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Schistosoma mansoni
cluster # 7457 cluster # 7457       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7457#0 length = 748 sequences # 5  

consensusID : consensus_7457#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 748
fasta sequence
                              [GTTTATTACATCTGATGTAACAAACTACAAGATTTCTAATCTCTGGATAGTTTTCAAATGTATATCACTTTTTAATGCACCCATATCATGTGCAACTTTCCGGTGTTAACGTTCTCAAAACTCATCTGAAAATACATCATATTTAAATACTTTTTTTGTAACTACATTTTGTCTGGCTTTCAAGTTGTGTAAAATGTATCTTGTTG-ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGAAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC-AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAAGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGAATGTAAACGGGTTTACAGGAAGTTACTATTATTCACGTGCCATAAACACATGCCACACGCGCATGAGATTGAGGAATTCGCTGCGGA]

[+] EMBL CD166014             [GTTTATTACATCTGATGTAACAAACTACAAGATTTCTAATCTCTGGATAGTTTTCAAATGTATATCACTTTTTAATGCACCCATATCATGTGCAACTTTCCGGTGTTAACGTTCTCAAAACTCATCTGAAAATACATCATATTTAAATACTTTTTTTGTAACTACATTTTGTCTGGCTTTCAAGTTGTGTAANATGTATCTTGTTG ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAATAAAAACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD143575             [                                                                                                                   CAAAACTCATCTGAAAATAAATCATATTTAAATACTTTTTTTGTAACTACATTTTGTCTGGCTTTCAAGTTGTGTAAAATGTATCTTGTTG ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGAAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAAGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTNTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGAATGT                                                                                   ]
[-] EMBL CD143527             [                                                                                                                                                                                              anAATGTATC TGTTGAACTCAGTCTCGAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGAAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAAGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTCTACTCAGTCTCGACAGAATGTA                                                                                  ]
[-] EMBL CD143516             [                                                                                                                                                                                                    TATCTTGTTG ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATATTCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGGAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAGGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGAATGTA                                                                                  ]
[+] EMBL AW087125             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAGCAAAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGC AAATATATCCACCAAAAA TTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTCCTG AGTTGTA TTTCCTTAAATGTAGGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGATTGTAAACGGGTTTACAGGAAGTTACTATTATTCACGTGCCATAAACACATGCCACACGCGCATGAGATTGAGGAATTCGCTGCGGA]


>consensus_7457#0 GTTTATTACATCTGATGTAACAAACTACAAGATTTCTAATCTCTGGATAGTTTTCAAATG TATATCACTTTTTAATGCACCCATATCATGTGCAACTTTCCGGTGTTAACGTTCTCAAAA CTCATCTGAAAATACATCATATTTAAATACTTTTTTTGTAACTACATTTTGTCTGGCTTT CAAGTTGTGTAAAATGTATCTTGTTGACTCAGTCTCAAAAGTGTGATTATCTTACAAAGT GAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTC AATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGT TCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGAAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTAT TCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGCAAAAAATTCA AAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAG TTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAAGTTGAATAAAAAACAAGTCTA ATTTTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAG AATGTAAACGGGTTTACAGGAAGTTACTATTATTCACGTGCCATAAACACATGCCACACG CGCATGAGATTGAGGAATTCGCTGCGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)