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Schistosoma mansoni
cluster # 7473 cluster # 7473       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7473#0 length = 1191 sequences # 5  

consensusID : consensus_7473#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1191
fasta sequence
                              [ATTATCACCAAGAAAAAGAAGAAGAACAGCAACAACAACAAAAGTGTACGAAAGAGGTGGATTCAAACAACTTAATCAATACTACGAATAGTAATGGTAACCAAAATAACATTGAAATATTTAATTGGTTCATGTTTAATCCACAAGATAATAAATTACAATTGAAAGAGAATTCTTTACAGTTTCTAAGCTCAATATTCAATGAATATACTATGTATGGTCAGTACTTATTTACATTAGATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTA-TCTGCTG-CT-GTC-TCTGATTATTATTTAAATAGAGAATATCGTCCAGAGCACAAAATACAAACAAAATCAATGTTATCTACTACTACTACTACTGCTAAGAATAAGTGATGATTATTTAGACAAATCTTTATCAAGAATAGAAGA--TTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAAACAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAAACAACAAATAATATCACAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTAACCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG-AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAAAATAATTNCTTCCCCTGTCCAANNNNNNNNNNN]

[-] EMBL CD163334             [ATTATCACCAAGAAAAAGAAGAAGAACAGCAACAACAACAAAAGTGTACGAAAGAGGTGGATTCAAACAACTTAATCAATACTACGAATAGTAATGGTAACCAAAATAACATTGAAATATTTAATTGGTTCATGTTTAATCCACAAGATAATAAATTACAATTGAAAGAGAATTCTTTACAGTTTCTAAGCTCAATATTCAATGAATATACTATGTATGGTCAGTACTTATTTACATTAGATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTA TCTGCTG CT GTC TCTGATTATTATTTAAATAGAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD197150             [                                                                                                                                                                                                                                                ATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTATTCTGCTGCCTGGTCTTCGGATTATAATTTAATAAGAGAATATCGTCCAGAGCACAAAATACAAACAAAATCAATGTTATCTACTACTACTACTACTGCTAAGAATAAGTGATGATTATTTAGACAAATCTTTATCAAGAATAGAAGA  TTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD082958             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tGAAGATTTTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAAACAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAAACAACAAATAATATCACAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTAACCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAAAATAATTNCTTCCCCTGTCCAANNNNNNNNNNN]
[-] EMBL CD076541             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAACCAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAACCACCAAATAATATCCCAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTACCCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAATATAATTTCT                       ]
[-] EMBL CD136620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cnnGGACGAAAGATTGGTNTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAA                                                                                              ]


>consensus_7473#0 ATTATCACCAAGAAAAAGAAGAAGAACAGCAACAACAACAAAAGTGTACGAAAGAGGTGG ATTCAAACAACTTAATCAATACTACGAATAGTAATGGTAACCAAAATAACATTGAAATAT TTAATTGGTTCATGTTTAATCCACAAGATAATAAATTACAATTGAAAGAGAATTCTTTAC AGTTTCTAAGCTCAATATTCAATGAATATACTATGTATGGTCAGTACTTATTTACATTAG ATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAG CGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTATCTG CTGCTGTCTCTGATTATTATTTAAATAGAGAATATCGTCCAGAGCACAAAATACAAACAA AATCAATGTTATCTACTACTACTACTACTGCTAAGAATAAGTGATGATTATTTAGACAAA TCTTTATCAAGAATAGAAGATTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAA TTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGAT CATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATA GTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAAACAGAATAAT ACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAAA CAACAAATAATATCACAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCAT GAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTAACCTTTTGTAAGATTATAATCTGTT CAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTG TTAGCGGGACGAAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTG ATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTC TCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATC TATCCTTGTTATTTGGAAAATAATTNCTTCCCCTGTCCAANNNNNNNNNNN



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)