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Schistosoma mansoni
cluster # 7541 cluster # 7541       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7541#0 length = 929 sequences # 5  
consensusID : consensus_7541#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 929
fasta sequence 
                              [ACATGAACATTTTGTAGCAACTCCAGTCGTTGACTATGCACTTGAAGTTGAGAAAATTACCACTAATAAGCGTCCAAATTTAATTTTGAATGTTGATGGTATGATTGGTGTAGCCATGGTAGATTTGTTAAGAAGCTCCGGTTATTTTACATGCGAAGAAGCTGAAGAGTATATCACTATTGGAACATTGAATGGCTTGTTTGTTTTGGGTCGATCAATCGGGTTTATTGGTCATTACCTGGATCAGAAACGTTTAAATCAAGGCTTGTATCGTCATCCATGGGAAGATATCTCTTATATGTTACCCAAATATCCATAGTCTATGTAAGACTGATATCTAAATTGGTCACTTCATTTATGAATTATTTATAAAAGTTTCTTACAAAACATCTTTTGCCATAATTATATATTCTTTTATGAATACTATTTAACTGATAATACGGTTGTGAGCATCATTGTTTTTCTATATTTACCATTCAATGTACTACTACTGTCATTATTATTTTTACTATTA-CTGAAATAAACATCAATTTTATCGATTTTCGATTTATAATTTATCAGAACCATCTGTAGTTGATCGCAATGCATTTCATTTATCATTATCGATTTTTTCCTTTTAAATGATCATATCAAGATCATGTTCTTTTCGTGTTGGTTACATTGAATACTCTTCTTGTCAAGTATTTTTGATAATTCCGTGAAATCTGTCTTTTTTTAATGACCATTTTATTCATTAGTTCCCTTGGTTACTCGTATATGCATGTAAAATACACACATACACAAGTGTGTTTTTGCTAGTATTCTTTCAACATATTTCAAATGGTTGTGGTTTCTTTCAATGGTTGTGAATACTACTCACTACTACTACTACTATTTCTAGTAGTAATACTATTTATAATTATGCTACGTACACAGCGACAAAATGTTCT]

[+] EMBL CD116224             [ACATGAACATTTTGTAGCAACTCCAGTCGTTGACTATGCACTTGAAGTTGAGAAAATTACCACTAATAAGCGTCCAAATTTAATTTTGAATGTTGATGGTATGATTGGTGTAGCCATGGTAGATTTGTTAAGAAGCTCCGGTTATTTTACATGCGAAGAAGCTGAAGAGTATATCACTATTGGAACATTGAATGGCTTGTTTGTTTTGGGTCGATCAATCGGGTTTATTGGTCATTACCTGGATCAGAAACGTTTAAATCAAGGCTTGTATCGTCATCCATGGGAAGATATCTCTTATATGTTACCCAAATATCCATAGTCTATGTAAGACTGATATCTAAATTGGTCACTTCATTTATGAATTATTTATAAAAGTTTCTTACAAAACATCTTTTGCCATAATTATATATTCTTTTATGAATACTATTTAACTGATAATACGGTTGTGAGCATCATTGTTTTTCTATATTTACCATTCAATGTACTACTACTGTCATTATTATTTTTACTATTA CTGAAATANACATCAANTTTATCGATTTTCGATTTATAATTTATCAGAACCATCTGTAGTTGATCGCAATGCATTTCATTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD112491             [                                                                                                                                  AGAAGCTCCGGTTATTTTACATGCGAAGAAGCTGAAGAGTATATCACTATTGGAACATTGAATGGCTTGTTTGTTTTGGGTCGATCAATCGGGTTTATTGGTCATTACCTGGATCAGAAACGTTTAAATCAAGGCTTGTATCGTCATCCATGGGAAGATATCTCTTATATGTTACCCAAATATCCATAGTCTATGTAAGACTGATATCTAAATTGGTCACTTCATTTATGAATTATTTATAAAAGTTTCTTACAAAACATCTTTTGCCATAATTATATATTCTTTTATGAATACTATTTAACTGATAATACGGTTGTGAGCATCATTGTTTTTCTATATTTACCATTCAATGTACTACTACTGTCATTATTATCTTTACTATTA CTGAAATAAACATCAATTTTATCGATTTTCGATTTATAATTTATCAGAACCATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD112346             [                                                                                                                                   GAAGCTCCGGTTATTTTACATGCGAAGAAGCTGAAGAGTATATCACTATTGGAACATTGAATGGCTTGTTTGTTTTGGGTCGATCAATCGGGTTTATTGGTCATTACCTGGATCAGAAACGTTTAAATCAAGGCTTGTATCGTCATCCATGGGAAGATATCTCTTATATGTTACCCAAATATCCATAGTCTATGTAAGACTGATATCTAAATTGGTCACTTCATTTATGAATTATTTAT AAAGTTTCTTACAAAACATCTTTTGCCATAATTATATATTCTTTTATGAATACTATTTAACTGATAATACGGTTGTGAGCATCATTGTTTTTCTATATTTACCATTCAATGTACTACTACTGTCATTATTATTTTTACTATTATCTGAAATAAACATCAATTTTATCGATTTTCGATTTATAATTTATCAGAACCATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD116059             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTATNTATAANAGTTTCTACCAAAACATCTTNTGCCATAATTATATATTCTTTTATGAATACTATTTAACTGATAATACGGTTGTGAGCATCATTGTCTTTCTATATTTACCATTCAATGTACTACTACTGTCATTATTATTTTTACTATTA CTGAAATAAACATCAATTTTATCGACTTTCGATTTATAATTTATCAGAACCATCTGTAGTTGATCGCAATGCATTTCATTTATCATTATCGATTTTTTCCTTTTAAATGATCATATCAAGATCATGTTCTTTTCGTGTTGGTTACATTGAATACTCTTCTTGTCAAGTATTTTTGATAATTCCGTGAAATCTGTCTTTTTTTAATGACCATTTTATTCATTAGTTCCCTTGGTTACTCGTATATGCATGTAAAATACACACATACACAAGTGTGTTTTTGCTAGTATTCTTTCAACATATTTCAAATGGTTGTGGTTTCTTTCAATGGTTGTGAATACTACTCACTACTACTACTACTATTTCTAGTAGTAATACTATTTAT                                 ]
[+] EMBL CD163465             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACTACTACTGTCATTATTATTTTTACTATTA CTGAAATAAACATCAATTTTATCGATTTTCGATTTATAATTTATCAGAACCATCTGTAGTTGATCGCAATGCATTTCATTTATCATTATCGATTTTTTCCTTTTAAATGATCATATCAAGATCATGTTCTTTTCGTGTTGGTTACATTGAATACTCTTCTTGTCAAGTATTTTTGATAATTCCGTGAAATCTGTCTTTTTTTAATGACCATTTTATTCATTAGTTCCCTTGGTTACTCGTATATGCATGTAAAATACACACATACACAAGTGTGTTTTTGCTAGTATTCTTTCAACATATTTCAAATGGTTGTGGTTTCTTTCAATGGTTGTGAATACTACTCACTACTACTACTACTATTTCTAGTAGTAATACTATTTATAATTATGCTACGTACACAGCGACAAAATGTTCT]




>consensus_7541#0
ACATGAACATTTTGTAGCAACTCCAGTCGTTGACTATGCACTTGAAGTTGAGAAAATTAC
CACTAATAAGCGTCCAAATTTAATTTTGAATGTTGATGGTATGATTGGTGTAGCCATGGT
AGATTTGTTAAGAAGCTCCGGTTATTTTACATGCGAAGAAGCTGAAGAGTATATCACTAT
TGGAACATTGAATGGCTTGTTTGTTTTGGGTCGATCAATCGGGTTTATTGGTCATTACCT
GGATCAGAAACGTTTAAATCAAGGCTTGTATCGTCATCCATGGGAAGATATCTCTTATAT
GTTACCCAAATATCCATAGTCTATGTAAGACTGATATCTAAATTGGTCACTTCATTTATG
AATTATTTATAAAAGTTTCTTACAAAACATCTTTTGCCATAATTATATATTCTTTTATGA
ATACTATTTAACTGATAATACGGTTGTGAGCATCATTGTTTTTCTATATTTACCATTCAA
TGTACTACTACTGTCATTATTATTTTTACTATTACTGAAATAAACATCAATTTTATCGAT
TTTCGATTTATAATTTATCAGAACCATCTGTAGTTGATCGCAATGCATTTCATTTATCAT
TATCGATTTTTTCCTTTTAAATGATCATATCAAGATCATGTTCTTTTCGTGTTGGTTACA
TTGAATACTCTTCTTGTCAAGTATTTTTGATAATTCCGTGAAATCTGTCTTTTTTTAATG
ACCATTTTATTCATTAGTTCCCTTGGTTACTCGTATATGCATGTAAAATACACACATACA
CAAGTGTGTTTTTGCTAGTATTCTTTCAACATATTTCAAATGGTTGTGGTTTCTTTCAAT
GGTTGTGAATACTACTCACTACTACTACTACTATTTCTAGTAGTAATACTATTTATAATT
ATGCTACGTACACAGCGACAAAATGTTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)