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Schistosoma mansoni
cluster # 7502 cluster # 7502       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7502#0 length = 1477 sequences # 5  

consensusID : consensus_7502#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1477
fasta sequence
                              [CAACGAAATGGAAAGATTAAATATCGTTACATGATCTTCGTTCGTCGAATATGCAAAGAAACATGCGGTTTCGTTCATCTATAATATTGCAAATGCGGAGCTTTCTATGTCAAAATAATGGTTTTACTGAAATCGAAACTCCATATTTGTTCAAAATTACTCCAGGGGGTGCCCGTGAGTTTGTTGTACCTACCAAGTTTCCTGGATTATGGTATAGCTTACCTCAAAGCCCTCAACAATTCAAACAACTTTTGATGATAGGTGGATTTAGTAAATACATGCAGGTCGCTAGATGTNTTCGCGATGAGACTTCTAGGTCTGACAGACAANCCGAGTTTACTCAGTTGGACATATAAATGGCATTTATCACTCCAGATGATATTTATGAAATAATTGAGAATATGTTGTTATATATCTGGCCTACAGTTCAGAGTACTTCAAGTTGTCAGCCAATATCGACACCTTTTATGCGCATGCAGTATTGTGATGCTATGTCACGATATGGAAGTGACAAACCATATGTACGCTTTGGGTTCTTGTTTTCATATTCCGCAGTTGATGGACACACCGGTTTCAATATATCAAGTAAATACTCATCAAATTTAAGTGCTGAAGATTTGGATTCCTTGGAAGATTTGGTTTTTCGCCTAACCGGTCAAAGAATATCAATTTTTACAGTTCAAAATATCAAGTCAAACCAGTTGGACTTACTAAATTTATTAAAACCAGAGTGTGGTGATTTAGTTGTCTTCATTAAAGGAAATACAGAAATTGAGTTAAAAGCATTGGGCATGGCACGAGTTGAAGTTGCTAAGCTTATTGATTCGAAAGGTTTGTCAATATATGAACCTGGATTCCATTTTCTTTGGATAAATCAATTTCCATTGTTTGAAAAAAATAACTTAGGTAAATGGAAATCAGTGCACCACCCGTTCACTGCTGCGTCACCAGAGACAGCACATTTCTTGTATACTGATCCGAGCAAAGTTATCGGTTTACATTACGATTTAGTTTGTAATGGTCAAGAGGTTGGAGGTGGTTCAATCCGAGTACATAATCCTGAGGTGCAAAAGTATGTTTTTACCGAAATTCTTAAGGAAAATTCTTGTGAAATGGAATACTTTTTAACTGCCCTGAATTCANGAACTCCACCGCATGGTGGGATTGCGTTAGGTCTTGATCGTTTAAATTGCATAATTTGTAAATGCCAAATCCATCAGAGATGTAATTGCTTTCCCAAAAGCAGCCGATGGGAAGGATCTCTTATGTGGGACACCAACTATGGTAGATGATGAAATCTTATCACAGTATTGCATTTCTGTTTCCAATCTTAATAAAAGTTGATTTCCAACTGATAATTTTAACCTTTCTAAATAGTGTTTGCTTTAGCAACATCACAGTAGTTTGGGTATAATTATTGTTAGGAATATTTTACCATCATGGTATCCTAATGTTTATGAGTATTGTAAATATAATT]

[+] EMBL CD069094             [CAACGAAATGGAAAGATTAAATATCGTTACATGATCTTCGTTCGTCGAATATGCAAAGAAACATGCGGTTTCGTTCATCTATAATATTGCAAATGCGGAGCTTTCTATGTCAAAATAATGGTTTTACTGAAATCGAAACTCCATATTTGTTCAAAATTACTCCAGGGGGTGCCCGTGAGTTTGTTGTACCTACCAAGTTTCCTGGATTATGGTATAGCTTACCTCAAAGCCCTCAACAATTCAAACAACTTTTGATGATAGGTGGATTTAGTAAATACATGCAGGTCGCTAGATGTNTTCGCGATGAGACTTCTAGGTCTGACAGACAANCCGAGTTTACTCAGTTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BF936086             [                                                                                                                                                                TCCAGGGGGTGCCCGTGAGTTTGTTGTACCTACCAAGTTTCCTGGATTATGGTATTGCTTACCTCAAAGCCCTCAACAATTCAAACAACTTTTGATGATAAGTGGATTTAGTAAATACATGCAGGTCGCTAGATGTTTTCTCCATGAGACTTCTAGGTCTGACAGACAACCCGAGTTTACTCAGTTGGACATATAAATGGCATTTATCACTCCAGATGATATTTATGAAATAATTGAGAATATGTTGTTATATATCTGGCCTACAGTTCAGAGTACTTCAAGTTGTCAGCCAATATCGACACCTTTTATGCGCATGCAGTATTGTGATGCTATGTCACGATATGGAAGTGACAAACCATATGTACGCTTTGGGTTCTTGTTTTCATATTCCGCAGTTGATGGACACACCGGTTTCAATATATCAAGTAAATACTCATCAAATTTAAGTGCTGAAGATTTGGATTCCTTGGAAGATTTGGTTTTTCGCCTAACCGGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD082989             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTGGATTCCTTGGAAGATTTGGTTTTTCGCCTAACCGGTCAAAGAATATCAATTTTTACAGTTCAAAATATCAAGTCAAACCAGTTGGACTTACTAAATTTATTAAAACCAGAGTGTGGTGATTTAGTTGTCTTCATTAAAGGAAATACAGAAATTGAGTTAAAAGCATTGGGCATGGCACGAGTTGAAGTTGCTAAGCTTATTGATTCGAAAGGTTTGTCAATATATGAACCTGGATTCCATTTTCTTTGGATAAATCAATTTCCATTGTTTGAAAAAAATAACTTAGGTAAATGGAAATCAGTGCACCACCCGTTCACTGCTGCGTCACCAGAGACAGCACATTTCTTGTATACTGATCCGAGCAAAGTTATCGGTTTACATTACGATTTAGTTTGTAATGGTCAAGAGGTTGGAGGTGGTTCAATCCGAGTACATAATCCTGAGGTGCAAAAGTATGTTTTTACCGAAATTCTTAAGGAAAATTCTTGTGAAATGGAATACTTTTTAACTGCCCTGAATTCANGAACTCCACCGCATGGTGGGATTGCGTTAGGTCTTGATCGTTTAAATTGCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD180164             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGCTTATTGATTCGAAAGGTTTGTCAATATATGAACCTGGATTCCATTTTCTTTGGATAAATCAATTTCCATTGTTTGAAAAAAATAACTTACGTAAATGGAAATCAGTGCACCACCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD076572             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGCTGCGTCACCAGAGACAGCACATTTCTTGTATACTGATCCGAGCAAAGTTATCGGTTTACATTACGATTTAGTTTGTAATGGTCAAGAGGTTGGAGGTGGTTCAATCCGAGTACATAATCCTGAGGTGCAAAAGTATGTTTTTACCGAAATTCTTAAGGAAAATTCTTGTGAAATGGAATACTTTTTAACTGCCCTGAATTCAGGAACTCCACCGCATGGTGGGATTGCGTTAGGTCTTGATCGTTT AATTGCAATATTTGTAAATGCCAAATCCATCAGAGATGTAATTGCTTTCCCAAAAGCAGCCGATGGGAAGGATCTCTTATGTGGGACACCAACTATGGTAGATGATGAAATCTTATCACAGTATTGCATTTCTGTTTCCAATCTTAATAAAAGTTGATTTCCAACTGATAATTTTAACCTTTCTAAATAGTGTTTGCTTTAGCAACATCACAGTAGTTTGGGTATAATTATTGTTAGGAATATTTTACCATCATGGTATCCTAATGTTTATGAGTATTGTAAATATAATT]


>consensus_7502#0 CAACGAAATGGAAAGATTAAATATCGTTACATGATCTTCGTTCGTCGAATATGCAAAGAA ACATGCGGTTTCGTTCATCTATAATATTGCAAATGCGGAGCTTTCTATGTCAAAATAATG GTTTTACTGAAATCGAAACTCCATATTTGTTCAAAATTACTCCAGGGGGTGCCCGTGAGT TTGTTGTACCTACCAAGTTTCCTGGATTATGGTATAGCTTACCTCAAAGCCCTCAACAAT TCAAACAACTTTTGATGATAGGTGGATTTAGTAAATACATGCAGGTCGCTAGATGTNTTC GCGATGAGACTTCTAGGTCTGACAGACAANCCGAGTTTACTCAGTTGGACATATAAATGG CATTTATCACTCCAGATGATATTTATGAAATAATTGAGAATATGTTGTTATATATCTGGC CTACAGTTCAGAGTACTTCAAGTTGTCAGCCAATATCGACACCTTTTATGCGCATGCAGT ATTGTGATGCTATGTCACGATATGGAAGTGACAAACCATATGTACGCTTTGGGTTCTTGT TTTCATATTCCGCAGTTGATGGACACACCGGTTTCAATATATCAAGTAAATACTCATCAA ATTTAAGTGCTGAAGATTTGGATTCCTTGGAAGATTTGGTTTTTCGCCTAACCGGTCAAA GAATATCAATTTTTACAGTTCAAAATATCAAGTCAAACCAGTTGGACTTACTAAATTTAT TAAAACCAGAGTGTGGTGATTTAGTTGTCTTCATTAAAGGAAATACAGAAATTGAGTTAA AAGCATTGGGCATGGCACGAGTTGAAGTTGCTAAGCTTATTGATTCGAAAGGTTTGTCAA TATATGAACCTGGATTCCATTTTCTTTGGATAAATCAATTTCCATTGTTTGAAAAAAATA ACTTAGGTAAATGGAAATCAGTGCACCACCCGTTCACTGCTGCGTCACCAGAGACAGCAC ATTTCTTGTATACTGATCCGAGCAAAGTTATCGGTTTACATTACGATTTAGTTTGTAATG GTCAAGAGGTTGGAGGTGGTTCAATCCGAGTACATAATCCTGAGGTGCAAAAGTATGTTT TTACCGAAATTCTTAAGGAAAATTCTTGTGAAATGGAATACTTTTTAACTGCCCTGAATT CANGAACTCCACCGCATGGTGGGATTGCGTTAGGTCTTGATCGTTTAAATTGCATAATTT GTAAATGCCAAATCCATCAGAGATGTAATTGCTTTCCCAAAAGCAGCCGATGGGAAGGAT CTCTTATGTGGGACACCAACTATGGTAGATGATGAAATCTTATCACAGTATTGCATTTCT GTTTCCAATCTTAATAAAAGTTGATTTCCAACTGATAATTTTAACCTTTCTAAATAGTGT TTGCTTTAGCAACATCACAGTAGTTTGGGTATAATTATTGTTAGGAATATTTTACCATCA TGGTATCCTAATGTTTATGAGTATTGTAAATATAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)