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Schistosoma mansoni
cluster # 7458 cluster # 7458       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7458#0 length = 710 sequences # 5  

consensusID : consensus_7458#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 710
fasta sequence
                              [AGTATATGAAGTAGCTCGTGGTTTTCAAAAACTAATAACACAGACTGGTTGTTTACAAAATTAAAACAAAAATATTCACAAATTACAATTAATTATATACTGGTTTAAATATACGCCTAATGAACAAAGTGTGTCAAACTATTCGATACCAACAAACAATAAAATGATGAACAAAGAAGTTTTCTAGAATATTATCCACCCAAGAAAACATTCCGCTGAGGAATATTACGAATTTGAAGGTTAACTTAATTTATCTAGAAATAAAGAGTTAACAATCTAGCACTCATGTGAATGATTGAAGAGAATGAAACGATAAAAGAATGATTGTGTTCTTATTTGAAGAATCTATGTTCAGAATGGTGAATTTTTAATGAAATCGTAAAGATTGAAGAATACAAAGACTGAATCCATCACAGCGTCACCGATAACACATGTTTAATACTTGTATTAAAAATGAAATCAATAAAGAAATGTATAAGTAAAATATTCCGCTATCAAATTACAAAAAAATAATTCCTACCACAGAAATGTTGAGAATTTTCATCTCAATAACGTCTAACTTCTTAGACAAAAAACGGCCAGTTAAATATGTATACTACTTGTTCAACAGTAGTCAGTAGTAATGAACGTTTATTGTCAAGAATACTACTTGGAAAAACCAAAATCAGACCACACCGAAGAGCATATTTAGAACATTTAAAAAATAAAAT]

[+] EMBL CD097325             [AGTATATGAAGTAGCTCGTGGTTTTCAAAAACTAATAACACAGACTGGTTGTTTACAAAATTAAGACAAAAATATTCACAAATTACAATTAATTATATACTGGTTTAAATATACGCCTAATGAACAAAGTGTGTCAAACTATTCGATACCAACAAACAATAAAATGATGAACAAAGAAGTTTTCTAGAATATTATCCACCCAAGAAAACATTCCGCTGAGGAATATTACGAATTTGAAGG TAACTTAATTTATCTAGAAATAAAGAGTTAACAATCTAGCACTCATGTGAATGATTGAAGAGAATGAAACGATAAAAGAATGATTGTGTTCTTATTTGAAGAATCTATGTTCAGAATGGTGAATTTTTAATGAAATCGTAAAGATTGAAGAATACAAAGACTGAATCCATCACAGCGTCACCGATAACACATGTTTAATACTTGTATTAAAAATGAAATCAATAAAGAAATGTATAAGTAAAATATTCCGCTGTCAAATTACAAAAAAATAATTCCTACC                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD097406             [ GTATATGAAGTAGCTCGTGGTTTTCAAAAACTAATAACACAGACTGGTTGTTTACAAAATTAAAACAAAAATATTCACAAATTACAATTAATTATATACTGGTTTAAATATACGCCTAATGAACAAAGTGTGTCAAACTATTCGATACCAACAAACAATAAAATGATGAACAAAGAAGTTTTCTAGAATATTATCCACCCAAGAAAACATTCCGCTGAGGAATATTACGAATTTGAAGGTTAACTTAATTTATCTAGAAATAAAGAGTTAACAATCTAGCACTCATGTGAATGATTGAAGAGAATGAAACGATAAAAGAATGATTGTGTTCTTATTTGAAGAATCTATGTTCAGAATGGTGAATTTTTAATGAAATCGTAAAGATTGAAGAATACAAAGACTGAATCCATCACAGCGTCACCGATAACACATGTTTAATACTTGTATTAAAAATGAAATCAATAAAGAAATGTATAAGTAAAATATTCCGCTATCAAATTACAAAAAAATAATTCCTACCA                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD097407             [ GTATATGAAGTAGCTCGTGGTTTTCAAAAACTAATAACACAGACTGGTTGTTTACAAAATTAAAACAAAAATATTCACAAATTACAATTAATTATATACTGGTTTAAATATACGCCTAATGAACAAAGTGTGTCAAACTATTCGATACCAACAAACAATAAAATGATGAACAAAGAAGTTTTCTAGAATATTATCCACCCAAGAAAACATTCCGCTGAGGAATATTACGAATTTGAAGGTTAACTTAATTTATCTAGAAATAAAGAGTTAACAATCTAGCACTCATGTGAATGATTGAAGAGAATGAAACGATAAAAGAATGATTGTGTTCTTATTTGAAGAATCTATGTTCAGAATGGTGAATTTTTAATGAAATCGTAAAGATTGAAGAATACAAAGACTGAATCCATCACAGCGTCACCGATAACACATGTTTAATACTTGTATTAAAAATGAAATCAATAAAGAAATGTATAAGTAAAATATTCCGCTATCAAATTACAAAAAAATAATTCCTACCA                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD156639             [                                                                                                                            CAAAGTGTGTCAAACTATTCGATACCAACAAACAATAAAATGATGAACAAAGAAGTTTTCTAGAAGATTATCCACCCAAGAAAACATTCCGCTGAGGAATATTACGAATTTGAAGGTTAACTTAATTTATCTAGAAATAAAGAGTTAACAATCTAGCACTCATGTGAATGATTGAAGAGAATGAAACGATAAAAGAATGATTGTGTTCTTATTTGAAGAATCTATGTTCAGAATGGTGAATTTTTAATGAAATCGTAAAGATTGAAGAATACAAAGACTGAATCCATCACAGCGTCACCGATAACACATGTTTAATACTTGTATTAAAAATGAAATCAATAAAGAAATGTATAAGTAAAATATTCCGCTATCAAATTACAAAAAAATAATTCCTACCACAGAAATGTTGAGAATTTTCATCTCAATAACGTCTAACTTCTTAGACAAAAAACGGCCAGTTAAATATGTATACTACTTGTTCAACAGTAGTCAGTAGTAATGAACGTTTATTGTCAAGAATACTACTTGGAAAAACCAAAATCAGACCACACCGAAGAGCATATTTAGAACATTTAAAAAATAAAAT]
[+] EMBL CD156786             [                                                                                                                            CAAAGTGTGTCAAACTATTCGATACCAACAAACAATAAAATGATGAACAAAGAAGTTTTCTAGAAGATTATCCACCCAAGAAAACATTCCGCTGAGGAATATTACGAATTTGAAGGTTAACTTAATTTATCTAGAAATAAAGAGTTAACAATCTAGCACTCATGTGAATGATTGAAGAGAATGAAACGATAAAAGAATGATTGTGTTCTTATTTGAAGAATCTATGTTCAGAATGGTGAATTTTTAATGAAATCGTAAAGATTGAAGAATACAAAGACTGAATCCATCACAGCGTCACCGATAACACATGTTTAATACTTGTATTAAAAATGAAATCAATAAAGAAATGTATAAGTAAAATATTCCGCTATCAAATTACAAAAAAATAATTCCTACCACAGAAATGTTGAGAATTTTCATCTCAATAACGTCTAACTTCTTAGACAAAAAACGGTCAGTTAAATATGTATACTACTTGTTCAACAGTAGTCAGTAGTAATGAACGTTTATTGTANAGAATACTACTTGTANAAACANANATCAGA CAAACCGAAAAGCANATTTANGACATTAANAAAATAnnaa]


>consensus_7458#0 AGTATATGAAGTAGCTCGTGGTTTTCAAAAACTAATAACACAGACTGGTTGTTTACAAAA TTAAAACAAAAATATTCACAAATTACAATTAATTATATACTGGTTTAAATATACGCCTAA TGAACAAAGTGTGTCAAACTATTCGATACCAACAAACAATAAAATGATGAACAAAGAAGT TTTCTAGAATATTATCCACCCAAGAAAACATTCCGCTGAGGAATATTACGAATTTGAAGG TTAACTTAATTTATCTAGAAATAAAGAGTTAACAATCTAGCACTCATGTGAATGATTGAA GAGAATGAAACGATAAAAGAATGATTGTGTTCTTATTTGAAGAATCTATGTTCAGAATGG TGAATTTTTAATGAAATCGTAAAGATTGAAGAATACAAAGACTGAATCCATCACAGCGTC ACCGATAACACATGTTTAATACTTGTATTAAAAATGAAATCAATAAAGAAATGTATAAGT AAAATATTCCGCTATCAAATTACAAAAAAATAATTCCTACCACAGAAATGTTGAGAATTT TCATCTCAATAACGTCTAACTTCTTAGACAAAAAACGGCCAGTTAAATATGTATACTACT TGTTCAACAGTAGTCAGTAGTAATGAACGTTTATTGTCAAGAATACTACTTGGAAAAACC AAAATCAGACCACACCGAAGAGCATATTTAGAACATTTAAAAAATAAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)