These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7340#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 904 fasta sequence [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC-AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTCCGTCGAATCACTGATATATTGACATTGAAAAATGTACTCTCTCATACTAATGGTATCGNTGTACTGATACAATTCTGAACATTTTTATGCACAAATTATTCTTCAAAAATACTCTTCATGCAATACAATCACTTAATGCTTCAAGCTTCACATTTACCGTGAAAGTATCCATCAAAGGGATATTGGCCGTAACTATATTAAGAAATGGAAGGAAAGGTTGTTTAATTCAATTTATATTTAATCAATAGCATTAAAAATCTTTTTTATACATTAGCTTGTGAGTAAATATTACTTAGATAGGACTTTTGGAAATTCTCATGTTCAGCATAAATCTGGTCTGACAGTCTATTTGTG] [+] EMBL CD088596 [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATNTCGTCGAATCACTGATATATTGACATTNGAAAATGTACTCTCTCATACTAATGGTATCGNT ] [+] EMBL CD088716 [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAGTCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACANACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTNCGTCGAATCACTAATATATTGACATTGAAAAATGTACTCTCTCATACT ] [+] EMBL CD088670 [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGTGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGATTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTAAATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCCGACTTTGGCTAGTATCTTGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTCCGTCGAt ] [+] EMBL CD088614 [AATGAATCAATAAATTAATGAGTTAAATGAACACAAGTTTAAATAGCATAAAAGAAGCAGGCAGAATATTAAGTGCAATCAAAATCAAAAGTTGAAATAGGTCTGATTATGTTGATTTGATGTTAAATTTTAGTCGCGATTCTGTGTGAACCGTAAATGTCCACATTTGTTTGTGTATGAAATTTGTAATATGTAGTAGTTGAGTTAGATTTTGAGTGTGGGTACCTGTTAATTGTGCAAAGTTATATGTGTTTGTTTGGATAAACAGTCCATGTTGGACAGTCATGCCTTCTTTTTCACTTGAAATTTTCAAAGAGTAAATCAACAGACTTCCAGTCACCTTTTTTC AGTATTACTTTGATCGATTTAGCTTGTGATTTANATTATTGTAAAGCTAAGTGTCGTCAATAATTNTAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGNTAGTAACACAAACAGAGA ] [-] EMBL CD088679 [ TTTTCNAGTATTACTTTGATCGATNTAGCTTGTGATTTAAATTATTGT AAGCTAAGTGTCGTCAATAATTTCAACGTCATAATCTGAATCTTTATGAGATTAAGTCCAGTTCTCTGACTTTGGCTAGTATCTCGATAGAGATAACCGTTAGTAACACAAACAGAGAGGGTAATTACACTTCGTGTTTATCACAATTCTTCCTCATTCCGTCGAATCACTGATATATTGACATTGAAAAATGTACTCTCTCATACTAATGGTATCGTTGTACTGATACAATTCTGAACATTTTTATGCACAAATTATTCTTCAAAAATACTCTTCATGCAATACAATCACTTAATGCTTCAAGCTTCACATTTACCGTGAAAGTATCCATCAAAGGGATATTGGCCGTAACTATATTAAGAAATGGAAGGAAAGGTTGTTTAATTCAATTTATATTTAATCAATAGCATTAAAAATCTTTTTTATACATTAGCTTGTGAGTAAATATTACTTAGATAGGACTTTTGGAAATTCTCATGTTCAGCATAAATCTGGTCTGACAGTCTATTTGTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||