These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7347#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1273 fasta sequence [AGATAATAGGTAGATTAGTAACATCACCGTCTAACTCACGACAGGTAACTGGTAAGGTTGGGAGGTTTTGAAAATAAACTGATTGGCGAACATCATTAGCAAGTGATTCATGTCCTACAACACTTGAATCATAAATAGCTAGTAAATTGACAAGTGATAATTCTTGACAGAAAAATGCCTCAGCCAATCGTTTCATACGAATTTGATGAAACCTTCGACGTAAAAAAGCAGCCAGTTTAGATTGTAAGGTGACAGATTTACATAGTTGTTTAAATAGAACAGTATTTTGAGATGAGAGACGAGCAACATCAAATGAAATTTGATTCGCTAAATCATCATCGGTTTCTAAGCTTTGAGCTATTTGTACAAGTGAATCCAATTTACTTTGAAAGTCAACAGGTTCAATACGTGGTTTCACATTTGAAGGTAAGTACGGAAGACTTTCACGCCAAAATAACAACATAGATTCTCTTGCCGCTAATAATATTTGACAGAGATGTC-GATGAATAGCACGTGCAAAATGATATCTGTTAGGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTAGTT-GGTTGTTTGTTTGTAATGGTGTATTATGTGGTGAAAATTTTGGCCAACTAATAATACTTGAAGTGATATTTGTTAATGCTCCATAAAGTGCTAATTCAATAGCACATAAATGAAAATAATCGAAGAATACGGTGAAATGATAGTGAGGTCCACGAGATGGTGTTAAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGGAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACACATCACATAGCCTTGCCGACTCATCTCGATATATGATCAACAATGTCTTGCTGCATGCTTTGTCTGGTGTGTGAGCTGGAACAGAAACACTCGGTTCGATGTAACTCGCTTTTACAGCTTCTGGTACTTTGAATCGTGTACTAGCTCGTTCCCAACGGGTTGGCGGTTCAACAAATGCTGATGATTTACCATTGTTAGATCCAGTAGTCGCACTGGGATGCACACCTGTTTTTAAGTGAGTACGAACTTGGTAATAGCCACGATGGTAGAGATCGATATTATGGAAATCGCGTAGTTCCACAACCAACGATAAAGTGGCTTGGATTAAAGGCATCAGCACCGGATG] [+] EMBL CD114154 [AGATAATAGGTAGATTAGTAACATCACCGTCTAACTCACGACAGGTAACTGGTAAGGTTGGGAGGTTTTGAAAATAAACTGATTGGCGAACATCATTAGCAAGTGATTCATGTCCTACAACACTTGAATCATAAATAGCTAGTAAAT ] [+] EMBL CD114132 [ ATCACCGTCTAACTCACGACAGGTAACTGGTAAGGTTGGGAGGTTTTGAAAATAAACTGATTGGCGAACATCATTATCAAGTGATTCATGTCCTACAACACTTGAATCATAAATAGCTAGTAAATTGACAAGTGATAATTCTTGACAGAAAAATGCCTCAGCCAATCGTTTCATACGAATTTGATGAAACCTTCGACGTAAAAAAGCAGCCAGTTTAGATTGTAAGGTGACAGATTTACATAGTTGTTTAAATAGAACAGTATTTTGAGATGAGAGACGAGCAACATCAAATGAAATTTGATTCGCTAAATCATCATCGGTTTCTAAGCTTTGAGCTATTTGTACAAGTGAATCCAATTTACTTTGAAAGTCAACAGGTTCAATACGTGGTTTCACATTTGAAGGTAAGTACGGAAGACTTTCACGCCAAAATAACAACATAGATTCTCTTGCCGCTAATAATATTTGACAGAGATGTC GATGAATAGCACGTGCAAAATGATATCTGTTAAGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTANTTGGGTTG ] [+] EMBL CD163758 [ TTGACAGAGATGTCTGATGAATAGCACGTGCAAAATGATATCTGTTAGGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTAGTT GGTTGTTTGTTTGTAATGGTGTATTATGTGGTGAAAATTTTGGCCAACTAATAATACTTGAAGTGATATTTGTTAATGCTCCATAAAGTGCTAATTCAATAGCACATAAATGAAAATAATCGAAGAATACGGTGAAATGATAGTGAGGTCCACGAGATGGTGTTAAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGGAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACACATCACATAG ] [+] EMBL CD163746 [ TTGACAGAGATGTC GATGAATAGCGCGTGCAAAATGATATCTGTTAGGCTGTTTAATACTGCAAATGATACCATGCCATGTTTGTTGAGCTAAACTAATTAGTT GGTTGTTTGTTTGTAATGGTGTATTATGTGGTGAAAATTTTGGCCAACTAATAATACTTGAAGTGATATTTGTTAATGCTCCATAAAGTGCTAATTCAATAGCACATAAATGAAAATAATCGAAGAATACGGTGAAATGATAGTGAAGTCCACGAGATGGTGTTAAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGGAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACA ] [-] EMBL AI975998 [ AAATGAATACGTAGTTGACGCTCACATACCTTAGTCAGAAATTCAGGAGCAAATGGTTTATCAAGTGGGTCTTCGACAAACCATAGCTCAACGCATAGAAAAAGATCGTTTCTTACTAAAGACTCCTCTAAATTAATCGGATCGACCTGGACTAATACCCTCTGCTCAAACACATCACATAGCCTTGCCGACTCATCTCGATATATGATCAACAATGTCTTGCTGCATGCTTTGTCTGGTGTGTGAGCTGGAACAGAAACACTCGGTTCGATGTAACTCGCTTTTACAGCTTCTGGTACTTTGAATCGTGTACTAGCTCGTTCCCAACGGGTTGGCGGTTCAACAAATGCTGATGATTTACCATTGTTAGATCCAGTAGTCGCACTGGGATGCACACCTGTTTTTAAGTGAGTACGAACTTGGTAATAGCCACGATGGTAGAGATCGATATTATGGAAATCGCGTAGTTCCACAACCAACGATAAAGTGGCTTGGATTAAAGGCATCAGCACCGGATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||