These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7525#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 767 fasta sequence [NCCACTCTAGAGGATCCCCTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGCTACTACTACTAACAACGGCATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTTGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTAATTAATATGATGGAATTATCTTCAATACAACATATGACAACAATTGAATGGTCAAATCATATTGCTAATTTACGAGGGACATTGGCTTGCTTTCCAGGCAAAAAAACCGTCAACTATACGCATAGATCAATTAGATCGTCAATCTGTAACAGGTCAATCAAATCAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAATGATGAATAAGCCAAGAATTAGTACTTCTGATCGTGTACAGTTAGTACAATTAGCCAATGAATTAGAAGAGATGGAACATTCTGGAGTACATCGACGTGAAATTACTGTAGAGATAAGTTGTGAAGGTTTTTATCGAACTGGAATGCGACCAGATATTCCACAATATGCATTGAATTTAGTCTCAGAGGCTCCCCTTAATCGAATTCCCACGAAAACC] [+] EMBL CD167055 [NCCACTCTAGAGGATCCCCTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGCTACTACTACTAACAACGGTATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTGGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTAATTAATATGATGGAATTATCTTCAATCCAACATATGAC ] [+] EMBL CD149299 [ tGATACATTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGCTACTACTACTAACAACGGCATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTTGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTTATTAATATGATGGAATTATCTTCAATACAACATATGACAACAATTGAATGGTCAAATCATATTGCTAATTTACGAGGGACATTGGCTTGCTTTCCAGGCAAAAAAACCGTCAACTATACGCATAGATCAATTAGATCGTCAATCTGTAACAGGTCAATCAAATCAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAA ] [+] EMBL CD167054 [ acGATCCCCTTAATGCCGAGATTTATACGTATTTTGTCAAATACTACTATTACTACCAATGATAATTTTTCGATTACAACCACTGGTACTACTACTAACAACGGCATTTCAGTAGATAACGGTAAAGAACATAATGTCGAGTTAAATAAATCAATCGTTTGTGTCGATAATAGTGATAATAATACAGTAATTGGGGAATTACTACCCGTTCATGTAATAATGCGACATTGGTTAGAAGAGGCACTGACTCCAGTAATTAATATGATGGAATTATCTTCAATACAACAT ] [-] EMBL CD149650 [ TGGAATTATCTTCAATACAACATATGACAACAATTGAATGGTCAAATCATATTGCTAATTTACGAGGGACATTGGCTTGCTTTTCAGGCAAAAAAACCGTCAACTATACGCATAGATCAATTAGATCGTCAATCTGTAACAGGTCAATCAAATCAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAATGATGAATAAGCCAAGAATTAGTACTTCTGATCGTGTACAGTTAGTACAATTAGCCAATGAATTAGAAGAGATGGAACATTCTGGAGTACATCGACGTGAAATTACTGTAGAGATAAGTTGTGAAGGTTTTTATCGAACTGGAATGCGACCAGATATTCCACAATATGCATTGAATTTAGTCTCAGAGGCTCCCCTTAATCGAATTCCCACGAAAACC] [+] EMBL CD112406 [ CAAACCATATTAATTTATCCACTCATAGTACACATGACTTATACACCAATGAAATTAAGTTTAACACGTGAACCCAAGTATAAATGTGTGCTGAAAAATTTTATGAAATTACAATATTTAATGATGAATAAGCCAAGAATTAGTACTTCTGATCGTGTACAGTTAGTACAATTAGCCAATGAATTAGAAGAGATGGAACATTCTGGAGTACATCGACGTGAAATTACTGTAGAGATAAGTTGTGAAGGTTTTTATCGAACTGGAATGCGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||