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Schistosoma mansoni
cluster # 7423 cluster # 7423       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7423#0 length = 578 sequences # 5  

consensusID : consensus_7423#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 578
fasta sequence
                              [GGAAACAAATGAATGTTCCATATGAATTATTTTGTACAGAATATCCAGGTCATGCAGAAAATTTTATCATAAATTTACCAAAAGCTAATCTTTTACGTTACCGTGCAATTGTTACGTGTTCAGGCGATGGACTAGTGTATGAAGTAATTAACGGACTCATTTCAAGAAAAGATTATGATGACGTAATTGAGGAGGATACAATACCTATTGGTATTCTACCAGGAGGCAGTGCTAATTCAACTGCTGCTTCAATTTGTTACCATTCTGGTTTATTAGGCAAATCATCACTTTTATCACACTGTGGTTTTCTGTTAACATTACCAATTGAAAATATACGAAATAAACAATCTCAACAAGTTAATGAACAAAATGAAAAATACAGTTGTACTTTACCAGTTTTACCGCGTATTACTCCTGTGAGTTGTATACACTTTGGAACATATGACACAAATTTTCATCGATACGGTATTCAAAGTATTGAATGGGGCTTCATTGCTGATTTAGACTACAAAAGTGAACGATTTCGTTGGATGGGTGAAAAAAGATNTCTACTTTATGCATGTTACTACCTTATGAAG]

[+] EMBL CD131453             [GGAAACAAATGAATGTTCCATATGAATTATTTTGTACAGAATATCCAGGTCATGCAGAAAATTTTATCATAAATTTACCAAAAGCTAATCTTTTACGTTACCGTGCAATTGTTACGTGTTCAGGCGATGGACTAGTGTATGAAGTAATTAACGGACTCATTTCAAGAAAAGATTATGATGACGTAATTGAGGAGGATACAATACCTATTGGTATTCTACCAGGAGGCAGTGCTAATTCAACTGCTGCTTCAATTTGTTACCATTCTGGTTTATTAGGCAAATCATCACTTTTATCACACTGTGGTTTCCTGTTAACATTACCAATTGAAAATATACGAAATAAACAATCTCAACAAGTTAATGAACAAAATGAAAAATACAGTTGTACTTTACCAGTTTTACCGCGTATTACTCCTGTGAGTTGTATACACTTTGGAACATATGACACAAATTTTCATCGATACGGTATTCAAAGTATTGAATGGGGCTTCATTGCTGATTTAGACTACAAAAGTGAACGATTTCGTTGGATGGGTGAAAAAAGATNTCTACTTTATGCATGTTACTACCTTATGAAG]
[+] EMBL CD121234             [                                                             TTTTATCATAAATTTACCAAAAGCTAATCTTTTACGTTACCGTGCAATTGTTACGTGTTCAGGCGATGGACTAGTGTATGAAGTAATTAACGGACTCATTTCAAGAAAAGATTATGATGACGTAATTGAGGAGGATACAATACCTATTGGTATTCTACCAGGAGGCAGTGCTAATTCAACTGCTGCTTCAATTTGTTACCATTCTGGTTTATTAGGCAAATCATCACTTTTATCACACTGTGGTTTTCTGTTAACATTACCAATTGGGAATATACGAAATAAACAATCTCAACAAGTTAATGAACAAAATGAAAAATACAGTTGTACTTTACCAGTTTTACCGCGTATTACTCCTGTGAGTTGTATACACTTTGGAACATATGACACAAATTTTCATCGATACGGTA                                                                                                              ]
[+] EMBL CD121261             [                                                             TTTTATCATAAATTTACCAAAAGCTAATCTTTTACGTTACCGTGCAATTGTTACGTGTTCAGGCGATGGACTAGTGTATGAAGTAATTAACGGACTCATTTCAAGAAAAGATTATGATGACGTAATTGAGGAGGATACAATACCTATTGGTATTCTACCAGGAGGCAGTGCTAATTCAACTGCTGCTTCAATTTGTTACCATTCTGGTTTATTAGGCAAATCATCACTTTTATCACACTGTGGTTTTCTGTTAACATTACCAATTGGGAATATACGAAATAAACAATCTCAACAAGTTAATGAACAAAATGAAAAATACAGTTGTACTTTACCAGTTTTACCGCGTATTACTCCTGTGAGTTGTATACACTTTGGAACATATGACACAAATTTTCATCGATACGGTA                                                                                                              ]
[+] EMBL CD121746             [                                                             TTTTATCATAAATTTACCAAAAGCTAATCTTTTACGTTACCGTGCAATTGTTACGTGTTCAGGCGATGGACTAGTGTATGAAGTAATTAACGGACTCATTTCAAGAAAAGATTATGATGACGTAATTGAGGAGGATACAATACCTATTGGTATTCTACCAGGAGGCAGTGCTAATTCAACTGCTGCTTCAATTTGTTACCATTCTGGTTTATTAGGCAAATCATCACTTTTATCACACTGTGGTTTTCTGTTAACATTACCAATTGAAAATATACGAAATAAACAATCTCAACAAGTTAATGAACAAAATGAAAAATACAGTTGTACTTTACCAGTTTTACCGCGTATTACTCCTGTGAGTTGTATACACTTTGGAACATATGACACAAATTTTCATCGATACGGTA                                                                                                              ]
[-] EMBL CD121226             [                                                              TTTATCATAAATTTACCAAAAGCTAATCTTTTACGTTACCGTGCAATTGTTACGTGTTCAGGCGATGGACTAGTGTATGAAGTAATTAACGGACTCATTTCAAGAAAAGATTATGATGACGTAATTGAGGAGGATACAATACCTATTGGTATTCTACCAGGAGGCAGTGCTAATTCAACTGCTGCTTCAATTTGTTACCATTCTGGTTTATTAGGCAAATCATCACTTTTATCACACTGTGGTTTTCTGTTAACATTACCAATTGAAAATATACGAAATAAACAATCTCAACAAGTTAATGAACAAAATGAAAAATACAGTTGTACTTTACCAGTTTTACCGCGTATTACTCCTGTGAGTTGTATACACTTTGGAACATATGACACAAATTTTCATCGATACGGTAT                                                                                                             ]


>consensus_7423#0 GGAAACAAATGAATGTTCCATATGAATTATTTTGTACAGAATATCCAGGTCATGCAGAAA ATTTTATCATAAATTTACCAAAAGCTAATCTTTTACGTTACCGTGCAATTGTTACGTGTT CAGGCGATGGACTAGTGTATGAAGTAATTAACGGACTCATTTCAAGAAAAGATTATGATG ACGTAATTGAGGAGGATACAATACCTATTGGTATTCTACCAGGAGGCAGTGCTAATTCAA CTGCTGCTTCAATTTGTTACCATTCTGGTTTATTAGGCAAATCATCACTTTTATCACACT GTGGTTTTCTGTTAACATTACCAATTGAAAATATACGAAATAAACAATCTCAACAAGTTA ATGAACAAAATGAAAAATACAGTTGTACTTTACCAGTTTTACCGCGTATTACTCCTGTGA GTTGTATACACTTTGGAACATATGACACAAATTTTCATCGATACGGTATTCAAAGTATTG AATGGGGCTTCATTGCTGATTTAGACTACAAAAGTGAACGATTTCGTTGGATGGGTGAAA AAAGATNTCTACTTTATGCATGTTACTACCTTATGAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)