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Schistosoma mansoni
cluster # 7417 cluster # 7417       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7417#0 length = 769 sequences # 5  

consensusID : consensus_7417#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 769
fasta sequence
                              [GTAGTAATATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTATTAAGTAGTAATAGTCGTAGTCCTAGTAGTAGCAGTAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTGTATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAATACAGCTACAACGTA-TACATTCCACATACCATAAACACCAGTTATAAAAGCTGAAGTATATTCTACACTTTTCTCACCCCATTTCCATTGATCTTCTGTAACCTGACTAAAGATAAAGAATGCAACAGTAAGTCCAGCGCATATTATTGTATAAGTTAAAAGTACCATAAAACGATATATAATACCACTATAATATCGACGTTGTTCCATTGGAAGATTGTTTAACAAACGACGTTTGCCCAATATTTGTATAAATGCTTTAACAACTAATATAGTTAAATAGATCATATAAGCAATG]

[+] EMBL CD131957             [GTAGTAATATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTATTAAGTAGTAATAGTCGTAGTCCTAGTAGTAGCAGTAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTGTATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAATACAGCTACAACGTA TACATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD195139             [                                   GGGAGTAGTAGTATTAAGTAGTAGTAGTCGTAGTCCTAGTAGTAGCAGTAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCCTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGT AATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTCCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTATATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD133387             [                                                                                   TAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCATGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTGTATAATTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAATACAGCTACAACGTA TACATTCCACATACCATAAACACCAGTTATAAAAGCTGAAGTATATTCTACACTT                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD186406             [                                                                                                                         GTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATAAGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATCAATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATCATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGTAGTACCAGGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD068379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aggttactGTACTACA TCCACATACCATAAACACCAGTTATAAAAGCTGAAGTATATTCTACACTTTTCTCACCCCATTTCCATTGATCTTCTGTAACCTGACTAAAGATAAAGAATGCAACAGTAAGTCCAGCGCATATTATTGTATAAGTTAAAAGTACCATAAAACGATATATAATACCACTATAATATCGACGTTGTTCCATTGGAAGATTGTTTAACAAACGACGTTTGCCCAATATTTGTATAAATGCTTTAACAACTAATATAGTTAAATAGATCATATAAGCAATG]


>consensus_7417#0 GTAGTAATATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTATTAAGTAGTAAT AGTCGTAGTCCTAGTAGTAGCAGTAGTAGTAGTACTTACTGTTGTTTGTAAATCATTTCA TGTTAATTTTTATTCAAATGCTTCTTTACGTATAAATTTCAAACCTTCTGTTAAAAGATA AGATTTTGCTTCAACATTTGATAAAGATGTAGATGTAGATGGTAAATTCTCTTTATAATC AATTGATTGTTTTGGAACTAATTGAATTGTTTCTGATTGTTTATCATATATGTCAATATC ATGACCTATAAATGAATCATGTATTGTTGCAATAGTAGAAGCACAGGTATTACTATTAGT AGTACCAGGTAATATTGTCGTTGTTGTTACAGAATTATGAATTAATAATCGATTGTATAA TTGTTGACCAGCAACACTACGAAATTTATGTGATGGTGAATACAAACACAATACAGCTAC AACGTATACATTCCACATACCATAAACACCAGTTATAAAAGCTGAAGTATATTCTACACT TTTCTCACCCCATTTCCATTGATCTTCTGTAACCTGACTAAAGATAAAGAATGCAACAGT AAGTCCAGCGCATATTATTGTATAAGTTAAAAGTACCATAAAACGATATATAATACCACT ATAATATCGACGTTGTTCCATTGGAAGATTGTTTAACAAACGACGTTTGCCCAATATTTG TATAAATGCTTTAACAACTAATATAGTTAAATAGATCATATAAGCAATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)