These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7414#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 649 fasta sequence [GGNTGTAAAGNCAGAAAAAGGTTCGAAAACATCTGACAAGTTTGNAAACTAAGTCAACAGTTCATAACATTAACTCACGCAATCGTAACACGCAAAGAATAATATGGACTGTCACTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTCTGCTTCTCTAGCTGCATTTGGCACCTTTTGCTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT-TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCCTACTG-AATTTTGTAATTTTTCCCTAC-AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCAGATACGGTTAAATGTTACCTTTTTGTACAGAATCTATTCTATATTTTCCAAATTCGTGTCTATGTTTTGCTAATCATCCTCAAGATATCTTAATTGGTCAACA] [+] EMBL SM7091 [GGNTGTAAAGNCAGAAAAAGGTTCGAAAACATCTGACAAGTTTGNAAACTAAGTCAACAGTTCATAACATTAACTCACGCAATCGTAACACGCAAAGAATAATATGGACTGTCACTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTCTGCTTCTCTAGCTGCATTTGGCACCTTTTGNTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTNCAGAGTATTAACTCTGGATTTCGNATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCNTACTG ] [-] EMBL CD075084 [ CACGCAAAGAATAATATGGACTGTCCCTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTTTGGTTCTCTAGCTGCATTTGGCCCCTTTTGCTGGTTTGGTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCCCTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACCCTATTCCCTACTG AATTTTGTAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGGCTATACTTTAACCCTTTTTTTAAAGAACTTTGAATTGAGACTAATATTTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGAGTACCAAATGTATTCCCTTTATA ] [+] EMBL CD160781 [ GCATTTGGCACCTTTTGCTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCCTACTG GATTTTGTAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTACACCTCAGATACGGTTAAATGTTACCTTTTTGTACAGAATCTATTCTATATTTTCCAAATTCGTGTCTATGTTTTGCTAATCATCCTCAAGATATCTTAATTGGTCAACA] [-] EMBL AI026169 [ ATTCCCTACCGCCCCGGGGAAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCA ] [-] EMBL AI026168 [ TTCCCTACAAAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACA GGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTGGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCAag ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||