Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7525 cluster # 7525       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7525#0 length = 767 sequences # 5  

consensusID : consensus_7525#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 767
fasta sequence
                              [NCCACTCTAGAGGATCCCCTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGCTACTACTACTAACAACGGCATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTTGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTAATTAATATGATGGAATTATCTTCAATACAACATATGACAACAATTGAATGGTCAAATCATATTGCTAATTTACGAGGGACATTGGCTTGCTTTCCAGGCAAAAAAACCGTCAACTATACGCATAGATCAATTAGATCGTCAATCTGTAACAGGTCAATCAAATCAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAATGATGAATAAGCCAAGAATTAGTACTTCTGATCGTGTACAGTTAGTACAATTAGCCAATGAATTAGAAGAGATGGAACATTCTGGAGTACATCGACGTGAAATTACTGTAGAGATAAGTTGTGAAGGTTTTTATCGAACTGGAATGCGACCAGATATTCCACAATATGCATTGAATTTAGTCTCAGAGGCTCCCCTTAATCGAATTCCCACGAAAACC]

[+] EMBL CD167055             [NCCACTCTAGAGGATCCCCTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGCTACTACTACTAACAACGGTATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTGGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTAATTAATATGATGGAATTATCTTCAATCCAACATATGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD149299             [           tGATACATTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGCTACTACTACTAACAACGGCATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTTGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTTATTAATATGATGGAATTATCTTCAATACAACATATGACAACAATTGAATGGTCAAATCATATTGCTAATTTACGAGGGACATTGGCTTGCTTTCCAGGCAAAAAAACCGTCAACTATACGCATAGATCAATTAGATCGTCAATCTGTAACAGGTCAATCAAATCAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAA                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD167054             [          acGATCCCCTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGGTACTACTACTAACAACGGCATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTTGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTAATTAATATGATGGAATTATCTTCAATACAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD149650             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGAATTATCTTCAATACAACATATGACAACAATTGAATGGTCAAATCATATTGCTAATTTACGAGGGACATTGGCTTGCTTTTCAGGCAAAAAAACCGTCAACTATACGCATAGATCAATTAGATCGTCAATCTGTAACAGGTCAATCAAATCAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAATGATGAATAAGCCAAGAATTAGTACTTCTGATCGTGTACAGTTAGTACAATTAGCCAATGAATTAGAAGAGATGGAACATTCTGGAGTACATCGACGTGAAATTACTGTAGAGATAAGTTGTGAAGGTTTTTATCGAACTGGAATGCGACCAGATATTCCACAATATGCATTGAATTTAGTCTCAGAGGCTCCCCTTAATCGAATTCCCACGAAAACC]
[+] EMBL CD112406             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAATGATGAATAAGCCAAGAATTAGTACTTCTGATCGTGTACAGTTAGTACAATTAGCCAATGAATTAGAAGAGATGGAACATTCTGGAGTACATCGACGTGAAATTACTGTAGAGATAAGTTGTGAAGGTTTTTATCGAACTGGAATGCGA                                                                     ]


>consensus_7525#0 NCCACTCTAGAGGATCCCCTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTAT TACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGCTACTACTACTAACAACGGCATTTC AGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTTGTGTCGATAA TAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTG GTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTAATTAATATGATGGAATTATCTTCAATACAACATAT GACAACAATTGAATGGTCAAATCATATTGCTAATTTACGAGGGACATTGGCTTGCTTTCC AGGCAAAAAAACCGTCAACTATACGCATAGATCAATTAGATCGTCAATCTGTAACAGGTC AATCAAATCAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGA AATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTAC AATATTTAATGATGAATAAGCCAAGAATTAGTACTTCTGATCGTGTACAGTTAGTACAAT TAGCCAATGAATTAGAAGAGATGGAACATTCTGGAGTACATCGACGTGAAATTACTGTAG AGATAAGTTGTGAAGGTTTTTATCGAACTGGAATGCGACCAGATATTCCACAATATGCAT TGAATTTAGTCTCAGAGGCTCCCCTTAATCGAATTCCCACGAAAACC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)