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Schistosoma mansoni
cluster # 7425 cluster # 7425       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7425#0 length = 604 sequences # 5  

consensusID : consensus_7425#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 604
fasta sequence
                              [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTTTGAAACTCAGTAGCTGAATAAAATTCAACTCA]

[+] EMBL CD092217             [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTTTCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAGTGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGGTTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAANAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAATTTTGAAACTCAGTAGCTGAATAAAATTCAACTCA]
[+] EMBL CD092265             [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTCGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTAGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTTTGAAACTCAGTAGCT                 ]
[+] EMBL CD092277             [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGCATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTNTGAAACTCAGTAGCT                 ]
[+] EMBL CD092210             [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTTTCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATCGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAATTTTGAAACTCAGTAGCT                 ]
[-] EMBL CD092287             [ TGATAAACATGGTAGACATGACAATANAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTTTGAAACTCAGTAGCTG                ]


>consensus_7425#0 GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATA AACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGA ACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCA GTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGA ATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATA AACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAA CGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAA CATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGA CCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGT TAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTTTGAAACTCAGTAGCTGAATAAAATTCAA CTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)