These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7354#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 977 fasta sequence [GCTCGCCAGAATGGTTATCGCGTTTAGTATGAATTATGTGTTCAGTACGTCAATCGTATCAATGTTTGTGTATGGACAAATAATAAAACAATTGGCTGCATAAAAATGTACGCTGTAAATTGCTTATCTAACCCGAATTTGTATGGTTACGTTATATTTATTTTATATTCTTTTTTCCAAGTGTTAATTTCCTATGTATTTCCTTTTTAACTGTCTCCTCACAATTTTCTAAATCCCTTCCGTAGTGTTGTTGACTTTNTTATTTAACGGTTTGTCCTCTAATGAAAACTTTGGAAGGGTGGACTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG--ATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGCCCCGCATCGATCC-GAATTCTCTATTCAACTCAGGTTGATTTAATCAATTTTACGAATAAGACAAACACTTGACCCTAAGCCATTGAAAGTTGTCTTTTTTGTTGTTGAAAGGCCAGCTATGAAATTTCATTTGTACTGTTGTTTCTCTTTCTTTGTTTGTGTTTTTCCGACATATTTCTTTGTGTAATTTTGTTTACCATTGCTAATACACATTTTGAACTAGTATAATTCCCGTTACTGTTTCTATCCTAATGAATATGAATTAATCATTTGACAAAGCACACACACAAGTT] [+] EMBL AI976527 [GCTCGCCAGAATGGTTATCGCGTTTAGTATGAATTATGTGTTCAGTACGTCAATCGTATCAATGTTTGTGTATGGACAAATAATAAAACAATTGGCTGCATAAAAATGTACGCTGTAAATTGCTTATCTAACCCGAATTTGTATGGTTACGTTATATTTATTTTATATTCTTTTTTCCAAGTGTTAATTTCCTATGTATTTCCTTTTTAACTGTCTCCTCACAATTTTCTAAATCCCTTCCGTAGTGTTGTTGACTTTNTTATTTAACGGTTTGTCCTCTAATGAAAACTTTGGAAGCTTCTTTTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTGATATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGNTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACT ] [+] EMBL BG932042 [ GGTGGACTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG ATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGCCCCGCATCGATCCGGAATTC ] [+] EMBL BG932038 [ GGTGGACTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG ATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGCCCCGCAT ] [+] EMBL BG932047 [ GGTGGACTCCACAAAATTCATTGATGGATGCACTATGAATTTCCAGTTCAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG ATATATATATATATATAACTATCGAATGGGTTGATGAAAGATAAGAATACTGAAAAAGACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATAGTGTGGATCCAACATTGTTTGTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTACTGAATATTGTCATTACCACTATCACTCATACATATA ] [+] EMBL CD083656 [ gCGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGAACTGGATCAATCC GAATAATCTATTCAACTCAGGTTGATTTAATCAATTTTACGAATAAGACAAACACTTGACCCTAAGCCATTGAAAGTTGTCTTTTTTGTTGTTGAAAGGCCAGCTATGAAATTTCATTTGTACTGTTGTTTCTCTTTCTTTGTTTGTGTTTTTCCGACATATTTCTTTGTGTAATTTTGTTTACCATTGCTAATACACATTTTGAACTAGTATAATTCCCGTTACTGTTTCTATCCTAATGAATATGAATTAATCATTTGACAAAGCACACACACAAGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||