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Schistosoma mansoni
cluster # 7305 cluster # 7305       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7305#0 length = 905 sequences # 5  

consensusID : consensus_7305#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 905
fasta sequence
                              [TGACGATATGCGCAGTGTCCCAGAGAGAGGTTCAAGTCTTGGGGGTACTGGTCGTCGAAGCGGAAGCAATCGCCAGCCTCTTAATCTTAGTCCACAGCTTAGTTCCGGTCACAACACTACCTACCCAACTACTTCAAGTGCACCTGCAGTCGGCACTGCCAACTCGAATTCTGGGCGTCCGTCTCAGGCGTCCGAGGTCCCAGCTTCAACCCGGTGGAAGCAATCATCTAAAAATGTTCAGTCTGGTCCCGGTGCTTATTCATTCATAGTGTTACCTAATGGACAAACTCGGCCGTGTGCATTGGCGTCTGCCCCTGGAGCGACTACTGCCCAGGGATTGCCTCGTCGACTTCAGTACCTTGCTAGTTTACCTCATGGTGACGTCGTTTGTGCTGTCACTTTAGGTCCATGTCCAGTAGGACGTGCTTCTTCATTGGCCTCAGCTGATACCTGTCTTGGATCTCGTAATGCTGGAAGTGATACTGATAGTGTTACAGTTGGTTCTCCAGGGTCAAATCACACCACTTCTATCCCCGCTCACTTTGCCTATACCGGTGCTCGAGGCAGCGTCAAGTTATGGGATCTTGCATCGATTAGTGCTAACTCTGGAAATACCCCACTTGCTAATAGAGATATTACTCCCCTTGCTACTTTTGACTGTTTGTGCTACGACAGCTATGTTAGATCTATCAAACTTTTCCCGGATGTTTCTGGTCTCATAGTCGGTGGGGAATCCAACGCACTTACTGTTTGGGATTTAAATGGTCCAGGAAGACGTAAAGCTGAACTGACATTTGAAGCGCCTGCTTGCTATGCACTTGCACTTTCGCTTGATGGAAAACTGGCCTATAGTTGCTGCTCCGATGGTCAAGTTGCTGTTTGGGATATACATAATCAAAGTATCG]

[-] EMBL CD186501             [TGACGATATGCGCAGTGTCCCAGAGAGAGGTTCAAGTCTTGGGGGTACTGGTCGTCGAAGCGGAAGCAATCGCCAGCCTCTTAATCTTAGTCCACAGCTTAGTTCCGGTCACAACACTACCTACCCAACTACTTCAAGTGCACCTGCAGTCGGCACTGCCAACTCGAATTCTGGGCGTCCGTCTCAGGCGTCCGAGGTCCCAGCTTCAACCCGGTGGAAGCAATCATCTAAAAATGTTCAGTCTGGTCCCGGTGCTTATTCATTCATAGTGTTACCTAATGGACAAACTCGGCCGTGTGCATTGGCGTCTGCCCCTGGAGCGACTACTGCCCAGGGATTGCCTCGTCGACTTCAGTACCTTGCTAGTTTACCTCATGGTGACGTCGTTTGTGCTGTCACTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD149665             [                                      TTGGGGGTACTGGTCGTCGAAGCGGAAGCAATCGCCAGCCTCTTAATCTTAGTCCACAGCTTAGTTCCGGTCACAACACTACCTACCCAACTACTTCAAGTGCACCTGCAGTCGGCACTGCCAACTCGAATTCTGGGCGTCCGTCTCAGGCGTCCGAGGTCCCAGCTTCAACCCGGTGGAAGCAATCATCTAAAAATGTTCAGTCTGGTCCCGGTGCTTATTCATTCATAGTGTTACCTAATGGACAAACTCGGCCGTGTGCATTGGCGTCTGCCCCTGGAGCGACTACTGCCCAGGGATTGCCTCGTCGACTTCAGCACCTTGCTAGTTTACCTCATGGTGACGTCGTTTGTGCTGTCACTTTAGGTCCATGTCCAGTAGGACGTGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD183385             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTCGTTTGTGCTGTCACTTTAGGTCCATGTCCAGTAGGACGTGCTTCTTCATTGGCCTCAGCTGATACCTGTCTTGGATCTCGTAATGCTGGAAGTGATACTGATAGTGTTACAGTTGGTTCTCCAGGGTCAAATCACACCACTTCTATCCCCGCTCACTTTGCCTATACCGGTGCTCGAGGCAGCGTCAAGTTATGGGATCTTGCATCGATTAGTGCTAACTCTGGAAATACCCCACTTGCTAATAGAGATATTACTCCCCTTGCTACTTTTGACTGTTTGTGCTACGACAGCTATGTTAGATCTATCAAACTTTTCCCGGATGTTTCTGGTCTCATAGTCGGTGGGGAATCCAACGCACTTACTGTTTGGGA                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD169214             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATACTGATAGTGTTACAGTTGGTTCTCCAGGATCAAATCACACCACTTCTATCCCCGCTCACTTTGCCTATACCGGTGCTCGAGGCAGCGTCAAGTTATGGGATCTTGCATCGATTAGTGCTAACTCTGGAAATACCCCACTTGCTAATAGAGATATTACTCCCCTTGCTACTTTTGACTGTTTGTGCTACGACAGCTATGTTAGATCTATCAAACTTTTCCCGGATGTTTCTGGTCTCATAGTCGGTGGGGAATCCAACGCACTTACTGTTTGGGATTTAAATGGTCCAGGAAGACGTAAAGCTGAACTGACATTTGAAGCGCCTGCTTGCTATGCACTTGCACTTTCGCTTGATGGAAAACTGGCCTATAGTTGCTGCTCCGATGGTCAAGTTGCTGTTTGGGATATACATAATCAAAGTATCG]
[-] EMBL CD188991             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACACCACTTCTATCCCCGCTCACTTTGCCTATACCGGTGCTCGAGGCAGCGTCAAGTTATGGGATCTTGCATCGATTAGTGCTAACTCTGGAAATACCCCACTTGCTAATAGAGATATTACTCCCCTTGCTACTTTTGACTGTTTGTGCTACGACAGCTATGTTAGATCTATCAAACTTTTCCCGGATGTTTCTGGTCTCATAGTCGGTGGGGAATCCAACGCACTTACTGTTTGGGAT                                                                                                                                                    ]


>consensus_7305#0 TGACGATATGCGCAGTGTCCCAGAGAGAGGTTCAAGTCTTGGGGGTACTGGTCGTCGAAG CGGAAGCAATCGCCAGCCTCTTAATCTTAGTCCACAGCTTAGTTCCGGTCACAACACTAC CTACCCAACTACTTCAAGTGCACCTGCAGTCGGCACTGCCAACTCGAATTCTGGGCGTCC GTCTCAGGCGTCCGAGGTCCCAGCTTCAACCCGGTGGAAGCAATCATCTAAAAATGTTCA GTCTGGTCCCGGTGCTTATTCATTCATAGTGTTACCTAATGGACAAACTCGGCCGTGTGC ATTGGCGTCTGCCCCTGGAGCGACTACTGCCCAGGGATTGCCTCGTCGACTTCAGTACCT TGCTAGTTTACCTCATGGTGACGTCGTTTGTGCTGTCACTTTAGGTCCATGTCCAGTAGG ACGTGCTTCTTCATTGGCCTCAGCTGATACCTGTCTTGGATCTCGTAATGCTGGAAGTGA TACTGATAGTGTTACAGTTGGTTCTCCAGGGTCAAATCACACCACTTCTATCCCCGCTCA CTTTGCCTATACCGGTGCTCGAGGCAGCGTCAAGTTATGGGATCTTGCATCGATTAGTGC TAACTCTGGAAATACCCCACTTGCTAATAGAGATATTACTCCCCTTGCTACTTTTGACTG TTTGTGCTACGACAGCTATGTTAGATCTATCAAACTTTTCCCGGATGTTTCTGGTCTCAT AGTCGGTGGGGAATCCAACGCACTTACTGTTTGGGATTTAAATGGTCCAGGAAGACGTAA AGCTGAACTGACATTTGAAGCGCCTGCTTGCTATGCACTTGCACTTTCGCTTGATGGAAA ACTGGCCTATAGTTGCTGCTCCGATGGTCAAGTTGCTGTTTGGGATATACATAATCAAAG TATCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)