These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7473#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1191 fasta sequence [ATTATCACCAAGAAAAAGAAGAAGAACAGCAACAACAACAAAAGTGTACGAAAGAGGTGGATTCAAACAACTTAATCAATACTACGAATAGTAATGGTAACCAAAATAACATTGAAATATTTAATTGGTTCATGTTTAATCCACAAGATAATAAATTACAATTGAAAGAGAATTCTTTACAGTTTCTAAGCTCAATATTCAATGAATATACTATGTATGGTCAGTACTTATTTACATTAGATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTA-TCTGCTG-CT-GTC-TCTGATTATTATTTAAATAGAGAATATCGTCCAGAGCACAAAATACAAACAAAATCAATGTTATCTACTACTACTACTACTGCTAAGAATAAGTGATGATTATTTAGACAAATCTTTATCAAGAATAGAAGA--TTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAAACAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAAACAACAAATAATATCACAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTAACCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG-AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAAAATAATTNCTTCCCCTGTCCAANNNNNNNNNNN] [-] EMBL CD163334 [ATTATCACCAAGAAAAAGAAGAAGAACAGCAACAACAACAAAAGTGTACGAAAGAGGTGGATTCAAACAACTTAATCAATACTACGAATAGTAATGGTAACCAAAATAACATTGAAATATTTAATTGGTTCATGTTTAATCCACAAGATAATAAATTACAATTGAAAGAGAATTCTTTACAGTTTCTAAGCTCAATATTCAATGAATATACTATGTATGGTCAGTACTTATTTACATTAGATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTA TCTGCTG CT GTC TCTGATTATTATTTAAATAGAGAA ] [-] EMBL CD197150 [ ATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTATTCTGCTGCCTGGTCTTCGGATTATAATTTAATAAGAGAATATCGTCCAGAGCACAAAATACAAACAAAATCAATGTTATCTACTACTACTACTACTGCTAAGAATAAGTGATGATTATTTAGACAAATCTTTATCAAGAATAGAAGA TTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAA ] [+] EMBL CD082958 [ tGAAGATTTTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAAACAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAAACAACAAATAATATCACAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTAACCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAAAATAATTNCTTCCCCTGTCCAANNNNNNNNNNN] [-] EMBL CD076541 [ TTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAACCAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAACCACCAAATAATATCCCAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTACCCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAATATAATTTCT ] [-] EMBL CD136620 [ cnnGGACGAAAGATTGGTNTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||