These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7265#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 695 fasta sequence [TTTGCTGGAGGGGCTCGAGGCCAGAGACAAGGTGATGGAGGCCGGAGCCGACCCCCAGTTTGCCGTAGGTGTAATAACCGACATTTCGGCGAGTGCAAGCGTGGCAGCGGTGGTTGTTACACGTGTGGGCAGATGGGACATAGAGCTGTGAATTGTCCCCAGGGTCAGCAGCAGAAGCCGCAGCAGACCTTTATGCCGCCACCTGCATCGATTCTGCAAATTCAGGGTCCGAGTAGTTATGGTCAAGCAGGTAGAGGTGGTGCCTACCACTACCAGGGTGATGCTGTTCCTTATGCTCCGGGACAGTATCAGCACCCCCAGGACCCGTATTCACAGGGTAGTTATCCCCCATATCCCAGCAGCTACATGCCGTATCCTCCAGCTCCAGTAGGTGGCTCTAAGTGGTACCAGGGAGGACAATATCAGCATGGTGAGATTGCCACTAGTAGTGCAGGGTCTTCGAGACAATTGGGTCAGCCCAGTCAGGAGCGTGGAGCTCAAGATCGCGGTGTTCAGGCGAGCAGAGGTCGCGGTGGACGACAGCAGGGCCAGGGCGTATTCACAATATTTCCCTGCAGGATGCTCAGAACAACCCGGATCTAATTATGGGTACGTTAAACATTCTTGGTTATTTTGCTAGAGTCTTAATTGATTGTGGAGCTACACATTCCGTTATTTCTCATACATTTGCTCAA] [+] EMBL CD123782 [TTTGCTGGAGGGGCTCGAGGCCAGAGACAAGGTGATGGAGGCCGGAGCCGACCCCCAGTTTGCCGTAGGTGTAATAACCGACATTTCGGCGAGTGCAAGCGTGGCAGCGGTGGTTGTTACACGTGTGGGCAGATGGGACATAGAGCTGTGAATTGTCCCCAGGGTCAGCAGCAGAAGCCGCAGCAGACCTTTATGCCGCCACCTGCATCGATTCAGCAAATTCAGGGTCCGAGTAGTTATGGTCAAGCAGGTAGAGGTGGTGCCTACCACTACCAGGGTGATGCCGTTCCTTATGCTCCGGGACAGTATCAGCACCCCCAGGACCCGTATTCACAGGGTGGTTATCCCCCATATCCCAGCAGCTACATGCCGTATCCTCCAGCTCCAGTAGGTGGCTCTAAGTGGTACCAGGGAGGACAATATCAGCATGGTGAGATTGCCACTAGTAGTGCAGGGTCTTCGAGACAATTGGGTCAGCCCAGTCAGGAGCGTGGAGCTCAAGATCGCGGTGTTCAGGCGAGCAGAGGTCGCGGTGGACGACAGCAGGGCCAGGGCGTATTCACAATATTTCCCTGCAGGATGCTCAGAACAACCCGGATCTAATTATGGGTACGTTAAACATTCTTGGTTATTTTGCTAGAGTCTTAATTGATTGTGGAGCTACACATTCCGTTATTTCTCATACATTTGCTCAA] [+] EMBL CD123792 [TTTGCTGGAGGGGCTCGAGGCCAGAGACAAGGTGATGGAGGCCGGAGCCGACCCCCAGTTTGCCGTAGGTGTAATAACCGACATTTCGGCGAGTGCAAGCGTGGCAGCGGTGGTTGTTACACGTGTGGGCAGATGGGACATAGAGCTGTGAATTGTCCCCAGGGTCAGCAGCAGAAGCCGCAGCAGACCTTTATGCCGCCACCTGCATCGATTCAGCAAATTCAGGGTCCGAGTAGTTATGGTCAAGCAGGTAGAGGTGGTGCCTACCACTACCAGGGTGATGCCGTTCCTTATGCTCCGGGACAGTATCAGCACCCCCAGGACCCGTATTCACAGGGTGGTTATCCCCCATATCCCAGCAGCTACATGCCGTATCCTCCAGCTCCAGTAGGTGGCTCTAAGTGGTACCAGGGAGGACAATATCAGCATGGTGAGATTGCCACTAGTAGTGCAGGGTCTTCGAGACAATTGGGTCAGCCCAGTCAGGAGCGTGGAGCTCAAGATCGCGGTGTTCAGGCGAGCAGAGG ] [+] EMBL CD123775 [TTTGCTGGAGGGGCTCGAGGCCAGAGACAAGGTGATGGAGGCCGGAGCCGACCCCCAGTTTGCCGTAGGTGTAATAACCGACATTTCGGCGAGTGCAAGCGTGGCAGCGGTGGTTGTTACACGTGTGGGCAGATGGGACATAGAGCTGTGAATTGTCCCCAGGGTCAGCAACAGAAGCCGCAGCAGACCTTTATGCCGCCGCCTGCGTCGATTCTGCAAATTCAGGGTCCGAGTAGTTATGGTCAAGCAGGTAGAGGTGGTGCCTACCACTACCAGGGTGATGCTGTTCCTTATGCTCCGGGACAGTATCAGCACCCCCAGGACCCGTATTCACAGGGTAGTTATCCCCCATAT CCAGCAGCTACATGCCGTATCCTCCAGCTCCAGTAGGTGGCTCTAAGTGGTACCAGGGAGGACAATATCAGCATGGTGAGATTGCCACTAGTAGTGCAGGGTCTTCGAGACAATTGGGTCAGCCCAGTCATGAGCGTGGA ] [+] EMBL CD123778 [TTTGCTGGAGGGGCTCGAGGCCAGAGACAAGGTGATGGAGGCCGGAGCCGACCCCCAGTTTGCCGTAGGTGTAATAACCGACATTTCGGCGAGTGCAAGCGTGGCAGCGGTGGTTGTTACACGTGTGGGCAGATGGGACATAGAGCTGTGAATTGTCCCCAGGGTCAGCAGCAGAAGCCGCAGCAGACCTTTATGCCGCCACCTGCATCGATTCTGCAAATTCAGGGTCCGAGTAGTTATGGTCAAGCAGGTAGAGGTGGTGCCTACCACTACCAGGGTGATGCTGTTCCTTATGCTCCGGGACAGTATCAGCACCCCCAGGACCCGTATTCACAGGGTAGTTATCCCCCATATCCCAGCAGCTACATGCCGTATCCTCCAGCTCCAGTAGGTGGCTCTAAGTGGTACCAGGGAGGACAATATCAGCATGGTGAGATTGCCACTAGTAGTGCAGGGTCTTCGAGACAATT ] [+] EMBL CD123773 [TTTGCTGGAGGGGCTCGAGGCCAGAGACAAGGTGATGGAGGCCGGAGCCGACCCCCAGTTTGCCGTAGGTGTAATAACCGACATTTCGGCGAGTGCAAGCGTGGCAGCGGTGGTTGTTACACGTGTGGGCAGATGGGACATAGAGCTGTGAATTGTCCCCAGGGTCAGCAGCAGAAGCCGCAGCAGACCTTTATGCCGCCACCTGCATCGATTCTGCAAATTCAGGGTCCGAGTAGTTATGGTCAAGCAGGTAGAGGTGGTGCCTACCACTACCAGGGTGATGCTGTTCCTTATGCTCCGGGACAGTATCAGCACCCCCAGGACCCGTATTCACAGGGTAGTTATCCCCCATATCCCAGCAGCTACATGCCGTATCCTCCAGCTCCAGTAGGTGGCTCTAAGTGGTACCAGGGAGGACAATATCAGCATGGTGAGATTGCCA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||