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Schistosoma mansoni
cluster # 7258 cluster # 7258       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7258#0 length = 970 sequences # 5  

consensusID : consensus_7258#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 970
fasta sequence
                              [AGCTTTTAATGAAAAGCTTAGTTGTGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTCTGGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACAAAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAACCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGTGGGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGTGGGATTGGATAAAGAATTTTCAGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACGAAATGTTTCCTCCCAGCAGTGGCAAAACAATTAGGTTTAAAACATGTCCGTGGTATTCTGTTATACGGTCCACCTGGTACTGGTAAAACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACATGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA-TTCGC--TGATGCTGAAG-AGGAAGAAAAACGCATG-GGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAGGTGGAGGTGCTGGTGG]

[+] EMBL BF936679             [AGCTTTTAATGAAAAGCTTAGTTGTGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTCTGGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACAAAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAACCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGTGGGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGTGGGATTGGATAAAGAATTTTCAGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACGAAATGTTTCCTCCCAGCAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD181812             [                 cgactgacGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATTTCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTTTAGCTCAGCGTAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTTGGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTCGATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD114065             [                                                                                                                                                                                                                                                                              GGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGATACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACANAATGACTCTCCTTGTTGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAATTGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAGCCAGATTCTAAATTATTGTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGT GGTGGTGGCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGT GGATTGGATAAAGAATTTTCCGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACG AATGTTTCCT CCAGCAGTTGCAAAACAATTAGGTTTAAAACATGTCCGTGGTATTCTGTTATACGGTCCACCTGGTACTGGTAAAACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACATGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA TT                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD180779             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACGTGAACCTAAAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCCGTAAATTA TTCGC  TGATGCTGAAG AGGAAGAAAAACGCATG GGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAG                ]
[+] EMBL CD092923             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGTAAATTATTTCGCNNTGATGCTGAAGAAGGAAGAAAAACGCATGNGGTGCGAAATCTGCATTGCATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAGGTGGAGGTGCTGGTGG]


>consensus_7258#0 AGCTTTTAATGAAAAGCTTAGTTGTGTAGCCATACACACTGCGGCTGATAAATATGTATT TCGTGGGGGTTCACACGATCATGTCCCTCAAGGAAAGGTTGCGTTTGGTCTGGCTCAGCG TAAATGGGGCAATATTTCAGTAGATGAACCTTTAGATGTTCAACCATACACATTTAATTT GGCTCGTGAATGTCTAGCTTCTGCAGTTTTGGCTGTGGATTTTAATAATAAAAAAATGTC GATCAATGAGCCATTGGATTCAGATCGAATGGCTCTAGAATTCAGCATGCAATTCGCAGA TACACCATTGACCGTTGGTCAGCATATTCTTTATCGGTTTAACAAAATGACTCTCCTTGT TGAGGTTAAGAAATTGTCAACTTTGTCAATGGATGGCGGAGATGTTGACAATAGTAAAAT TGGCATGTTAACTGGGAATACAGTAATTCGTTGGATGCCTCAACCAGATTCTAAATTATT GTTGATTGGTAAAGCTGCATTGGATGACGATGGCGCTAGTTCTATTGGAGGTGGGTGGTG GCTATCATAGTATCATCAATCCAAATTGGGATTTTAATCAAATGGGTATCGGTGGGATTG GATAAAGAATTTTCAGCTATATTCCGACGAACATTTGCATCACGAAATGTTTCCTCCCAG CAGTGGCAAAACAATTAGGTTTAAAACATGTCCGTGGTATTCTGTTATACGGTCCACCTG GTACTGGTAAAACACTAATGGCACGACAAATTGGTAAAATGCTTAATGCACATGAACCTA AAATTGTCAATGGTCCAAGTATATTAGATAAATATGTTGGTGAATCTGAAGCGAATATCC GTAAATTATTCGCTGATGCTGAAGAGGAAGAAAAACGCATGGGTGCGAAATCTGCATTGC ATATTATTATATTTGATGAAATTGATGCCATTTGTAAATCACGTGGATCTACAGGTGGAG GTGCTGGTGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)