Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7373 cluster # 7373       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7373#0 length = 772 sequences # 5  
consensusID : consensus_7373#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 772
fasta sequence 
                              [CCAGGCCANAATTCTGGCCGAGGCCACTATTACTATGATTTATCAATTATTAATCTTATCATTAGTAGTTAATGTTCTAACTTCGTCAGCTGTCAAGGAATATATCAATCATGAAAATGAATTCAATAATATACAATTCAATCAACTTAAATATATATATCATCATTTTCTTTTAAACCAAAATCCAGCTAATCCTTCATGTTTCGGTTGTAAATCTGGATTATGGATGCTTAAAACATTTGTCTTTGGTAGTAGAAAATTTATACATGATCATATTGAAGTAACATGTACAAATTTTAAAAATATTTATAAACCTTGTAAAAGAATATTAACTGAATTTCTGGATTACGCTTATGATTTAATATATGGTTACAGTTCAGCCGATCTATGTGCACTTGCTGGAATATGTGAAAATCCACCGAAAATTGACTTTTGTCCACTTTGCTTAATGAGTGTAGAAGAAGGTAAAAATATTTTATTATCTGATGCCCTTCTCAATGAATTACAATCGGTATTTGTACATGTATGTGATTATGTAAGATTGGAAGTACAATGTTCCACATTTCTGAATGAACTTTATGAAAATGCTATCGATATAATCAAACATATTGTAGAACCACATTTCATTTGTCAGTTGGGTCACATGTGTAATACAACATATACAGAGGTATCGAATTACAATTAGAATTCCATAAAAAGAACACTATTTGTATTGGCAAACAAAATGTATTATTATTACAATTTTAGAATCAGCAAACTAAAATAAATCATA]

[+] EMBL CD079865             [CCAGGCCANAATTCTGGCCGAGGCCACTATTACTATGATTTATCAATTATTAATCTTATCATTAGTAGTTAATGTTCTAACTTCGTCAGCTGTCAAGGAATATATCAATCATGAAAATGAATTCAATAATATACAATTCAATCAACTTAAATATATATATCATCATTTTCTTTTAAACCAAAATCCAGCTAATCCTTCATGTTTCGGTTGTAAATCTGGATTATGGATGCTTAAAACATTTGTCTTTGGTAGTAGAAAATTTATACATGATCATATTGAAGTAACATGTACAAATTTTAAAAATATTTATAAACCTTGTAAAAGAATATTAACTGAATTTCTGGATTACGCTTATGATTTAATATATGGTTACAGTTCAGCCGATCTATGTGCACTTGCTGGAATATGTGAAAATCCACCGAAAATTGACTTTTGTCCACTTTGCTTAATGAGTGTAGAAGAAGGTAAAAATATTTTATTATCTGATGCCCTTCTCAATGAATTACAATCGGTATTTGTACATGTATGTGATTATGTAAGATTGGAAGTACAATGTTCCACATTTCTGAATGAACTTTATGAAAATGCTATCGATATAATCAAACATATTGTAGAACCACATTTCATTTGTCAGTTGGGTCACATGTGTAATACAACATATACAGAGGTATCGAATTACAATTAGAATTCCATAAAAAGAACACTATNTGTATTGGCAAACAAAATGTATTATTATTACACTCTTAGAATCAGCAAACTAA           ]
[+] EMBL CD078723             [                       CCATTATTACTATGATTTATCAATTATTAATCTTATCATTAGTAGTTAATGTTCTAACTTCGTCAGCTGTCAAGGAATATATCAATCATGAAAATGAATTCAATAATATACAATTCAATCAACTTAAATATATATATCATCATTTTCTTTTAAACCAAAATCCAGCTAATCCTTCATGTTTCGGTTGTAAATCTGGATTATGGATGCTTAAAACATTTGTCTTTGGTAGTAGAAAATTTATACATGATCATATTGAAGTAACATGTACAAATTTTAAAAATATTTATAAACCTTGTAAAAGAATATTAACTGAATTTCTGGATTACGCTTATGATTTAATATATGGTTACAGTTCAGCCGATCTATGTGCACTTGCTGGAATATGTGAAAATCCACCGAAAATTGACTTTTGTCCACTTTGCTTAATGAGTGTAGAAGAAGGTAAAAATATTTTATTATCTGATGCCCTTCTCAATGAATTACAATCGGTATTTGCACATGTATGTGATTATGTAAGATTGGAAGTACAATGTTCCACATTTCTGAATGAACTTTATGA                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AI977615             [                                      TTTATCAATTATTAATCTTATCATTAGTAGTTAATGTTCTAACTTCGTCAGCTGTCAAGGAATATATCAATCATGAAAATGAATTCAATAATATACAATTCAATCAACTTAAATATATATATCATCATTTTCTTTTAAACCAAAATCCAGCTAATCCTTCATGTTTCGGTTGTAAATCTGGATTATGGATGCTTAAAACATTTGTCTTTGGTAGTAGAAAATTTATACATGATCATATTGAAGTAACATGTACAAATTTTAAAAATATTTATAAACCTTGTAAAAGAATATTAACTGAATTTCTGGATTACGCTTATGATTTAATATATGGTTACAGTTCAGCCGATCTATGTGCACTTGCTGGAATATGTGAAAATCCACCGAAAATTGACTTTTGTCCACTTTGCTTAATGAGTGTAGAAGAAGGTAAAAATATTTTATTATCTGATGCCCTTCTCAATGAATTACAATCGGTATCTGTACATGTATGTGATTATGTAAGATTGGAAGTACAATGTTCCACATTTCTGAATGAACTNTATGAAAATGCTATCGATATAATCAAA                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD077239             [                                                                                                                                                                                                             GGTTGTAAATCTGGATTATGGATGCTTAAAACATTTGTCTTTGGTAGTAGAAAATTTATACATGATCATATTGAAGTAACATGTACAAATTTTAAAAATATTTATAAACCTTGTAAAAGAATATTAACTGAATTTCTGGATTACGCTTATGATTTAATATATGGTTACAGTTCAGCCGATCTATGTGCACTTGCTGGAATATGTGAAAATCCACCGAAAATTGACTTTTGTCCACTTTGCTTAATGAGTGTAGAAGAAGGTAAAAATATTTTATTATCTGATGCCCTTCTCAATGAATTACAATCGGTATTTGTACATGTATGTGATTATGTAAGATTGGAAGTACAATGTTCCACATTTCTGAATGAACTTTATGAAAATGCTATCGATATAATCAAACATATTGTAGAACCACATTTCATTTGTCAGTTGGGTCACATGTGTAATACAACATATACAGAGGTATCGAATTACAATTAGAATTCCATAAAAAGAACACTATTTGTATTGGCAAACAAAATGTATTATTATTACAATTTTAGAATCAGCAAACGAAAATAAATCATA]
[-] EMBL CD073186             [                                                                                                                                                                                                                                          AACATTTGTCTNTGGTAGTAGAAAATTTATACATGATCATATTGAAGTAACATGTACAAATTTTAAAAATATTTATAAACCTTGTAAAAGAATATTAACTGAATTTCTGGATTACGCTTATGATTTAATATATGGTTACAGTTCAGCCGATCTATGTGCACTTGCTGGAATATGTGAAAATCCACCGAAAATTGACTTTTGTCCACTTTGCTTAATGAGTGTAGAAGAAGGTAAAAATATTTTATTATCTGATGCCCTTCTCAATGAATTACAATCGGTATTTGTACATGTATGTGATTATGTAAGATTGGAAGTACAATGTTCCACATTTCTGAATGAACTTTATGAAAATGCTATCGATATAATCAAACATATTGTAGAACCACATTTCATTTGTCAGTTGGGTCACATGTGTAATACAACATATACAGAGGTATCGAATTACAATTAGAATTCCATAAAAAGAACACTATTTGTATTGGCAAACAAAATGTATTATTATTACAATTTTAGAATCAGCAAACTAAAATAAATCATA]




>consensus_7373#0
CCAGGCCANAATTCTGGCCGAGGCCACTATTACTATGATTTATCAATTATTAATCTTATC
ATTAGTAGTTAATGTTCTAACTTCGTCAGCTGTCAAGGAATATATCAATCATGAAAATGA
ATTCAATAATATACAATTCAATCAACTTAAATATATATATCATCATTTTCTTTTAAACCA
AAATCCAGCTAATCCTTCATGTTTCGGTTGTAAATCTGGATTATGGATGCTTAAAACATT
TGTCTTTGGTAGTAGAAAATTTATACATGATCATATTGAAGTAACATGTACAAATTTTAA
AAATATTTATAAACCTTGTAAAAGAATATTAACTGAATTTCTGGATTACGCTTATGATTT
AATATATGGTTACAGTTCAGCCGATCTATGTGCACTTGCTGGAATATGTGAAAATCCACC
GAAAATTGACTTTTGTCCACTTTGCTTAATGAGTGTAGAAGAAGGTAAAAATATTTTATT
ATCTGATGCCCTTCTCAATGAATTACAATCGGTATTTGTACATGTATGTGATTATGTAAG
ATTGGAAGTACAATGTTCCACATTTCTGAATGAACTTTATGAAAATGCTATCGATATAAT
CAAACATATTGTAGAACCACATTTCATTTGTCAGTTGGGTCACATGTGTAATACAACATA
TACAGAGGTATCGAATTACAATTAGAATTCCATAAAAAGAACACTATTTGTATTGGCAAA
CAAAATGTATTATTATTACAATTTTAGAATCAGCAAACTAAAATAAATCATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)