These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7280#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 827 fasta sequence [GTGTACGAAGACTAAATTCTTTAACTATCCTCTACAAACGTTTTTTCATGTCCTCTTGGACTCTCATGTACAAACTTTGGATCATGTAACTTTAGCTTGTCGTGCTGCTCGTGTAGCAAATCATTATGGATTAACTGCATCAAATCCATCAGTTCAAGCTTATTTACCAAATAATTTATTATTTTTCTTACAAATGCATCAGTAAATAAGGGCAGGGGTTAAACAGCTACATGGTTATAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT-CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT-CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATCCAATAAGAGAATAGA] [+] EMBL CD082306 [GTGTACGAAGACTAAATTCTTTAACTATCCTCTACAAACGTTTTTTCATGTCCTCTTGGACTCTCATGTACAAACTTTGGATCATGTAACTTTAGCTTGTCGTGCTGCTCGTGTAGCAAATCATTATGGATTAACTGCATCAAATCCATCAGTTCAAGCTTATTTACCAAATAATTTATTATTTTTCTTACAAATGCATCAGTAAATAAGGGCAGGGGTTAAACAGCTACATGGTTATAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCTCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTNTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTNNTCTTTGNTNCTATGGCTATGCACACACATACACACATTTNCTTTCTGTACAGATTTATTNTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCNTCCANNTAGAGAt ] [+] EMBL CD078812 [ AGCAAATCATTATGGATTAACTGCATCAAATCCATCAGTTCAAGCTTATTTACCAAATAATTTATTATTTTTCTTACAAATGCATCAGTAAATAAGGGCAGGGGTTAAACAGCTACATGGTTATAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGGTTCTATGGCTATGCACACACAT ] [-] EMBL CD073272 [ TGGTANTAGGGCTTTTTTCTACTTTAAATTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCT CCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCACAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATACAATAAGAGAAT ] [-] EMBL CD075908 [ TTAAAACTAAAACCTTTGTTTACCCTAAATGGTTGGTTGTTCACCTCCCCTCCCCTGTTCCCAGTTTTCTCAAAGCTTAGTTCGATCGTTAATAATATTAAATGAAGTATTCAAAATAGCCCAATATCCATGTACACAACTACTTCCCCCTCCCGAATTATTATAGTTTTAATCTGTTTATATGAGTTGTTTGCCGCCACTCCCCTCTCTTTTTCCCAGTTTTTATCCATTCCTCCTACACATATTTAAACCCAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATCCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATCCAATAAGAGAAT ] [-] EMBL AI975157 [ CTGTTTATATGAGTTGTGNGCCGCCACTCCCCCCTCTCTCTCCCAGTTTCTATCCATTCCTCGTACACATATTTAAACACAGAAACCTTTATACCCATTGCGCCAACATGTTGCTATGACATATAAATGCCGTTTGTTTTTTTGAGTGTTTGATTCAATTTGGTTAATTTATTAAAATATTTTTTTGATTTTTGATTGTGTGTGATATTTATTGTTGAAGCCCATTAGTTTACTGTGACTAGTATTAATACTACTATTACTATTACTATGATCTTTTTTTCTATTTTTCTTTGTTTCTATGGCTATGCACACACATACACACATTT CTTTCTGTACAGATTTATTTTTAAAATGGATGAATGAATACTTTGATATTGCATACAATAAGAGAATAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||