These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7417#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 769 fasta sequence [GTAGTAATATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTATTAAGTAGTAATAGTCGTAGTCCTAGTAGTAGCAGTAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTGTATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAATACAGCTACAACGTA-TACATTCCACATACCATAAACACCAGTTATAAAAGCTGAAGTATATTCTACACTTTTCTCACCCCATTTCCATTGATCTTCTGTAACCTGACTAAAGATAAAGAATGCAACAGTAAGTCCAGCGCATATTATTGTATAAGTTAAAAGTACCATAAAACGATATATAATACCACTATAATATCGACGTTGTTCCATTGGAAGATTGTTTAACAAACGACGTTTGCCCAATATTTGTATAAATGCTTTAACAACTAATATAGTTAAATAGATCATATAAGCAATG] [+] EMBL CD131957 [GTAGTAATATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTATTAAGTAGTAATAGTCGTAGTCCTAGTAGTAGCAGTAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTGTATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAATACAGCTACAACGTA TACATTC ] [+] EMBL CD195139 [ GGGAGTAGTAGTATTAAGTAGTAGTAGTCGTAGTCCTAGTAGTAGCAGTAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCCTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGT AATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTCCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTATATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAA ] [+] EMBL CD133387 [ TAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTGTATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAATACAGCTACAACGTA TACATTCCACATACCATAAACACCAGTTATAAAAGCTGAAGTATATTCTACACTT ] [+] EMBL CD186406 [ GTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAAT ] [-] EMBL CD068379 [ aggttactGTACTACA TCCACATACCATAAACACCAGTTATAAAAGCTGAAGTATATTCTACACTTTTCTCACCCCATTTCCATTGATCTTCTGTAACCTGACTAAAGATAAAGAATGCAACAGTAAGTCCAGCGCATATTATTGTATAAGTTAAAAGTACCATAAAACGATATATAATACCACTATAATATCGACGTTGTTCCATTGGAAGATTGTTTAACAAACGACGTTTGCCCAATATTTGTATAAATGCTTTAACAACTAATATAGTTAAATAGATCATATAAGCAATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||