These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7502#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1477 fasta sequence [CAACGAAATGGAAAGATTAAATATCGTTACATGATCTTCGTTCGTCGAATATGCAAAGAAACATGCGGTTTCGTTCATCTATAATATTGCAAATGCGGAGCTTTCTATGTCAAAATAATGGTTTTACTGAAATCGAAACTCCATATTTGTTCAAAATTACTCCAGGGGGTGCCCGTGAGTTTGTTGTACCTACCAAGTTTCCTGGATTATGGTATAGCTTACCTCAAAGCCCTCAACAATTCAAACAACTTTTGATGATAGGTGGATTTAGTAAATACATGCAGGTCGCTAGATGTNTTCGCGATGAGACTTCTAGGTCTGACAGACAANCCGAGTTTACTCAGTTGGACATATAAATGGCATTTATCACTCCAGATGATATTTATGAAATAATTGAGAATATGTTGTTATATATCTGGCCTACAGTTCAGAGTACTTCAAGTTGTCAGCCAATATCGACACCTTTTATGCGCATGCAGTATTGTGATGCTATGTCACGATATGGAAGTGACAAACCATATGTACGCTTTGGGTTCTTGTTTTCATATTCCGCAGTTGATGGACACACCGGTTTCAATATATCAAGTAAATACTCATCAAATTTAAGTGCTGAAGATTTGGATTCCTTGGAAGATTTGGTTTTTCGCCTAACCGGTCAAAGAATATCAATTTTTACAGTTCAAAATATCAAGTCAAACCAGTTGGACTTACTAAATTTATTAAAACCAGAGTGTGGTGATTTAGTTGTCTTCATTAAAGGAAATACAGAAATTGAGTTAAAAGCATTGGGCATGGCACGAGTTGAAGTTGCTAAGCTTATTGATTCGAAAGGTTTGTCAATATATGAACCTGGATTCCATTTTCTTTGGATAAATCAATTTCCATTGTTTGAAAAAAATAACTTAGGTAAATGGAAATCAGTGCACCACCCGTTCACTGCTGCGTCACCAGAGACAGCACATTTCTTGTATACTGATCCGAGCAAAGTTATCGGTTTACATTACGATTTAGTTTGTAATGGTCAAGAGGTTGGAGGTGGTTCAATCCGAGTACATAATCCTGAGGTGCAAAAGTATGTTTTTACCGAAATTCTTAAGGAAAATTCTTGTGAAATGGAATACTTTTTAACTGCCCTGAATTCANGAACTCCACCGCATGGTGGGATTGCGTTAGGTCTTGATCGTTTAAATTGCATAATTTGTAAATGCCAAATCCATCAGAGATGTAATTGCTTTCCCAAAAGCAGCCGATGGGAAGGATCTCTTATGTGGGACACCAACTATGGTAGATGATGAAATCTTATCACAGTATTGCATTTCTGTTTCCAATCTTAATAAAAGTTGATTTCCAACTGATAATTTTAACCTTTCTAAATAGTGTTTGCTTTAGCAACATCACAGTAGTTTGGGTATAATTATTGTTAGGAATATTTTACCATCATGGTATCCTAATGTTTATGAGTATTGTAAATATAATT] [+] EMBL CD069094 [CAACGAAATGGAAAGATTAAATATCGTTACATGATCTTCGTTCGTCGAATATGCAAAGAAACATGCGGTTTCGTTCATCTATAATATTGCAAATGCGGAGCTTTCTATGTCAAAATAATGGTTTTACTGAAATCGAAACTCCATATTTGTTCAAAATTACTCCAGGGGGTGCCCGTGAGTTTGTTGTACCTACCAAGTTTCCTGGATTATGGTATAGCTTACCTCAAAGCCCTCAACAATTCAAACAACTTTTGATGATAGGTGGATTTAGTAAATACATGCAGGTCGCTAGATGTNTTCGCGATGAGACTTCTAGGTCTGACAGACAANCCGAGTTTACTCAGTTGGA ] [+] EMBL BF936086 [ TCCAGGGGGTGCCCGTGAGTTTGTTGTACCTACCAAGTTTCCTGGATTATGGTATTGCTTACCTCAAAGCCCTCAACAATTCAAACAACTTTTGATGATAAGTGGATTTAGTAAATACATGCAGGTCGCTAGATGTTTTCTCCATGAGACTTCTAGGTCTGACAGACAACCCGAGTTTACTCAGTTGGACATATAAATGGCATTTATCACTCCAGATGATATTTATGAAATAATTGAGAATATGTTGTTATATATCTGGCCTACAGTTCAGAGTACTTCAAGTTGTCAGCCAATATCGACACCTTTTATGCGCATGCAGTATTGTGATGCTATGTCACGATATGGAAGTGACAAACCATATGTACGCTTTGGGTTCTTGTTTTCATATTCCGCAGTTGATGGACACACCGGTTTCAATATATCAAGTAAATACTCATCAAATTTAAGTGCTGAAGATTTGGATTCCTTGGAAGATTTGGTTTTTCGCCTAACCGGTCAA ] [+] EMBL CD082989 [ ATTTGGATTCCTTGGAAGATTTGGTTTTTCGCCTAACCGGTCAAAGAATATCAATTTTTACAGTTCAAAATATCAAGTCAAACCAGTTGGACTTACTAAATTTATTAAAACCAGAGTGTGGTGATTTAGTTGTCTTCATTAAAGGAAATACAGAAATTGAGTTAAAAGCATTGGGCATGGCACGAGTTGAAGTTGCTAAGCTTATTGATTCGAAAGGTTTGTCAATATATGAACCTGGATTCCATTTTCTTTGGATAAATCAATTTCCATTGTTTGAAAAAAATAACTTAGGTAAATGGAAATCAGTGCACCACCCGTTCACTGCTGCGTCACCAGAGACAGCACATTTCTTGTATACTGATCCGAGCAAAGTTATCGGTTTACATTACGATTTAGTTTGTAATGGTCAAGAGGTTGGAGGTGGTTCAATCCGAGTACATAATCCTGAGGTGCAAAAGTATGTTTTTACCGAAATTCTTAAGGAAAATTCTTGTGAAATGGAATACTTTTTAACTGCCCTGAATTCANGAACTCCACCGCATGGTGGGATTGCGTTAGGTCTTGATCGTTTAAATTGCATA ] [+] EMBL CD180164 [ AGCTTATTGATTCGAAAGGTTTGTCAATATATGAACCTGGATTCCATTTTCTTTGGATAAATCAATTTCCATTGTTTGAAAAAAATAACTTACGTAAATGGAAATCAGTGCACCACCCGT ] [-] EMBL CD076572 [ TGCTGCGTCACCAGAGACAGCACATTTCTTGTATACTGATCCGAGCAAAGTTATCGGTTTACATTACGATTTAGTTTGTAATGGTCAAGAGGTTGGAGGTGGTTCAATCCGAGTACATAATCCTGAGGTGCAAAAGTATGTTTTTACCGAAATTCTTAAGGAAAATTCTTGTGAAATGGAATACTTTTTAACTGCCCTGAATTCAGGAACTCCACCGCATGGTGGGATTGCGTTAGGTCTTGATCGTTT AATTGCAATATTTGTAAATGCCAAATCCATCAGAGATGTAATTGCTTTCCCAAAAGCAGCCGATGGGAAGGATCTCTTATGTGGGACACCAACTATGGTAGATGATGAAATCTTATCACAGTATTGCATTTCTGTTTCCAATCTTAATAAAAGTTGATTTCCAACTGATAATTTTAACCTTTCTAAATAGTGTTTGCTTTAGCAACATCACAGTAGTTTGGGTATAATTATTGTTAGGAATATTTTACCATCATGGTATCCTAATGTTTATGAGTATTGTAAATATAATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||