACNNNGCTTACGTATTTCTAGAGATAACAGCNAGTGATCTAGCATCAATATTCTCAGGACGCATATCCACTGGNTCCAGTAGTCTTGGN]

[-] EMBL CD202214             [AACAATAGTTATGAAATTATCTAAACGTTCTGCTAATGCTTCACCAGATTCAATTAATTGTTCTAAACATCGATTTGCTTCTAACTGTTTTTTAATATCAGCAATTGACGGACCGATTTGTTGATCCAACTGAAGAGTTTGCTCATTCTCCAATTTATCTAATTGTATACGTATAGCACTTAAAAGCATAGTTTGTCGTCTAAGTAAACTTGCTGTTATACGTTTACCTACAGCAGTATTTAAACGACATAGATTATTCCATCTTGTTGCTAATAATACAGTTTGTCGCTGAATAACAGTAGGATCTAATTCACGAAGTTTTTGTTGTACAATTATTTGTCTTTGCTTTTCCTCCACACTCTCAGAATTCTCTCCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGGTTTAACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD153356             [AACAATAGTTATGAAATTATCTAAACGTTCTGCTAATGCTTCACCAGATTCAATTAATTGTTCTAAACATCGATTTGCTTCTAACTGTTTTTTAATATCAGCAATTGACGGACCGATTTGTTGATTCAACTGAAGAGTTTGCTCATTCTCCAATTTATCTAATTGTATACGTATAGCACTTAAAAGCATAGTTTGTCGTCTAAGTAAACTTGCTGTTATACGTTTACCTACAGCAGTATTTAAACGACATAGATTATTCCATCTTGTTGCTAATAATACAGTTTGTCGCTGAATAACAGTAGGATCTAATTCACGAAGTTTTTGTTGTACAATTATTTGTCTTTGCTTTTCCTCCACACTCTCAGAATTCTCTCCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGGTTTAACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD156520             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTCTCTTCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTGATTTGACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACGATTACCAAGACGTAGACAGCGCCCAACAGCCATTTGACGGCGTGATAAATGAGCTGTTAAATCCTCATGCGTTTCAAACTTATCTCTGGCCTCATCAATGTTTCTTAAAATTGCTGAGTGCATTAATGTTGTTTCATTTGAGTTGGCTCTTTGAAGACGCAGTATGAAATTTTTATCTTCTTCATTATGCACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD196066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTAAACGATTACCAAGACGTACACAGCGCCCAACAGCCATTTGACGGCGAGATAAATGAGCTGTTAAATCCTCATGCGTGTCAAACTTATCTCTGGACTCATCAATGTTTCTTAAAATTGCTGAGTGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD181453             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTTGTTTCATTTGAGTTGGCTCTTTGAAGACGCAGTATGAAATTTTTATCTTCTTCATTATGCACTGACTGTAATTGATCATTTTTATTCATTGTATAACTGTTACTCGTAAAATTTCGCTGATCCTCTTGTAAATCGTTTTGCCCAAATTGTTCTTCCATAGCCAATAACCATGCTAACGTAGTTTCAATTACTGTACCAAAATGATCAGGATCAGGTAGACGATTTATATCACCTGATTCGTCATCTGAATCACCTTCAATTTCATCATCAAGCCAAGAAGTTTCCGACGTACTACATGTTGATGTTGGTGAACATCGACTTTCAACTATGACATTTGGNTCTTCATTTGACTGTCCATGAATCATAGCAGCTGNTTGTATTTCGAGAATACCCTCAGAACGACGCTTCCTATCTCTTTCNACNNNGCTTACGTATTTCTAGAGATAACAGCNAGTGATCTAGCATCAATATTCTCAGGACGCATATCCACTGGNTCCAGTAGTCTTGGN]


>consensus_7250#0 AACAATAGTTATGAAATTATCTAAACGTTCTGCTAATGCTTCACCAGATTCAATTAATTG TTCTAAACATCGATTTGCTTCTAACTGTTTTTTAATATCAGCAATTGACGGACCGATTTG TTGATCCAACTGAAGAGTTTGCTCATTCTCCAATTTATCTAATTGTATACGTATAGCACT TAAAAGCATAGTTTGTCGTCTAAGTAAACTTGCTGTTATACGTTTACCTACAGCAGTATT TAAACGACATAGATTATTCCATCTTGTTGCTAATAATACAGTTTGTCGCTGAATAACAGT AGGATCTAATTCACGAAGTTTTTGTTGTACAATTATTTGTCTTTGCTTTTCCTCCACACT CTCAGAATTCTCTCCATCGATAGCATCAACACCAGTTCGAACACTGTTTGATTCCTTTTG GTTTAACACTTCACTATTCTTCAAAATATTATCTAAGTTTTCATGTGTTTTTATTAAACG ATTACCAAGACGTAGACAGCGCCCAACAGCCATTTGACGGCGTGATAAATGAGCTGTTAA ATCCTCATGCGTTTCAAACTTATCTCTGGCCTCATCAATGTTTCTTAAAATTGCTGAGTG CATTAATGTTGTTTCATTTGAGTTGGCTCTTTGAAGACGCAGTATGAAATTTTTATCTTC TTCATTATGCACTGACTGTAATTGATCATTTTTATTCATTGTATAACTGTTACTCGTAAA ATTTCGCTGATCCTCTTGTAAATCGTTTTGCCCAAATTGTTCTTCCATAGCCAATAACCA TGCTAACGTAGTTTCAATTACTGTACCAAAATGATCAGGATCAGGTAGACGATTTATATC ACCTGATTCGTCATCTGAATCACCTTCAATTTCATCATCAAGCCAAGAAGTTTCCGACGT ACTACATGTTGATGTTGGTGAACATCGACTTTCAACTATGACATTTGGNTCTTCATTTGA CTGTCCATGAATCATAGCAGCTGNTTGTATTTCGAGAATACCCTCAGAACGACGCTTCCT ATCTCTTTCNACNNNGCTTACGTATTTCTAGAGATAACAGCNAGTGATCTAGCATCAATA TTCTCAGGACGCATATCCACTGGNTCCAGTAGTCTTGGN



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)