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Schistosoma mansoni
cluster # 7379 cluster # 7379       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7379#0 length = 880 sequences # 5  

consensusID : consensus_7379#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 880
fasta sequence
                              [CTGTGGAGATGACCAGATTACTTTACTGCCTCCACAACTACTGACATCTCCGCTGTTGCTGTAATTAGATTTACCTAGATTAGCTGTTGAAATGTTCATAGTAGAAAGTGTGTATATATGTTGTCGTTCATTCGTTGTTACATGGCTACTAACAGATGTTGGCATAAAATGTGATGGTGTTGATGATGATGAGTACATCGAAGCAGACAATTGTTTACCACGTTTCCTAGATCGATGATAACTTGTAGATGATCCTATAGAATTTGTATTTGTGTCAATTATTCGATGTAAAGAATTACAAGAGGTTGTTGATGTGGATGTTGTTGTCAATGAATTGACTGGTATTAAATTAGATAAATTTTCCAATCGTAACATTAAGCCATTACGACAACGAACAGGTGTATTAATAGATTTCGAATCATTACATTTATTCAGCAGGCGACGTAAACCAGCACGTACAGCAGACAATGGTACATTTTTGCTAGCAGCAATTCGGCTAATTTCATGTTCTAATCGAATTAAACTATTATTGTAATTACTATTATGAGTATTAGATGAATCAGTAAGATATGATTTACTTTTCATAACATCAAGACATGTCATATTGACAGTATTAGCGTTACGTGAACAGTTAGGATGCGGTGTATTTTCCAGCATTAAATTCTGTTTTGTCTCCGTGCACGATGAAAACGAAGATATAAGCGATAAGTCGGTAGGTAGTTCCAAACTGGTAATAAATAACTTATGATCAAATAATTCACCTAGTGTATGACGCCATAAATCAACTAAACTGGTAATTAGTCCAGGTAATGCACTTGGAATAATAAAATCCATTCCATTTTCATCTCTTAATAGAATATTTAAACAGTTTAGCGCCCAG]

[-] EMBL CD068288             [CTGTGGAGATGACCAGATTACTTTACTGCCTCCACAACTACTGACATCTCCGCTGTTGCTGTAATTAGATTTACCTAGATTAGCTGTTGAAATGTTCATAGTAGAAAGTGTGTATATATGTTGTCGTTCATTCGTTGTTACATGGCTACTAACAGATGTTGGCATAAAATGTGATGGTGTTGATGATGATGAGTACATCGAAGCAGACAATTGTTTACCACGTTTCCTAGATCGATGATAACTTGTAGATGATCCTATAGAATTTGTATTTGTGTCAATTATTCGATGTAAAGAATTACAAGAGGTTGTTGATGTGGATGTTGTTGTCAATGAATTGACTGGTATTAAATTAGATAAATTTTCCAATCGTAACATTAAGCCATTACGACAACGAACAGGTGTATTAATAGATTTCGAATCATTACATTTATTCAGCAGGCGACGTAAACCAGCACGTACAGCAGACAATGGTACATTTTTGGTAGCAGCt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD096818             [                                                                                                                                                                                                                                                                         GTATTTGTGTCAATTATTCGATGTAAAGAATTACAAGAGGTTGTTGATGTGGATGTTGTTGTCAATGAATTGACTGGTATTAAATTAGATAAATTTTCCAATCGTAACATTAAGCCATTACGAAAACGAACAGGTGTATCAATAGATTTCGAATCATTACATTTATTCAGCAGGCGACGTAAACCAGCACGTACAGCAGACAATGGTACATTTTTGCTAGCAGCAATTCGGCTAATTTCATGTTCTAATCGAATTAAACTATTATTGTAATTACTATTATGAGTATTAGATGAATCAGTAAGATATGATTTACTTTTCATAACATCAAGACATGTCATATTGACAGTATTAGCGTTACGTGAACAGTTAGGATGCGGTGTATTTTCCAGCATTAAATTCTGTTTTGTCTCCGTGCACGATGAAAACGAAGATATAAGCGATAAGTCGGTAGGTAGTTCCAAACTGGTAATAAATAACTTATGATCAAATAATTCACCTAGTGTATGACGCCATAAATCAACTAAACT                                                                                        ]
[+] EMBL CD146777             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGACAATGGTACATTTTTGCTAGCAGCAATTCGGCTAATTTCATGTTCTAATCGAATTAAACTATTATTGTAATTACTATTATGAGTATTAGATGAATCAGTAAGATATGATTTACTTTTCATAACATCAAGACATGTCATATTGACAGTATTAGCGTTACGTGAACAGTTAGGATGCGGTGTATTTTCCAGCATTAAATTCTGTTTTGTCTCCGTGCACGATGAAAACGAAGATATAAGCGATAAGTCGGTAGGTAGTTCCAAACTGGTAATAAATAACTTATGACCAAATAATTCACCTAGTGTATGACGCCATAAATCAACTAAACTGGTAATTAGTCCAGGTAATGCACTTGGAATAATAAAATCCATTCCATTTTCATCTCTTAATAGAATATTTAAACAGTTTAGCGCCCA ]
[-] EMBL CD096135             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTTTGTCTCCGTGCACGATGAAAACGAAGATATAAGCGATAAGTCGGTAGGTAGTTCCAAACTGGTAATAAATAACTTATGATCAAATAATTCACCTAGTGTATGACGCCATAAATCAACTAAACTGGTAATTAGTCCAGGTAATGCACTTGGAATAATAAAATCCATTCCATTTTCATCTCTTAATAGAATATTTAAACAGTTTAGCGCCCAG]
[-] EMBL CD096160             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTTTGTCTCCGTGCACGATGAAAACGAAGATATAAGCGATAAGTCGGTAGGTAGTTCCAAACTGGTAATAAATAACTTATGATCAAATAATTCACCTAGTGTATGACGCCATAAATCAACTAAACTGGTAATTAGTCCAGGTAATGCACTTGGAATAATAAAATCCATTCCATTTTCATCTCTTAATAGAATATTTAAACAGTTTAGCGCCCAG]


>consensus_7379#0 CTGTGGAGATGACCAGATTACTTTACTGCCTCCACAACTACTGACATCTCCGCTGTTGCT GTAATTAGATTTACCTAGATTAGCTGTTGAAATGTTCATAGTAGAAAGTGTGTATATATG TTGTCGTTCATTCGTTGTTACATGGCTACTAACAGATGTTGGCATAAAATGTGATGGTGT TGATGATGATGAGTACATCGAAGCAGACAATTGTTTACCACGTTTCCTAGATCGATGATA ACTTGTAGATGATCCTATAGAATTTGTATTTGTGTCAATTATTCGATGTAAAGAATTACA AGAGGTTGTTGATGTGGATGTTGTTGTCAATGAATTGACTGGTATTAAATTAGATAAATT TTCCAATCGTAACATTAAGCCATTACGACAACGAACAGGTGTATTAATAGATTTCGAATC ATTACATTTATTCAGCAGGCGACGTAAACCAGCACGTACAGCAGACAATGGTACATTTTT GCTAGCAGCAATTCGGCTAATTTCATGTTCTAATCGAATTAAACTATTATTGTAATTACT ATTATGAGTATTAGATGAATCAGTAAGATATGATTTACTTTTCATAACATCAAGACATGT CATATTGACAGTATTAGCGTTACGTGAACAGTTAGGATGCGGTGTATTTTCCAGCATTAA ATTCTGTTTTGTCTCCGTGCACGATGAAAACGAAGATATAAGCGATAAGTCGGTAGGTAG TTCCAAACTGGTAATAAATAACTTATGATCAAATAATTCACCTAGTGTATGACGCCATAA ATCAACTAAACTGGTAATTAGTCCAGGTAATGCACTTGGAATAATAAAATCCATTCCATT TTCATCTCTTAATAGAATATTTAAACAGTTTAGCGCCCAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)