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Schistosoma mansoni
cluster # 7326 cluster # 7326       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7326#0 length = 842 sequences # 5  

consensusID : consensus_7326#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 842
fasta sequence
                              [ACGAGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCAATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAG-AAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGATTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACTCAATATTACCAGTTGTTTTTCGATGATAAGCATTATTACTTTCATAATCATCCGAGAAGTATCCTGCCTCTTCAGGAGATGATGTCTGTGATGGATCTGGTGTTTTACTACGACATCTTACGTCGATTGCTGAAGAATGTAAAGGAATTTTAGCGGTAGGTGGAGCATTCAACAACCCAGTTTTAGGCAAATTGTAAGGACGTTCATAATTCTCTTGATCAAATTCTTCTCGCATTAAAACTGGACTAGATATAACAAGATCAATTGGAGCTAGCATTGATTGTACAGAAGAATGTTGATGTAATGAATCTTGATAAGTTAAATCATGTGAACCAGAATCTGAGCTAATAACACTTGGATTAGTTTGTCTTCGTCTTCTCCACCATAACCAACTA-TGCTA-TACTAGTGTTCATTGTATTCGATTGATTAGTTTGTATTTCTGGTTCACAATCATCAGTTGTTTCATTAAATGATGAACTCATCAATGGGAATTCTGAGCCACGATCACGTTTATGTTGTTCG]

[+] EMBL CD170766             [ACGAGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCAATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAG AAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGATTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACTCAATATTACCAGTTGTTTTTCGATGATAAGCATTATTACTTTCATAATCATCCGAGAAGTATCCTGCCTCTTCAGGAGATGATGTCTGTGATGGATCTGGTGTTTTACTACGACATCTTACGTCGACTGCTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD170727             [ACGAGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCGATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAGAAAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGATTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACTCAATATTACCAGTTGTTTTTCGATGATAAGCATTATTACTTTCATAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD188135             [   AGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGCTATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGATTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCAATGCCAAAGGTATATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAG AAAAAACTGCTTCATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGGTTTGCTTGTTGAATTGGAATCCTTGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD197427             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACTTTCATAATCATCCGAGAAGTATCCTGCCTCTTCAGGAGATGATGTCTGTGATGGATCTGGTATTTTACTACGACATCTTACGTCGATTGCTGAAGAATGTAAAGGAATTTTAGCGGTAGGTGGAGCATTCAACAACCCAGTTTTAGGCAAATTGTAAGGACGTTCATAATTCTCTTGATCAAATTCTTCTCGCATTAAAACTGGACTAGATATAACAAGATCAATTGGAGCTAGCATTGATTGTACAGAAGAATGTTGATGTAATGAATCTTGATAAGTTAAATCATGTGAACCAGAATCTGAGCTAATAACACTTGGATTAGTTTGTCTTCGTCTTCTCCACCATAACCAACTA TGCTA TACTAGTGTTCATTGTATTCGA                                                                                                    ]
[-] EMBL CD068193             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTACTACGACATCTTACGTCGATTGCTGAAGAATGTAAAGGAATTTTAGCGGTAGGTGGAGCATTCAACAACCCAGTTTTAGGCAAATTGTAAGGACGTTCATAATTCTCTTGATCAAATTCTTCTTGCATTAAAACTGGACTAGATAT ACAAGATCAATTGGAGCTAGCATTGATTGTACAGAAGAATGTTGATGTAATGAATCTTGATAAGTTAAATCATGTGAACCAGAATCTGAGCTAATAACACTTGGATTAGTTTGTCTTCGTCTTCTCCACCATAACCAACTACTGCTACTACTAGTGTTCATTGTATTCGATTGATTAGTTTGTATTTCTGGTTCACAATCATCAGTTGTTTCATTAAATGATGAACTCATCAATGGGAATTCTGAGCCACGATCACGTTTATGTTGTTCG]


>consensus_7326#0 ACGAGAAGATAAATAAATAAATTTATATCCATTATTAGCTATTTTATTGTATAATTGAGC TATATGATGATGAGTCCAATCCATTCCGACTAATGGCATCAATTGTCCTAACCAATCTGA TTTTGTTATTGTTCCATCAATATCCGATATTACAATTTTATCAGACCAATGCCAAAGGTA TATAAAACAAGCACATTGACAAGTACCTTGATATTTACTGACAACAGAAAAAACTGCTTC ATTTGCACCTTCGTGTAAATTGAGGCTTTTAAGCTGTTGAGATGTTAAACGATTTGCTTG TTGAATTGGAATCCTTGACTCAATATTACCAGTTGTTTTTCGATGATAAGCATTATTACT TTCATAATCATCCGAGAAGTATCCTGCCTCTTCAGGAGATGATGTCTGTGATGGATCTGG TGTTTTACTACGACATCTTACGTCGATTGCTGAAGAATGTAAAGGAATTTTAGCGGTAGG TGGAGCATTCAACAACCCAGTTTTAGGCAAATTGTAAGGACGTTCATAATTCTCTTGATC AAATTCTTCTCGCATTAAAACTGGACTAGATATAACAAGATCAATTGGAGCTAGCATTGA TTGTACAGAAGAATGTTGATGTAATGAATCTTGATAAGTTAAATCATGTGAACCAGAATC TGAGCTAATAACACTTGGATTAGTTTGTCTTCGTCTTCTCCACCATAACCAACTATGCTA TACTAGTGTTCATTGTATTCGATTGATTAGTTTGTATTTCTGGTTCACAATCATCAGTTG TTTCATTAAATGATGAACTCATCAATGGGAATTCTGAGCCACGATCACGTTTATGTTGTT CG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)