cluster # 7438

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7438 cluster # 7438 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7438#0 length = 465 sequences # 5

consensusID : consensus_7438#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 465
fasta sequence

                              [CAAGAACAAAATGTTGAAATTGCTGAAAGTCTATTCAAAGATATTGCCAGTTCATTAGATAATCAAGATATGGAATTATTGTTAGTTCGATCAAATCTATATGAAAAAATTGCTGAATTAAATCATTTAGAGTTAATTACAGATAAATTTGATGCGATTAAATTAGAGATTTATTTCCGAACTGGAGCTGTAAATCTAGGCTATTTAACAAATGAATCAGCAATGAATAATATGCATCATCACGCCGACGACGACGATGATGATGATGATGAGGAAAATTATGAAGATTTATCTATGCCTCTGGAATGCAATTCATCGTCGACCGGTTCTAATACATCGTCATCCATAGAATTGGCTAACAGACCATGCATAAATTCTACAGCTTGCCAAACAGATATAAGCTTAACAGATTCAAACGACCAATATGATTTAACTACTCAACAGTTTCAGCAACCAGCTAAACAG]

[+] EMBL CD163254             [CAAGAACAAAATGTTGAAATTGCTGAAAGTCTATTCAAAGATATTGCCAGTTCATTAGATAATCAAGATATGGAATTATTGTTAGTTCGATCAAATCTATATGAAAAAATTGCTGAATTAAATCATTTAGAGTTAATTACAGATAAATTTGATGCGATTAAATTAGAGATTTATTTCCGAACTGGAGCTGTAAATCTAGGCTATTTAACAAATGAATCAGCAATGAATAATATGCATCATCACGCCGACGACGACGATGATGATGATGATGAGGAAAATTATGAAGATTTATCTATGCCTCTGGAATGCAATTCATCGTCGACCGGTTCTAATACATCGTCATCCATAGAATTGGCTAACAGACCATGCATAAATTCTACAGCTTGCCAAACAGATATAAGCTTAACAGATTCAAACGACCGATATGATTTAACTACTCAACAGTTTCAGCAACCAGCTAAACAG]
[+] EMBL CD163396             [CAAGAACAAAATGTTGAAATTGCTGAAAGTCTATTCAAAGATATTGCCAGTTCATTAGATAATCAAGATATGGAATTATTGTTAGTTCGATCAAATCTATATGAAAAAATTGCTGAATTAAATCATTTAGAGTTAATTACAGATAAATTTGATGCGATTAAATTAGAGATTTATTTCCGAACTGGAGCTGTAAATCTAGGCTATTTAACAAATGAATCAGCAATGAATAATATGCATCATCACGCCGACGACGACGATGATGATGATGATGAGGAAAATTATGAAGATTTATCTATGCCTCTGGAATGCAATTCATCGTCGACCGGTTCTAATACATCGTCATCCATAGAATTGGCTAACAGACCATGCATAAATTCTACAGCTTGCCAAACAGATATAAGCTTAACAGATTCAAACGACCAATATGATTTAACTACTCAACAGTTTCAGCAACCAGCTAAACAG]
[+] EMBL CD163319             [CAAGAACAAAATGTTGAAATTGCTGAAAGTCTATTCAAAGATATTGCCAGTTCATTAGATAATCAAGATATGGAATTATTGTTAGTTCGATCAAATCTATATGAAAAAATTGCTGAATTAAATCATTTAGAGTTAATTACAGATAAATTTGATGCGATTAAATTAGAGATTTATTTCCGAACTGGAGCTGTAAATCTAGGCTATTTAACAAATGAATCAGCAATGAATAATATGCATCATCACGCCGACGACGACGATGATGATGATGATGAGGAAAATTATGAAGATTTATCTATGCCTCTGGAATGCAATTCATCGTCGACCGGTTCTAATACATCGTCATCCATAGAATTGGCTAACAGACCATGCATAAATTCTACAGCTTGCCAAACAGATATAAGCTTAACAGATTCAAACGACCAATATGATTTAACTACTCAACAGTTTCAGCAACCAGCTAAACA ]
[+] EMBL CD163347             [CAAGAACAAAATGTTGAAATTGCTGAAAGTCTATTCAAAGATATTGCCAGTTCATTAGATCATCAAGATATGGAATTATTGTTAGTTCGATCAAATCTATATGAAAAAATTGCTGAATTAAATCATTTAGAGTTAATTACAGATAAATTTGATGCGATTAAATTAGAGATTTATTTCCGAACTGGAGCTGTAAATCTAGGCTATTTAACAAATGAATCAGCAATGAATAATATGCATCATCACGCCGACGACGACGATGATGATGATGATGAGGAAAATTATGAAGATTTATCTATGCCTCTGGAATGCAATTCATCGTCGACCGGTTCTAATACATCGTCATCCATAGAATTGGCTAACAGACCATGCATAAATTCTACAGCTTGCCAAACAGATATAAGTTTAACAGATTCAAACGACCAATATGATT                                   ]
[+] EMBL CD163244             [CAAGAACAAAATGTTGAAATTGCTGAAAGTCTATTCAAAGATATTGCCAGTTCATTAGATAATCAAGATATGGAATTATTGTTAGTTCGATCAAATCTATATGAAAAAATTGCTGAATTAAATCATTTAGAGTTAATTACAGATAAATTTGATGCGATTAAATTAGAGATTTATTTCCGAACTGGAGCTGTAAATCTAGGCTATTTAACAAATGAATCAGCAATGAATAATATGCATCATCACGCCGACGACGACGATGATGATGATGATGAGGAAAATTATGAAGATTTATCTATGCCTCTGGAATGCAATTCATCGTCGACCGGTTCTAATACATCGTCATCCATAGAATTGGCTAACAGACCATGCATAAA                                                                                           ]




>consensus_7438#0
CAAGAACAAAATGTTGAAATTGCTGAAAGTCTATTCAAAGATATTGCCAGTTCATTAGAT
AATCAAGATATGGAATTATTGTTAGTTCGATCAAATCTATATGAAAAAATTGCTGAATTA
AATCATTTAGAGTTAATTACAGATAAATTTGATGCGATTAAATTAGAGATTTATTTCCGA
ACTGGAGCTGTAAATCTAGGCTATTTAACAAATGAATCAGCAATGAATAATATGCATCAT
CACGCCGACGACGACGATGATGATGATGATGAGGAAAATTATGAAGATTTATCTATGCCT
CTGGAATGCAATTCATCGTCGACCGGTTCTAATACATCGTCATCCATAGAATTGGCTAAC
AGACCATGCATAAATTCTACAGCTTGCCAAACAGATATAAGCTTAACAGATTCAAACGAC
CAATATGATTTAACTACTCAACAGTTTCAGCAACCAGCTAAACAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case