These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7422#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 570 fasta sequence [ACTCGACTACAAACAATTAAACATATTGAAGGAGAGAAGGTATTCAAAGGAATAACAGATTG-TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGT--ACACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGAACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCCATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTATGTTTCCTTCTTTCAATCNCTTATTCTTCATTATAGNTGATTATTNTAATTTCCC] [+] EMBL CD181835 [ACTCGACTACAAACAATTAAACATATTGAAGGAGAGAAGGTATTCAAAGGAATAACAGATTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACANACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTT ] [+] EMBL CD153290 [ GACTACAAACAATTAAACATATTGAAGGAGAGAAGGTATTCAAAGGAATAACAGATTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACAGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGT ACACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGAACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCCATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTATGTTTCCTTCTTTCAATCNCTTATTCTTCATTATAGNTGATTATTNTAATTTCCC] [-] EMBL CD178808 [ AATAACAGATTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGT ACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGGACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGAAATGCATTCCTTCTCTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCTATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTATGTTTCCTTCTTTCAATCCCTTATTCTTCATTATAGTTGATTATT ] [-] EMBL CD179155 [ AATAACAGATTGTTTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTCAAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAA GAATGAAATGT ACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGGACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCTATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGAT ] [-] EMBL CD122232 [ TTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGTACACACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGAACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCCATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||