Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7555 cluster # 7555       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7555#0 length = 873 sequences # 5  

consensusID : consensus_7555#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 873
fasta sequence
                              [ATTCTGTAAATCCAAACTACCCATATCTACTTTAAATTGCTGGCATGAATTATTGCAAACGGACGCGGCTGTTGTAGCAGAAGTGGTAAGAATTTGTGTATTTGTCACTTTTATCGATGCTCTGCAAAAGTATCGCCGATCGCCGGCTGCTTGTTCGTTATCGATTGATAATGACCATGGTTATGATGGTGATTATGAAATAATTTAACTTGCTTGCTAGGTAAATATGATAATTTAGTCACAGGAACTGATGGTTTATAAATAGCCTGACCATCACCAGATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT-ACTTTAATTT-GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGTGCTTCTTAGCAGTAAACTCAGTACTGACACAATTAAATCGTAAACCAATAGTACATTTCGGATATTTCCATATACATAATATATCATCTGATGGAGTATTTTCTCTATCTAATTCTTCATAATCATTCGATCTTTTATAATCTACGTCTATGAGGTTTTCACCAGGGTGTGTTTGATGCCAGTTATCCCAATGCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCGAATCCATGTCTTGATAAATGTTATCTCCGGTGTTTTCGAGTTTAACTTAAGCTCATACGTTTGTCCTTGATTTAGGTAAGTTAAAGACGCTACACCTAATCGTGTAGCCGACGACGTTGGAGCTTTCAAAATGTTATCAAACAAATGAGAGTTTGTATCAGCCATCGAGACAAAAGTATTAGCAACAGTCTGTGCC]

[+] EMBL CD187933             [ATTCTGTAAATCCAAACTACCCATATCTACTTTAAATTGCTGGCATGAATTATTGCAAACGGACGCGGCTGTTGTAGCAGAAGTGGTAAGAATTTGTGTATTTGTCACTTTTATCGATGCTCTGCAAAAGTATCGCCGATCGCCGGCTGCTTGTTCGTTATCGATTGATAATGACCATGGTTATGATGGTGATTATGAAATAATTTAACTTGCTTGCTAGGTAAATATGATAATTTAGTCACAGGAACTGATGGTTTATAAATAGCCTGACCATCACCAGATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT ACTATAATTT GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGT CTTCTcg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD124654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT ACTTTAATTT GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGTGCTTCTTAGCAGTAAACTCAGTACTGACACAATTAAATCGTAAACCAATAGTACATTTCGGATATTTCCATATACATAATATATCATCTGATGGAGTATTTTCTCTATCTAATTCTTCATAATCATTCGATCTTTTATAATCTACGTCTATGAGGTTTTCACCAGGGTGTGTTTGATGCCAGTTATCCCAATGCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCG                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD124663             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAAT ACTTTAATTT GACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGAATTCCTTTTTCACCACCGTGCTTCTTAGCAGTAAACTCAGTACTGACACAATTAAATCGTAAACCAATAGTACATTTCGGATATTTCCATATACATAATATATCATCTGATGGAGTATTTTCACTATCTAATTCTTCATAATCATTCGATCTTTTATAATCTACGTCTATGAGGTTTTCACCAGGGTGTGTTTGATGCCAGTTATCCCAATGCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCG                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD124649             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTACGTTCTATTCTTTCTCGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTTATTTTAAATAACTTTAATTTNGACAAGCGAATGAGCCCAAATGTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD180676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GATGCCAGTTATCCCAATCCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTGTCATAGAAAGTAACTCGAATCCATGTCTTGATAAATGTTATCTCCGGTGTTTTCGAGTTTAACTTAAGCTCATACGTTTGTCCTTGATTTAGGTAAGTTAAAGACGCTACACCTAATCGTGTAGCCGACGACGTTGGAGCTTTCAAAATGTTATCAAACAAATGAGAGTTTGTATCAGCCATCGAGACAAAAGTATTAGCAACAGTCTGTGCC]


>consensus_7555#0 ATTCTGTAAATCCAAACTACCCATATCTACTTTAAATTGCTGGCATGAATTATTGCAAAC GGACGCGGCTGTTGTAGCAGAAGTGGTAAGAATTTGTGTATTTGTCACTTTTATCGATGC TCTGCAAAAGTATCGCCGATCGCCGGCTGCTTGTTCGTTATCGATTGATAATGACCATGG TTATGATGGTGATTATGAAATAATTTAACTTGCTTGCTAGGTAAATATGATAATTTAGTC ACAGGAACTGATGGTTTATAAATAGCCTGACCATCACCAGATTTACGTTCTATTCTTTCT CGATCTGTTTTATGCTTACGATCAGCTCCTTTCATTTTAAATACTTTAATTTGACAAGCG AATGAGCCCAAATGTTGGTTAGTATCATATTCAAAATGTTCTACCCGAAATCGAAAAGGA ATTCCTTTTTCACCACCGTGCTTCTTAGCAGTAAACTCAGTACTGACACAATTAAATCGT AAACCAATAGTACATTTCGGATATTTCCATATACATAATATATCATCTGATGGAGTATTT TCTCTATCTAATTCTTCATAATCATTCGATCTTTTATAATCTACGTCTATGAGGTTTTCA CCAGGGTGTGTTTGATGCCAGTTATCCCAATGCTCGTGTTCATTTAATTCCATCTGTTTG TCATAGAAAGTAACTCGAATCCATGTCTTGATAAATGTTATCTCCGGTGTTTTCGAGTTT AACTTAAGCTCATACGTTTGTCCTTGATTTAGGTAAGTTAAAGACGCTACACCTAATCGT GTAGCCGACGACGTTGGAGCTTTCAAAATGTTATCAAACAAATGAGAGTTTGTATCAGCC ATCGAGACAAAAGTATTAGCAACAGTCTGTGCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)