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Schistosoma mansoni
cluster # 7347 cluster # 7347       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7347#0 length = 1273 sequences # 5  

consensusID : consensus_7347#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1273
fasta sequence
                              [AGATAATAGGTAGATTAGTAACATCACCGTCTAACTCACGACAGGTAACTGGTAAGGTTGGGAGGTTTTGAAAATAAACTGATTGGCGAACATCATTAGCAAGTGATTCATGTCCTACAACACTTGAATCATAAATAGCTAGTAAATTGACAAGTGATAATTCTTGACAGAAAAATGCCTCAGCCAATCGTTTCATACGAATTTGATGAAACCTTCGACGTAAAAAAGCAGCCAGTTTAGATTGTAAGGTGACAGATTTACATAGTTGTTTAAATAGAACAGTATTTTGAGATGAGAGACGAGCAACATCAAATGAAATTTGATTCGCTAAATCATCATCGGTTTCTAAGCTTTGAGCTATTTGTACAAGTGAATCCAATTTACTTTGAAAGTCAACAGGTTCAATACGTGGTTTCACATTTGAAGGTAAGTACGGAAGACTTTCACGCCAAAATAACAACATAGATTCTCTTGCCGCTAATAATATTTGACAGAGATGTC-GATGAATAGCACGTGCAAAATGATATCTGTTAGGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTAGTT-GGTTGTTTGTTTGTAATGGTGTATTATGTGGTGAAAATTTTGGCCAACTAATAATACTTGAAGTGATATTTGTTAATGCTCCATAAAGTGCTAATTCAATAGCACATAAATGAAAATAATCGAAGAATACGGTGAAATGATAGTGAGGTCCACGAGATGGTGTTAAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGGAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACACATCACATAGCCTTGCCGACTCATCTCGATATATGATCAACAATGTCTTGCTGCATGCTTTGTCTGGTGTGTGAGCTGGAACAGAAACACTCGGTTCGATGTAACTCGCTTTTACAGCTTCTGGTACTTTGAATCGTGTACTAGCTCGTTCCCAACGGGTTGGCGGTTCAACAAATGCTGATGATTTACCATTGTTAGATCCAGTAGTCGCACTGGGATGCACACCTGTTTTTAAGTGAGTACGAACTTGGTAATAGCCACGATGGTAGAGATCGATATTATGGAAATCGCGTAGTTCCACAACCAACGATAAAGTGGCTTGGATTAAAGGCATCAGCACCGGATG]

[+] EMBL CD114154             [AGATAATAGGTAGATTAGTAACATCACCGTCTAACTCACGACAGGTAACTGGTAAGGTTGGGAGGTTTTGAAAATAAACTGATTGGCGAACATCATTAGCAAGTGATTCATGTCCTACAACACTTGAATCATAAATAGCTAGTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD114132             [                      ATCACCGTCTAACTCACGACAGGTAACTGGTAAGGTTGGGAGGTTTTGAAAATAAACTGATTGGCGAACATCATTATCAAGTGATTCATGTCCTACAACACTTGAATCATAAATAGCTAGTAAATTGACAAGTGATAATTCTTGACAGAAAAATGCCTCAGCCAATCGTTTCATACGAATTTGATGAAACCTTCGACGTAAAAAAGCAGCCAGTTTAGATTGTAAGGTGACAGATTTACATAGTTGTTTAAATAGAACAGTATTTTGAGATGAGAGACGAGCAACATCAAATGAAATTTGATTCGCTAAATCATCATCGGTTTCTAAGCTTTGAGCTATTTGTACAAGTGAATCCAATTTACTTTGAAAGTCAACAGGTTCAATACGTGGTTTCACATTTGAAGGTAAGTACGGAAGACTTTCACGCCAAAATAACAACATAGATTCTCTTGCCGCTAATAATATTTGACAGAGATGTC GATGAATAGCACGTGCAAAATGATATCTGTTAAGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTANTTGGGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD163758             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGACAGAGATGTCTGATGAATAGCACGTGCAAAATGATATCTGTTAGGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTAGTT GGTTGTTTGTTTGTAATGGTGTATTATGTGGTGAAAATTTTGGCCAACTAATAATACTTGAAGTGATATTTGTTAATGCTCCATAAAGTGCTAATTCAATAGCACATAAATGAAAATAATCGAAGAATACGGTGAAATGATAGTGAGGTCCACGAGATGGTGTTAAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGGAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACACATCACATAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD163746             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGACAGAGATGTC GATGAATAGCGCGTGCAAAATGATATCTGTTAGGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTAGTT GGTTGTTTGTTTGTAATGGTGTATTATGTGGTGAAAATTTTGGCCAACTAATAATACTTGAAGTGATATTTGTTAATGCTCCATAAAGTGCTAATTCAATAGCACATAAATGAAAATAATCGAAGAATACGGTGAAATGATAGTGAAGTCCACGAGATGGTGTTAAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGGAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL AI975998             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGAAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACACATCACATAGCCTTGCCGACTCATCTCGATATATGATCAACAATGTCTTGCTGCATGCTTTGTCTGGTGTGTGAGCTGGAACAGAAACACTCGGTTCGATGTAACTCGCTTTTACAGCTTCTGGTACTTTGAATCGTGTACTAGCTCGTTCCCAACGGGTTGGCGGTTCAACAAATGCTGATGATTTACCATTGTTAGATCCAGTAGTCGCACTGGGATGCACACCTGTTTTTAAGTGAGTACGAACTTGGTAATAGCCACGATGGTAGAGATCGATATTATGGAAATCGCGTAGTTCCACAACCAACGATAAAGTGGCTTGGATTAAAGGCATCAGCACCGGATG]


>consensus_7347#0 AGATAATAGGTAGATTAGTAACATCACCGTCTAACTCACGACAGGTAACTGGTAAGGTTG GGAGGTTTTGAAAATAAACTGATTGGCGAACATCATTAGCAAGTGATTCATGTCCTACAA CACTTGAATCATAAATAGCTAGTAAATTGACAAGTGATAATTCTTGACAGAAAAATGCCT CAGCCAATCGTTTCATACGAATTTGATGAAACCTTCGACGTAAAAAAGCAGCCAGTTTAG ATTGTAAGGTGACAGATTTACATAGTTGTTTAAATAGAACAGTATTTTGAGATGAGAGAC GAGCAACATCAAATGAAATTTGATTCGCTAAATCATCATCGGTTTCTAAGCTTTGAGCTA TTTGTACAAGTGAATCCAATTTACTTTGAAAGTCAACAGGTTCAATACGTGGTTTCACAT TTGAAGGTAAGTACGGAAGACTTTCACGCCAAAATAACAACATAGATTCTCTTGCCGCTA ATAATATTTGACAGAGATGTCGATGAATAGCACGTGCAAAATGATATCTGTTAGGCTGTT TAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTAGTTGGTTGTTTG TTTGTAATGGTGTATTATGTGGTGAAAATTTTGGCCAACTAATAATACTTGAAGTGATAT TTGTTAATGCTCCATAAAGTGCTAATTCAATAGCACATAAATGAAAATAATCGAAGAATA CGGTGAAATGATAGTGAGGTCCACGAGATGGTGTTAAATGAATACGTAGTTGACGCTCAC ATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATA GCTCAACGCATAGGAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGA CCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACACATCACATAGCCTTGCCGACTCATCTCGATATA TGATCAACAATGTCTTGCTGCATGCTTTGTCTGGTGTGTGAGCTGGAACAGAAACACTCG GTTCGATGTAACTCGCTTTTACAGCTTCTGGTACTTTGAATCGTGTACTAGCTCGTTCCC AACGGGTTGGCGGTTCAACAAATGCTGATGATTTACCATTGTTAGATCCAGTAGTCGCAC TGGGATGCACACCTGTTTTTAAGTGAGTACGAACTTGGTAATAGCCACGATGGTAGAGAT CGATATTATGGAAATCGCGTAGTTCCACAACCAACGATAAAGTGGCTTGGATTAAAGGCA TCAGCACCGGATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)