These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7457#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 748 fasta sequence [GTTTATTACATCTGATGTAACAAACTACAAGATTTCTAATCTCTGGATAGTTTTCAAATGTATATCACTTTTTAATGCACCCATATCATGTGCAACTTTCCGGTGTTAACGTTCTCAAAACTCATCTGAAAATACATCATATTTAAATACTTTTTTTGTAACTACATTTTGTCTGGCTTTCAAGTTGTGTAAAATGTATCTTGTTG-ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGAAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC-AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAAGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGAATGTAAACGGGTTTACAGGAAGTTACTATTATTCACGTGCCATAAACACATGCCACACGCGCATGAGATTGAGGAATTCGCTGCGGA] [+] EMBL CD166014 [GTTTATTACATCTGATGTAACAAACTACAAGATTTCTAATCTCTGGATAGTTTTCAAATGTATATCACTTTTTAATGCACCCATATCATGTGCAACTTTCCGGTGTTAACGTTCTCAAAACTCATCTGAAAATACATCATATTTAAATACTTTTTTTGTAACTACATTTTGTCTGGCTTTCAAGTTGTGTAANATGTATCTTGTTG ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAATAAAAACCA ] [+] EMBL CD143575 [ CAAAACTCATCTGAAAATAAATCATATTTAAATACTTTTTTTGTAACTACATTTTGTCTGGCTTTCAAGTTGTGTAAAATGTATCTTGTTG ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGAAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAAGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTNTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGAATGT ] [-] EMBL CD143527 [ anAATGTATC TGTTGAACTCAGTCTCGAAAGTGTGATTATCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGAAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAAGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTCTACTCAGTCTCGACAGAATGTA ] [-] EMBL CD143516 [ TATCTTGTTG ACTCAGTCTCAAAAGTGTGATATTCTTACAAAGTGAGCTTTCATAGAATCCTGATTGCAAATGTGTAAACAAAACCCAGAACTTCGTTTCGTTCAATTTACTTGCTAACCAACTGCCTACATGTTAACTTCATTTTAATAATGCTTGTAGGCGTTCTTAAAATTGATTGTTTTAAGGGTTGGTGCGGAGTTACGTCGGTGTGTCGTCAATTTATTCGATCTGCTATAACTGAATTTCAAGCTGAAATACGCCACAGATTGTAGC AAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGCAAAATATATCCACCAAAAGGTTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTTCTGAAGTTGTATTTTCTTTAAATGTAAGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGAATGTA ] [+] EMBL AW087125 [ TGTAGCAAAAAAATTCAAAATCCCAATATTTATTTAGAAGAATCAACCAGCAAAAAATATGAGAAGGATTCAATCAGTTAAGTCGGTGAGAGGAAGC AAATATATCCACCAAAAA TTGAATAAAAAACAAGTCTAATTTCCTG AGTTGTA TTTCCTTAAATGTAGGTCAGCCAATTTTACTCAGTCTCGACAGATTGTAAACGGGTTTACAGGAAGTTACTATTATTCACGTGCCATAAACACATGCCACACGCGCATGAGATTGAGGAATTCGCTGCGGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||