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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7430#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 948 fasta sequence
[AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCACCACTTTAGTCGACTTTTACAACTCCGTAAATTTTTCGAACAAACCAGAAGCACGCGTAAAAGCCAACAGAACCTGACGAAGATAATAACAAGAGTAAACATTTTAAAAAATGTTGTAGAACAGTATTTAAAATTCAGCCACTAGAAATACTGATAATTGGTAACCGATATAATCTAAGAATGGAAAAGGAGAGAGGTAATAGCCAAGAAAAAGTGTTCATATCCCCCTTGCCTAAGTCTTATTAAATCTAAGTGCAACTTCTAATCAACTATGAGCTATAATGTAATCGGCTTTACATGAAGGATACCCGACTGTCCAAACGGAAATAGACGGAGTAAGTGTTAAACAAGTGACCTAATGGTTAAAGGACAACTGTTTCAATCACTAACCCACTAAGCTTCATAACTGTTCAGTATGAAAAACGAACTTTAAGCGAACAACTAGCAGTATCACATACCGGAATATGGGACCAA]
[+] EMBL CD073365 [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCC ]
[+] EMBL AA999413 [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGATGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGANNCAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGATTGACAATTTACAAAA ]
[+] EMBL AA999414 [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGCGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGANACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTA ]
[-] EMBL CD078907 [ AATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCA ]
[+] EMBL CD147228 [ TCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCACCACTTTAGTCGACTTTTACAACTCCGTAAATTTTTCGAACAAACCAGAAGCACGCGTAAAAGCCAACAGAACCTGACGAAGATAATAACAAGAGTAAACATTTTAAAAAATGTTGTAGAACAGTATTTAAAATTCAGCCACTAGAAATACTGATAATTGGTAACCGATATAATCTAAGAATGGAAAAGGAGAGAGGTAATAGCCAAGAAAAAGTGTTCATATCCCCCTTGCCTAAGTCTTATTAAATCTAAGTGCAACTTCTAATCAACTATGAGCTATAATGTAATCGGCTTTACATGAAGGATACCCGACTGTCCAAACGGAAATAGACGGAGTAAGTGTTAAACAAGTGACCTAATGGTTAAAGGACAACTGTTTCAATCACTAACCCACTAAGCTTCATAACTGTTCAGTATGAAAAACGAACTTTAAGCGAACAACTAGCAGTATCACATACCGGAATATGGGACCAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||