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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7319#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 946 fasta sequence
[GTTTGTGAAAGCTAATTCAGTCCTAACAAGATATAGGCAAAAGAACATTACAACAAAATATAACAAGATTATAGAAGCCATTCTTGCTAGTTCGTTAACTACCACTTTATGTTTTTCAATAATGTGGGCTGTTCGTGATTGTAGTCCATTAGCATATACTAGCAGTTCTTTCCCTCTCAGGATGATGTGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACACCTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT--GGGGCCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTATAATGGAGGCAACAGGAAACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTATAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGGTTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAATGGATTTGTTCAGAGCATTTAGCACTACTGTTGCAAAAACGTGTATGTTACCTTTTCTCGTTGTAATTTTCTTTTTCTCTTATCAA]
[+] EMBL CD129514 [GTTTGTGAAAGCTAATTCAGTCCTAACAAGATATAGGCAAAAGAACATTACAACAAAATATAACAAGATTATAGAAGCCATTCTTGCTAGTTCGTTAACTACCACTTTATGTTTTTCAATAATGTGGGCTGTTCGTGATTGTAGTCCATTAGCATATACTAGCAGTTCTTTCCCTCTCAGGATGATGTGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACACCTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT GGGGCCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGCAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAAC ]
[-] EMBL CD180534 [ TGTGCGGACAACGAGTTTAATTCAATTTCCTCACTATTATTTTCAACAACTGAACGTTCTCTCCGAACTCTGCTTCACGATCCTCCAATGACATACAGTATTTCAGTATTAACCATATTTGTGCTCGTATACTATTTCTTGGCTTGTATTACGTATGGTTTGTCTGTTCCTGCTGGTCTATTCATACCGTCTTTGTTGATTGGTGCTGGCT GGGGCCGAATCATA ]
[-] EMBL BG931166 [ tATT GTGATGGATGGGGGGTCGAATCATAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTATAATGGAGGCAACAGGAAACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGAa ]
[-] EMBL CD113390 [ TAGGTAATTTAATGCATACTGTTGATCCAATTCATTTCTCCGATCCCGGTAAATTCGCACTGATTGGCGCTGCTGCACAATTAGGTGGTATTGTTCGAATGACATTAAGTCTAACAGTTATTCTAATGGAGGCAACAGGATACGTAATTGTTGGATTACCATTGCTAATGACTTTGACTGTTGCTAAATATATGGGTGATTGTTTAAGCGAAGGGATCTATGATGAACATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTATAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGGTTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAATGGATTTGTTCAGAGCAT ]
[-] EMBL CD117467 [ ATATTGGGTTGAATAGTATGGCTTTACTTCCGTGGACACCGCATTCTCTATCTGTAACTAAGAGAGCCTATGACCTGATGTCTAATCCAGTTGTGTATTTATATCCTATCATGCGTGTTAGTGAATTAGTTGAACGGATTGCAAATAATTTACATCATGGATTTCCAGTTGTAGTGGGTTCTACAGATTCATCAAGATTTTCATATGGTACTTTAGTTGGAAT GATTTCTTCAGAGCATTTAGCACTACTGTTGCAAAAACGTGTATGTTACCTTTTCTCGTTGTAATTTTCTTTTTCTCTTATCAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||